Characteristics of micorsatellites and genetic structure of wild Channa maculata
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摘要:
斑鳢 (Channa maculata) 是华南地区的本土经济鱼类,也是杂交鳢的亲本之一。养殖个体逃逸可能会对野生种群产生影响,存在种质混杂的风险,亟须开展野生资源的遗传背景分析。该研究分析了斑鳢基因组中微卫星标记的分布特征,筛选获得20个多态性位点构建多重PCR体系,对广州、化州、江华、南宁、阳江和邵武6个野生群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示,6个野生群体各位点的等位基因 (Na) 为3~28、有效等位基因 (Ne) 为1.28~14.88、观测杂合度 (Ho) 为0.10~1.00、期望杂合度 (He) 为0.14~0.95以及多态信息含量 (PIC) 为0.13~0.95。UPGAM系统进化树结果显示,化州和福建种群遗传关系最近,化州和江华种群遗传关系最远。该研究结果将为斑鳢的遗传监测和亲缘关系鉴定提供技术支持,为斑鳢种质资源养护及管理提供参考。
Abstract:Channa maculata is not only an indigenous economic fish in South China but also a parent species of cultured hybrid snakehead. Escape of the bred individuals may have impacts on wild populations, which makes genetic background analysis of wild resources an urgently need. This study analyzed the distribution characteristics of microsatellite markers in genome of C. maculata, and developed 20 polymorphic loci to analyze the genetic diversity and genetic structure of six wild populations named as Guangzhou, Huazhou, Jianghua, Nanning, Yangjiang and Shaowu populations. The results show that the number of alleles (Na) of the six wild populations was 3−28; the number of effective alleles (Ne) was 1.28−14.88; the observed heterozygosity (Ho) was 0.10−1.00; the expected heterozygosity (He) was 0.14−0.95; the polymorphic information content (PIC) was 0.13−0.95. The UPGAM dendrogram indicates that the genetic relationship between Huazhou and Fujian populations was the closest, but that between Huazhou and Jianghua populations was the farthest. This study provides basis for the conservation and management of germplasm resources of C. maculata.
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Keywords:
- Channa maculata /
- Genetic structure /
- Microsatellite marker /
- Wild population
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方斑东风螺 (Babylonia areolata),隶属于软体动物门、腹足纲、新腹足目、蛾螺科、东风螺属,是一种经济价值较高的浅海底栖贝类,主要分布于东南亚、日本以及我国东南沿海地区[1-3]。方斑东风螺因贝壳上具有漂亮的方形斑纹又被称为“花螺”,其味道鲜甜、肉质紧实有嚼劲,被誉为21世纪最具开发前景的养殖良种之一[4-5]。近年来,东风螺养殖产业发展迅速,养殖规模进一步扩大[6]。随着人们生活水平的不断提高,在追求产量的同时,对螺的品质和外观也提出了更高的要求,清晰而明艳的方形斑纹更受消费者青睐。
在水产动物健康养殖过程中,为水产动物提供适宜的栖息环境,不仅可以减少环境应激反应,对提高养殖成活率、增加养殖效益也具有重要意义[7]。环境与生物是相互适应的,底质类型往往对潜沙型生物的生长、存活和生理状态产生更强的影响[8]。已有研究表明,双壳贝类Mysella vitrea、Telline deltoidalis和Timoclea scabra在砂质环境中的生长情况更好[9-10];管角螺 (Hemifusus tuba Gemlin) 在泥沙质或无底质环境中的生长率较高,而在沙质中较差[11];缢蛏 (Sinonovacula constricta) 稚贝在砂或掺有贝壳的泥质砂中的成活率较高[12];青蛤 (Cyclina sinensis) 在泥沙质中生长较好[13]。而对于水泥池养殖的东风螺,相较于无砂环境,铺砂更利于其存活,且底质中含泥量在10%以内对东风螺无显著影响[14]。除了不同的底质材质,水环境的颜色对水生生物生长也有显著影响。三疣梭子蟹 (Portunus trituberculatus) 在红色或黄色环境下,成活率较高,生长较快[15];而河鲈(Perca fluviatilis) 则是在浅色环境下生长较快[16];红螯螯虾 (Cherax quadricarinatus) 在人工调配的蓝色水体中,成活率较高,生长较快,体色有较高的观赏价值[17]。可见,底质环境对水产动物的影响是多方面的[18-19],可以通过改变养殖底质环境达到促进生长和改善外观的目的。
当前方斑东风螺的养殖底质多为砂砾[3],在养殖过程中需要经常洗砂和换砂,不仅导致生产效率低下,还增加了养殖风险。陶粒为目前工厂化养殖的常用人工材料,由陶土烧制而成,具有质量轻、多气孔、比表面积及孔隙率大、含氧量高、可培育硝化细菌等特点,具有广阔的应用前景[20-22]。本文以河砂为对照组,选择4种不同颜色的陶粒底质 (棕色、黑色、黄色和白色) 开展为期30 d的养殖对比实验,研究不同底质类型及颜色对方斑东风螺稚螺生长、壳色及抗氧化能力的影响,探讨其较适宜的养殖底质,以期筛选出传统河砂的替代物,为新型工厂化循环水养殖模式探索、东风螺健康养殖和壳色调控提供理论依据和技术支持。
1. 材料与方法
1.1 实验材料
实验于2022年1—2月在海南省琼海市海洋与渔业科学院科研基地进行,方斑东风螺稚螺由海南省文昌市坤田水产有限公司提供,在养殖系统中暂养7 d后,选取大小均匀、潜沙正常、活力较好的稚螺作为实验材料,其平均壳高、壳宽和体质量分别为 (10.40 ± 0.39) mm、(6.90±0.27) mm和 (0.231±0.020) g。
河砂购自淘宝城固山货特产店,棕色、黑色、黄色、白色陶粒均购自淘宝灵寿县磊诚矿产品加工厂,粒径均为1 mm。
1.2 实验设计与养殖管理
实验设置河砂、棕色陶粒、黑色陶粒、黄色陶粒、白色陶粒共5个实验组,各实验组分别设置3个平行组,每个平行组放置100粒实验稚螺,底质厚度控制为2.5 cm,实验周期为30 d。
实验采用微流水养殖系统[23],使用经沉淀、沙滤及滤袋过滤后的新鲜海水 (盐度29‰),控制水位高度30 cm,水温在 (24.3±1.6) ℃,盐度稳定在29‰,pH介于8~8.1,养殖系统24 h连续充氧并保证水体溶解氧质量浓度>7.0 mg·L−1,每个处理组养殖水体的面积为0.48 m2,流速为70 L·h−1。每天早上 (8:00) 投喂剪碎的新鲜牡蛎肉,日投喂量为体质量的25%,每天投喂1次。
1.3 样品的采集与处理
1.3.1 动物组织样品处理
实验结束时,从每个处理组3个重复中各取15粒螺,称量后去壳取完整软体组织,混合后按质量 (g)∶体积 (mL) 为 1∶9加入生理盐水,机械匀浆,3 000 r·min−1离心10 min,取上清液于−80 ℃冰箱储藏,用于后续抗氧化酶活性测定。
1.3.2 底质样品处理
实验结束时,在每个处理组3个重复中各称取新鲜底质10 g (精确至0.1 g),混合后放入三角瓶中,加入100 mL 2 mol· L−1氯化钾 (KCl) 溶液,放入摇床常温下振荡30 min,立即过滤至水样瓶中用于底质氨氮 (NH4 +-N) 含量的测定。每组3个重复中各称取新鲜底质10 g,混合后放入三角瓶中,加入0.1 g硫酸钙 (CaSO4) 和50 mL水,放入摇床常温下振荡10 min,静置5 min后,上清液过滤用于底砂亚硝酸盐 (NO2 −-N) 含量的测定。
1.4 检测指标与计算
1.4.1 底质指标的检测
对底质样品进行 NH4 +-N 和 NO2 −-N 含量分析 (SmartChem-140化学分析仪)。NH4 +-N 和 NO2 −-N 的测定分别采用靛酚蓝法和重氮耦合法。
1.4.2 生长指标及成活率
实验结束后,每个处理组的3个重复各随机挑选30粒螺用于生长指标的测定。使用游标卡尺对样品进行壳高 (SH) 和壳宽 (SW) 的测量 (图1),用分析天平进行体质量的称量。
成活率按下列公式计算:
$$ R_{\mathrm{s}}= N_t / N_1\times 100 {\text{%}}$$ (1) 式中:Rs为成活率(%);N1和Nt分别为实验开始时和结束后的成活个数。
1.4.3 外壳颜色指标检测
实验结束后,在每个处理组3个重复中各挑选30粒螺进行拍照,用于后期壳色分析。壳色测定采用图片分析法[17],在摄影箱 (22 cm×22 cm×22 cm) 上方8 cm处对稚螺进行拍摄,随后采用Adobe Photoshop CS3软件测量不同实验组稚螺整个壳部的CIE (1976)-Lab表色系参数。颜色参数换算公式如下:
$$ L^*=(L / 255) \times 100 $$ (2) $$ a^*=(240 a / 255) \times 120 $$ (3) $$ b^*=(240 b / 255) \times 120 $$ (4) 式中:L、a、b是通过Adobe Photoshop CS3软件获得的图片颜色参数直接数值。L*代表明度;a*表示红度,表示从绿到红的变化,数值介于−120~120;b*代表黄度,表示从蓝到黄的变化,数值介于−120~120。
1.4.4 组织抗氧化能力及膜脂过氧化物含量的检测
采用南京建成生物科技有限公司的生化试剂盒进行总抗氧化能力 (T-AOC)、超氧化物歧化酶 (SOD)、过氧化氢酶 (CAT) 活性及丙二醛 (MDA) 含量的测定,操作方法严格按照说明书进行。
1.5 数据处理
实验数据均以“平均值±标准差 (
$\bar x $ ±s)”表示,所有数据采用DPS 14.5软件进行数据处理,采用单因素方差分析 (One-way ANOVA) 对各实验组进行显著性检验, 利用Turkey法进行多重比较,以0.05为显著性阈值。2. 结果
2.1 不同底质的氨氮和亚硝酸盐含量分析
实验结束后,不同底质下的NH4 +-N和NO2 −-N质量浓度存在差异 (图2)。黄色和白色陶粒组的NH4 +-N、NO2 −-N质量浓度分别为 (0.234±0.008)、(0.029±0.000) mg·L−1和 (0.225±0.014)、(0.029±0.001) mg·L−1,均显著低于其他实验组 (P<0.05);河砂组中NH4 +-N质量浓度最高 [(0.382±0.010) mg·L−1],显著高于4种颜色的陶粒组 (P<0.05);黄色和白色陶粒组间无显著性差异 (P>0.05)。
2.2 不同底质环境下的成活率
不同底质环境显著影响方斑东风螺稚螺的成活率 (图3,P<0.05)。黄色和白色陶粒组稚螺的成活率显著低于河砂组、棕色和黑色陶粒组 (P<0.05),而棕色和黑色陶粒组稚螺的成活率显著高于河砂组 (P<0.05)。实验结束时,棕色陶粒组的成活率最高 [(62.00±2.00)%],白色陶粒组最低 [(42.50±3.00)%],且各实验组的成活率均小于65%。
2.3 不同底质环境下的生长情况
随着养殖时间的推移,养殖在不同底质环境中的稚螺在壳高、壳宽、体质量等生长指标上表现出差异 (图4)。实验结束时,河砂组稚螺的壳高、壳宽、体质量分别为 (14.22±0.03) mm、(9.37±0.04) mm、(0.541±0.022) g,显著高于黑色、黄色和白色陶粒组 (P<0.05),但与棕色陶粒组之间无显著性差异 (P>0.05);白色陶粒组稚螺平均体质量最小,仅 (0.427±0.024) g。
2.4 不同底质环境下的壳色分析
不同底质环境会显著影响方斑东风螺稚螺的壳色 (图5)。各实验组稚螺壳的L*、a*和b*具有一致的规律性;棕色陶粒组的L*、a*、b*最高,分别为45.86±0.11、7.38±0.12、26.53±0.01,显著高于其他组 (P<0.05);黑色陶粒组方斑东风螺的L*、a*、b*次之,分别为43.67±0.32、7.09±0.06、24.35±0.32,显著高于河砂组、黄色和白色陶粒组 (P<0.05);而河砂组、黄色和白色陶粒组的L*、a*、b*无显著性差异 (P>0.05)。
2.5 抗氧化酶活性和膜脂过氧化物含量分析
不同底质环境下稚螺抗氧化酶活性和膜脂过氧化物含量见图6。各组间稚螺的总抗氧能力存在显著性差异(图6-a,P<0.05),由高到低分别为:棕色陶粒组[(0.297±0.009) mmol·g−1]>黑色陶粒组[(0.246±0.004) mmol·g−1]>河砂组[(0.220±0.007) mmol·g−1]>黄色陶粒组[(0.168±0.004) mmol·g−1]>白色陶粒组 [(0.141±0.002) mmol·g−1]。
对CAT活性的影响见图6-b,白色陶粒组稚螺的CAT活性为 (30.864±0.623) U·mg−1,显著高于其他实验组;黄色陶粒组次之,显著高于另外3组;棕色陶粒组稚螺的CAT活性最低 [(12.614±0.378) U·mg−1],显著低于其他组 (P<0.05)。
黄色和白色陶粒组稚螺的SOD活性显著高于其他实验组 (P<0.05),其中河砂组的SOD活性最低 [(7.008±0.817) U·mg−1,图6-c]。
方斑东风螺稚螺膜脂过氧化物含量受底质环境影响显著 (图6-d),黄色和白色陶粒组稚螺MDA质量摩尔浓度分别为 (1.539±0.045) 和 (1.580±0.015) nmol·mg−1,显著高于其他3组 (P<0.05)。
3. 讨论
3.1 底质对养殖环境的影响
在养殖过程中,底质不仅是底栖贝类的栖息场所,还承担了大部分营养物质和有机物的沉积。饵料残渣、排泄物以及动物尸体倾向于在底部聚集。当沉积物超出了底质自身的承载量,这些有毒物质会被释放到养殖水体中,间接对养殖动物造成影响[24]。在水体中,NH4 +-N以NH4 + 和NH3的形式存在,NH3可直接进入细胞膜,破坏膜结构、影响蛋白质代谢,甚至造成DNA损伤[25]。在养殖水体和底质中,NH4 +-N与NO2 −-N是微生物利用含氮有机物进行硝化作用过程中产生的重要中间产物,其含量可作为判断养殖环境好坏的重要指标[26]。本研究发现,不同底质环境中NH4 +-N和NO2 −-N的含量存在差异,河砂组中NH4 +-N含量高,陶粒组中NH4 +-N含量低。这可能与陶粒多孔、比表面积大的结构有关[27],有利于硝化细菌的繁殖,且陶粒间空隙较大有利于底质中的水体流动、物质交换。已有研究表明,陶粒能有效去除NH4 +-N,去除率高达80% [28]。本实验棕色陶粒组的NO2 −-N含量与河砂组无显著性差异,黄色和白色陶粒组NH4 +-N含量较低,这可能与底质颜色影响养殖生物有关。在黄色和白色陶粒环境下,浅色或更透亮的环境使稚螺受到较强的环境胁迫,摄食减少,排泄量降低,从而导致NH4 +-N含量低。且在实验后期黄色和白色陶粒组稚螺成活个数较少,通过流水可以充分地将残饵与粪便排出养殖系统。Abed和Zeng[29]研究表明深色背景能够明显促进生物摄食,减轻生理压力,而浅色背景下 (白色) 锯缘青蟹 (Scylla serrata) 的成活率最低。
3.2 底质对方斑东风螺存活与生长的影响
方斑东风螺具有潜埋习性,对底质类型有一定要求,且长时间生活在底质中,受底质环境的影响久。而底质作为一种外界环境,与温度、盐度、溶解氧共同影响着水生生物的生长发育、基因表达、能量积累、物质代谢等各个方面,甚至威胁其生存[30-32]。一般而言,生物长期接受某种 (类) 不适刺激会导致其消耗大量能量用于抵御外界胁迫、维持内稳态和机体组织损伤修复,进而影响其生长[33-34]。在水产动物养殖过程中,为其提供适宜的栖息环境,有利于减少其因不适刺激而引起的能量消耗,从而促进其健康生长。本研究发现,不合适的底质不仅会加速方斑东风螺稚螺的死亡速率,同时也会降低存活个体的生长性能。在本实验条件下,棕色陶粒和河砂更利于方斑东风螺的成活与生长,而白色陶粒组生长最慢,成活率最低。究其原因可能是由于方斑东风螺为海洋底栖生物,浅色 (黄色和白色) 陶粒底质与东风螺自然栖息环境相差大,造成了较强的环境胁迫,使得稚螺处于应激状态,这可从浅色陶粒组的T-AOC较低,CAT、SOD、MDA较高得到证实。而这种对浅色陶粒底质环境的不适应使得稚螺长期处于应激状态,将更多的能量用于抵御外界的环境应激,导致其生长缓慢。而持续的胁迫使能量的重分配失衡[34],最终导致死亡,造成白色陶粒组的死亡率高。已有研究也得出相似结果,如底质环境较符合原来的生境时,利于管角螺生长[35];在黑色和红色背景环境下,红鳌螯虾成活率最高[36]。腹足类软体动物由于运动能力较差,日间通常埋栖于海底或躲藏于礁石中,避免被捕获[37-40],当养殖环境与其自然栖息地的环境差异较大时,其生理会受到较大影响,所以在养殖过程中应注意底质环境对方斑东风螺的影响。此外,本实验结束时方斑东风螺稚螺的成活率总体不高,主要由于实验在冬季进行 (1—2月),温度相对较低 [(24.3±1.6) ℃],导致成活率普遍不高,这与生产经验相符。方斑东风螺为热带种,刘永等[41]研究发现当水温超过26 ℃时,方斑东风螺的活力好、摄食快且摄食量大,生长速度也较快;当水温在24 ℃左右时,其摄食能力下降,活力也相对减弱,随着温度的下降,部分稚螺出现死亡。温度会影响生物的生长、存活、免疫、代谢等多个方面[32,34]。因此,在方斑东风螺养殖过程中底质与水质环境都应得到重视。
3.3 底质对方斑东风螺外观的影响
外观与色泽作为重要的经济性状,是影响消费者购买经济动物的重要评判标准之一[42-44]。漂亮的外观不仅给消费者带来视觉享受,还能显著提高其市场价值。贝类的壳色受遗传与环境调控,相较于生长发育、营养成分的影响,壳色变化与环境的关系更为紧密[45]。而L*、a*、b* 作为评价经济动物色泽最直观的重要指标,在水产动物的体色研究中得到广泛应用[46],如红螯螯虾[17],锦鲤 (Cyprinus carpio)[47]等。本研究利用L*、a*、b* 对不同底质条件下的壳色进行测定,发现棕色陶粒组养殖的稚螺贝壳更加鲜亮,其L*、a*、b* 均显著高于其他实验组。同时深色组 (河砂组、棕色和黑色陶粒组) 相较于浅色组,稚螺壳上斑点的颜色更深、更明显。这可能是在不同环境下,生物体倾向于选择与环境更相近的体色,从而在多变的环境下保存自己。Manriquez等[48]研究发现智利鲍 (Concholepas concholepas) 的壳色会随着个体生长不断趋同于周围环境的颜色;Siegenthaler等[19]发现褐虾 (Crangon crangon) 能够通过快速改变体色以适应周围环境;Stevens等[49]研究指出角眼沙蟹 (Ocypode ceratophthalmus) 会根据每天色彩的变化节奏来调整在沙滩上的伪装。同样,在方斑东风螺的养殖过程中,可以通过改变底质颜色来培育特定壳色,以提高其经济价值。
3.4 不同底质对方斑东风螺抗氧化性能的影响
T-AOC是机体内抗氧化能力的总体体现[50],是酶促和非酶促因子抗氧化能力的总合。本研究发现棕色陶粒组的T-AOC最高,表明在该养殖环境下稚螺具有更强的抗氧化能力。而CAT、SOD是机体内重要的抗氧化酶,CAT和SOD的协同作用可维持自由基的动态平衡,进而减少机体的氧化损伤[51]。SOD活性间接反映了机体清除活性氧自由基的能力,它能够让活性氧发生歧化,生成过氧化氢 (H2O2) 和氧气 (O2) [52],而CAT能催化H2O2生成水 (H2O)和O2。因此CAT、SOD活性的变化在一定程度上能反映出机体在环境胁迫下抗氧化系统的变化[53]。本研究中,棕色陶粒组的CAT、SOD较低,表明在该养殖环境中东风螺的应激反应较小。MDA是脂质过氧化物分解后的重要产物,是研究脂质过氧化作用的重要生物标志物,也可间接反映细胞的受损程度,其测定常与SOD和CAT测定配合使用[54]。MDA的检测结果同样显示棕色陶粒组的水平较低,细胞受损程度较小,进一步证实该养殖环境对东风螺稚螺的影响较小。而浅色陶粒的底质环境中,T-AOC较低,CAT、SOD、MDA较高,均表明稚螺处于较强的应激状态。其原因可能是背景色对养殖生物的生理水平产生了影响,相似的结果在其他生物中也有发现,如红鳌螯虾在黑色环境下具有较高的生长速度和成活率[55];拟穴青蟹 (S. paramamosain) 在红色环境下产生更强的氧化应激[56];牙鲆 (Paralichthys olivaceus) 在较亮的环境中皮质醇含量增加[57]。
4. 结论
本研究通过对不同底质条件下的底质环境指标、生长成活情况、壳色变化、抗氧化能力以及氧化损伤程度的检测,发现不同底质类型和颜色可显著影响方斑东风螺稚螺的生长、壳色及抗氧化能力。在以棕色陶粒为底质的养殖条件下稚螺的成活率最高,生长速度较快,壳色更为艳丽,底质NH4 +-N含量较低,总抗氧化能力最高,氧化损伤较低。可见,在生产中选择棕色陶粒作为方斑东风螺稚螺养殖底质替代河砂,具有广泛的应用前景。
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表 1 斑鳢采集位置及数量
Table 1 Sampling sites and quantity of C. maculata in this study
群体编号
Population No.采样地点
Sampling site经纬度
Coordinate所属江段 (水系)
Water system样本数量
Quantity of samples样本采集部位
Tissue of samples1 广州 GZ 112.25°E,23.06°N 河口 (珠江) 29 鳍条 2 化州 HZ 110.65°E,21.92°N 鉴江 30 鳍条 3 江华 JH 111.58°E,26.43°N 湘江 35 鳍条 4 南宁 NN 108.22°E,22.79°N 邕江 (珠江) 33 鳍条 5 阳江 YJ 111.78°E,22.26°N 漠阳江 41 鳍条 6 邵武 SW 117.49°E,27.34°N 闽江 28 鳍条 表 2 斑鳢基因组序列中不同重复单元微卫星分布情况
Table 2 Distribution of different types of SSR in genomic sequence
单元碱基数
Number of base重复类型
Type of repeatSSR数目
Number of SSR出现频率
Frequency/%平均分布频率
Average distribution frequency/kb1 2 187 962 49.76 3.34 2 4 139 672 26.30 4.49 3 10 20 272 14.26 20.27 4 31 6 059 7.29 103.46 5 66 1 094 2.40 573.01 表 3 斑鳢基因组序列中不同重复单元微卫星的出现频率
Table 3 Frequency of classified repeat types of SSR in genomic sequence of C. maculata
重复单元
Repeat unit重复次数 Repeat times 合计
Total5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 ≥21 A/T − − − − − 47 951 30 595 20 655 15 009 11 498 9 085 7 334 5 685 4 358 3 348 2 714 2 201 328 141 C/G − − − − − 4 830 3 552 2 415 1 320 737 462 365 288 214 183 154 97 167 999 AC/GT − 22 654 13 182 9 847 8 188 7 081 6 526 6 013 5 537 4 869 4 257 3 276 2 581 2 468 2 182 1 635 1 455 153 757 AG/CT − 7 028 3 756 2 298 1 487 1 043 838 637 583 524 424 351 280 293 265 211 183 52 034 AT/AT − 2 594 1 476 884 608 461 265 231 206 160 95 99 60 42 21 16 18 31 836 CG/CG − 171 83 20 11 3 − − − − − − − − − − − 24 620 AAC/GTT 1 261 599 314 200 132 84 50 21 25 11 11 5 6 2 3 3 − 24 463 AAG/CTT 816 303 181 105 68 54 33 30 24 14 9 9 12 6 9 3 2 21 742 AAT/ATT 2 464 1 134 652 424 357 297 239 231 198 148 125 80 53 50 34 38 22 20 065 ACC/GGT 478 203 106 66 33 20 8 2 − − − − − − − − − 13 711 ACG/CGT 22 12 4 − − 1 − − 1 − − − − − − − − 12 850 ACT/AGT 484 194 132 102 66 52 41 27 21 26 16 17 8 7 6 2 5 13 683 AGC/CTG 1 119 530 294 183 118 68 41 25 15 9 10 4 2 1 1 1 1 12 485 AGG/CCT 1 198 525 321 220 121 86 45 35 17 14 5 − 3 1 − − − 10 071 ATC/ATG 754 438 261 181 103 63 46 27 19 13 10 6 6 − 4 − − 7 496 CCG/CGG 59 14 3 1 1 − − − − − − − − − − − − 5 611 AAAC/GTTT 569 257 120 41 24 3 9 4 3 2 1 1 1 − 2 1 − 5 643 AAAG/CTTT 138 72 38 34 25 16 9 7 6 2 3 2 − − − − 1 4 975 AAAT/ATTT 896 315 102 35 9 4 3 − 1 1 − − − − − 3 − 4 624 AACC/GGTT 21 9 5 1 − 1 − − − − − − − − − − − 3 260 AACG/CGTT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 3 288 AACT/AGTT 38 13 6 8 1 3 2 2 − − − − − 1 − − − 3 315 AAGC/CTTG 4 − − 1 − − − − − 1 − − − − − − − 3 286 AAGG/CCTT 30 18 7 4 − − − − − − − − − − − − − 3 289 AAGT/ACTT 32 9 5 2 2 − 2 1 − − − − − 1 − − − 3 242 AATC/ATTG 88 40 30 17 13 11 3 3 2 − − 1 − − 1 − 1 3 192 AATG/ATTC 96 51 26 14 7 11 4 3 1 − 1 − − − − − − 3 000 AATT/AATT 43 11 9 − − 1 1 − − − − − − − − − − 2 797 ACAG/CTGT 160 63 36 11 5 5 4 1 2 2 − 1 1 − − − − 2 738 ACAT/ATGT 152 81 52 29 17 9 12 6 5 3 3 − 2 1 1 2 − 2 458 ACCC/GGGT 24 4 − − − − − − − − − − − − − − − 2 101 ACCG/CGGT − 3 − − − − − − − − − − − − − − − 2 076 ACCT/AGGT 13 5 1 − − − − 1 − − − − − − − − − 2 090 ACGC/CGTG 73 35 12 2 3 1 3 − − 1 − − 1 − − − − 2 071 ACGG/CCGT 5 1 − − − − − − − − − − − − − − − 1 941 ACGT/ACGT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 1 938 ACTC/AGTG 80 42 12 23 12 5 3 4 1 2 3 3 − 2 − − − 1 938 ACTG/AGTC 25 14 9 2 1 1 1 − − 1 1 − − − − − − 1 751 AGAT/ATCT 230 159 122 69 70 51 40 32 17 25 11 16 6 11 4 7 3 1 710 AGCC/CTGG 3 1 2 1 − 1 − − − − − − − − − − − 852 AGCG/CGCT 7 1 − − − − − − − − − − − − − − − 845 AGCT/AGCT 14 2 − − − − − − − − − − − − − − − 853 AGGC/CCTG 22 9 7 5 1 1 1 − − − − − − − − − − 838 AGGG/CCCT 65 33 10 1 1 − − − − − − − − − − − − 892 ATCC/ATGG 186 78 54 22 14 7 4 1 1 2 − − 1 − − − − 787 ATCG/ATCG 1 − − 1 − − − − − − − − − − − − − 429 ATGC/ATGC 2 1 2 − − − − − − − − − − − − − − 442 AAAAC/GTTTT 47 17 1 − − − − − − − − − − − − − − 474 AAAAG/CTTTT 15 3 4 − − 2 1 − 1 − 1 1 − − − − − 410 AAAAT/ATTTT 35 6 3 − − − − 1 − − − − − − − − − 404 AAACC/GGTTT 5 2 2 − − − − − − − − − − − − − − 361 AAACT/AGTTT 7 3 1 1 − − − − − − − − − − − − − 353 AAAGC/CTTTG 2 1 − − 1 − − − − − − − − − − − − 345 AAAGG/CCTTT 7 5 1 2 2 1 − − − − − − − − − − − 658 AAAGT/ACTTT 4 2 1 − 1 1 − − − − 1 1 − − − − − 644 AAATC/ATTTG 2 − 3 − 1 − − − − − − − − − − − − 634 AAATT/AATTT 8 − 1 − 2 − − − − − − − − − − − − 631 AACAC/GTGTT 7 8 − − − 1 − − − 1 1 − − − − − − 632 AACAG/CTGTT 3 − − − − − − − − − − − − − − − − 623 AACAT/ATGTT 9 3 4 − − − − 1 − − − − − − − − − 637 AACCC/GGGTT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 621 AACCT/AGGTT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 621 AACTG/AGTTC 3 − − − − − − − − − − − − − − − − 621 AACTT/AAGTT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 622 AAGAC/CTTGT − 1 1 − − 1 2 − − − − − − − − − − 627 AAGAG/CTCTT 8 1 1 2 − − 1 − − 1 − − − − − − − 623 AAGAT/ATCTT 7 2 4 1 − 1 − − − − − − − − − − − 611 AAGCC/CTTGG 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 598 AAGCT/AGCTT 13 2 − 1 − − − − − − − − − − − − − 598 AAGGT/ACCTT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 602 AAGTC/ACTTG 74 11 10 4 1 − − − − − − − − − − − − 602 AAGTG/ACTTC 3 2 − − − − − − − − − − − − − − − 506 AATAC/ATTGT 9 1 2 − − − − − − − − − − − − − − 503 AATAG/ATTCT 5 3 4 − 3 − − − − − − − − − − − − 492 AATAT/ATATT 19 10 2 1 − − 2 1 2 − − − − − − − − 493 AATCC/ATTGG 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 581 AATCT/AGATT 15 3 1 1 1 − 1 − − − − − − − − − − 583 AATGC/ATTGC 1 − − − 1 − − − − − − − − − − − − 564 AATGG/ATTCC − 1 − − − − − − − − − − − − − − − 563 AATGT/ACATT 4 − − − − − − − − − − − − − − − − 564 AATTC/AATTG 241 56 9 6 2 − − 2 1 − − − − − − − − 561 ACACC/GGTGT 2 1 1 − − − − − − − − − − − − − − 246 ACACG/CGTGT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 245 ACACT/AGTGT − 2 − 1 − − − − − − − − − − − − − 245 ACAGC/CTGTG 8 3 − 1 − − − − − − − − − − − − − 259 ACAGG/CCTGT 4 3 − − − 1 − − 1 − − − − − − − − 251 ACAGT/ACTGT 12 3 1 1 − − − − − − − − − − − − − 242 ACATC/ATGTG 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 225 ACATG/ATGTC − 1 − − − − − − − − − − − − − − − 224 ACCAG/CTGGT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 223 ACCAT/ATGGT − − 2 − 2 − − − − − − − − − − − − 222 ACCCC/GGGGT 5 1 − − − − − − − − − − − − − − − 218 ACCGG/CCGGT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 212 ACCTC/AGGTG 1 − 1 − − − − − − − − − − − − − − 211 ACGAG/CGTCT − 1 1 − − − − − − − − − − − − − − 209 ACGAT/ATCGT − − 1 − − − − − − − − − − − − − − 207 ACTAT/AGTAT 7 5 1 3 3 − − 1 − − − − − − − − − 206 ACTCC/AGTGG − 1 − − − − − − − − − − − − − − − 186 ACTCT/AGAGT 1 1 1 1 − − − − − − − − − − − − − 185 ACTGC/AGTGC 2 − − − − − − − − − − − − − − − − 181 ACTGG/AGTCC 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 179 AGAGC/CTCTG 13 3 − − − − − − − − − − − − − − − 178 AGAGG/CCTCT 42 29 7 5 8 12 3 12 4 2 − 1 − − − − − 162 AGATC/ATCTG 3 − − − − − − − − − − − − − − − − 37 AGATG/ATCTC 1 − − 1 − − 1 − − − − − − − − − − 34 AGCAT/ATGCT − 1 − − − − − − − − − − − − − − − 31 AGCCC/CTGGG − 2 − − − − − − − − − − − − − − − 30 AGCGG/CCGCT 1 − − − − − − − − − − − − − − − − 28 AGCTC/AGCTG 2 − − − − − − − − − − − − − − − − 27 AGGCC/CCTGG 1 − 2 − − − − − − − − − − − − − − 25 AGGGC/CCCTG − − − − − 1 − − − − − − − − − − − 22 AGGGG/CCCCT 12 2 2 1 − − − − − − − − − − − − − 21 ATATC/ATATG 3 − − − 1 − − − − − − − − − − − − 4 表 4 斑鳢微卫星位点相关信息
Table 4 Information of 20 microsatellite loci from C. maculata
多重PCR
Multiplex PCR位点
Locus引物序列 (5'−3')
Primer sequence简单重复单元
Repeat motif退火温度
Annealing temperature/℃荧光标记
Fluorescent labelMultiplex set 1 BCM83 F: TGAGAGATTTCCTGGGAGAATTA (ATA)33 60 FAM R: AACAGAACAAACACAGAAAAGGC BCM9 F: AACTGAACCTCATTCAGAACCAA (AC)32 61 PET R: CTATCACCCAGTAAACTGCATCC BCM94 F: TAAATTTAAATGCCACATGGGAG (AAAC)32 61 VIC R: GCAACCAAAAATGTAGGAGTCTG Multiplex set 2 BL-12 F: ACACCATAACAGTGACAA (TCTA)24 59 FAM R: GAGCAGAGTCAGTGTAGGTT BL-18 F: CCATACCTACCCAACCTG (GATA)25 59 PET R: CATCCTCATCCAGACCAT BL-19 F: ATCCATACCTACCCAACC (AGAT)22 60 VIC R: CATCCTCATCCAGACCAT Multiplex set 3 BCM90 F: ATATATTCCCATGCTGTTGTTGC (AC)32 61 FAM R: TTGTATTGTCAAAATTGTGTGCG BCM11 F: TGCAAAGCACGATAAGAACTACA (TAA)33 58 PET R: TATCAAAACTTGCTGCCAATAGC BL-4 F: AAAGAGGAGATTTCTGGAT (AGA)42 59 VIC R: CTGCCTGTTTGTCTGTCA Multiplex set 4 BCM97 F: CCCTCACTCTCTATCCAGTCCTT (AC)32 60 FAM R: GAGGGGAAATAGCCAGTGTAATG BL-24 F: TTGCCTTGTACTGACATT (TCTA)29 61 VIC R: CTCCCATAGTGCTCCGTG BL-33 F: TGACACTCACAGCCTCAG (ATCT)24 58 PET R: CACAACGTGGGATACAAT Multiplex set 5 BCM87 F: GTTTTTACCACAGCCAAAAACTG (GT)32 60 FAM R: CTGGAATACATTCGCTGTCTAGC BCM10 F: TTTGTTCTGGCAAACACTTTAGA (ATA)33 62 PET R: CTTTGGCCCAAGTAGTCATATTT Multiplex set 6 BCM95 F: CACATGCTCCCTATAGACAGTCC (AC)32 59 FAM R: TATGTGAGCCGGATGATAGAGTT BL-3 F: GATTGAACCACTCACCCT (GTA)40 61 PET R: GTAAGAAGCAGCATTGCA BL-21 F: TGACACTCACAGCCTCAG (ATCT)24 58 FAM R: CACAACGTGGGATACAAT Multiplex set 7 BCM91 F: CAAGAAGAAGACTGATACTGGGG (GT)32 59 FAM R: GATACAGGCATCCAAATTCTGAG BCM12 F: TGTAAAAGCAGCTATTCTTTGTTTC (TTA)33 60 PET R: CAACACTACCACCACCACAACTA BL-34 F: GGAAGAAGCTGTAAGAGG (AAAC)22 58 VIC R: AGTTGGCAATGGTGGAGA 表 5 6个斑鳢群体的多样性指数
Table 5 Genetic diversity indices of six C. maculata populations
位点
Locus指数
Index群体 Population 平均
Total广州 GZ 化州 HZ 江华 JH 南宁 NN 阳江 YJ 邵武 SW BCM83 Na 11 8 4 8 10 8 8.166 7 Ne 4.380 2 4.054 1 1.389 7 3.716 7 6.502 9 5.351 5 4.232 5 Ho 0.793 1 0.500 0 0.028 6 0.697 0 0.829 3 0.392 9 0.540 2 He 0.785 2 0.766 1 0.284 5 0.742 2 0.856 7 0.827 9 0.710 4 PIC 0.741 0 0.719 0 0.267 0 0.692 0 0.828 0 0.789 0 0.672 7 HWE 0.000 0 0.056 9 0.000 0 0.402 3 0.000 0 0.000 0 − BCM9 Na 5 13 8 15 9 8 9.666 7 Ne 2.248 7 7.058 8 3.319 8 8.126 9 2.333 1 4.639 1 4.621 1 Ho 0.551 7 0.633 3 0.057 1 0.666 7 0.487 8 0.250 0 0.441 1 He 0.565 0 0.872 9 0.708 9 0.890 4 0.578 4 0.798 7 0.735 7 PIC 0.524 0 0.844 0 0.655 0 0.866 0 0.550 0 0.751 0 0.698 3 HWE 0.000 0 0.034 6 0.000 0 0.002 0 0.000 0 0.000 0 − BL-12 Na 8 17 8 9 21 11 12.333 3 Ne 2.624 0 13.235 3 2.608 4 3.882 4 11.940 3 7.009 6 6.883 3 Ho 0.413 8 0.633 3 0.484 8 0.818 2 0.850 0 0.555 6 0.626 0 He 0.629 8 0.940 1 0.626 1 0.753 8 0.927 8 0.873 5 0.791 9 PIC 0.580 0 0.919 0 0.552 0 0.715 0 0.911 0 0.843 0 0.753 3 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.231 8 0.000 0 0.000 0 − BL-18 Na 6 15 4 11 14 12 10.333 3 Ne 4.805 7 9.556 8 2.688 9 3.067 6 7.837 3 8.615 4 6.095 3 Ho 0.965 5 0.724 1 0.787 9 0.606 1 0.764 7 0.321 4 0.695 0 He 0.805 8 0.911 1 0.637 8 0.684 4 0.885 4 0.900 0 0.804 1 PIC 0.760 0 0.887 0 0.555 0 0.656 0 0.860 0 0.873 0 0.765 2 HWE 0.005 8 0.000 0 0.000 0 0.000 1 0.000 0 0.000 0 − BL-19 Na 6 16 4 11 16 12 10.833 3 Ne 4.805 7 9.523 8 2.688 9 3.071 9 7.305 9 8.209 4 5.934 3 Ho 0.965 5 0.666 7 0.787 9 0.575 8 0.700 0 0.285 7 0.663 6 He 0.805 8 0.910 2 0.637 8 0.684 8 0.874 1 0.894 2 0.801 2 PIC 0.760 0 0.887 0 0.555 0 0.657 0 0.850 0 0.867 0 0.762 7 HWE 0.005 8 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 − BCM90 Na 4 9 5 6 6 6 6.000 0 Ne 2.345 9 5.056 2 2.411 4 1.716 7 2.614 3 3.359 4 2.917 3 Ho 0.586 2 0.766 7 0.514 3 0.375 0 0.487 8 0.703 7 0.572 3 He 0.583 8 0.815 8 0.593 8 0.424 1 0.625 1 0.715 6 0.626 4 PIC 0.484 0 0.775 0 0.535 0 0.395 0 0.549 0 0.655 0 0.565 5 HWE 0.364 7 0.245 4 0.000 0 0.001 7 0.506 0 0.616 0 − BCM11 Na 9 16 8 14 14 18 13.166 7 Ne 7.218 9 11.612 9 1.354 3 7.920 0 6.146 3 9.467 5 7.286 7 Ho 0.931 0 0.866 7 0.142 9 0.969 7 0.926 8 0.888 9 0.787 7 He 0.876 6 0.929 4 0.265 4 0.887 2 0.847 6 0.911 3 0.786 3 PIC 0.846 0 0.907 0 0.256 0 0.862 0 0.819 0 0.886 0 0.762 7 HWE 0.002 5 0.296 9 0.000 0 0.931 0 0.000 0 0.478 9 − BL-4 Na 9 24 11 22 28 17 18.500 0 Ne 3.706 9 15.929 2 7.538 5 13.212 9 9.261 7 12.255 3 10.317 4 Ho 0.428 6 0.533 3 0.142 9 0.593 8 0.463 4 0.333 3 0.415 9 He 0.743 5 0.953 1 0.899 5 0.939 0 0.903 0 0.937 9 0.896 0 PIC 0.706 0 0.942 0 0.855 0 0.947 0 0.887 0 0.913 0 0.875 0 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 − BCM97 Na 6 9 5 7 11 9 7.833 3 Ne 3.985 8 4.663 2 1.284 2 2.722 5 5.766 7 5.444 4 3.977 8 Ho 1.000 0 0.633 3 0.151 5 0.575 8 0.829 3 0.857 1 0.674 5 He 0.762 3 0.798 9 0.224 7 0.642 4 0.836 8 0.831 2 0.682 7 PIC 0.714 0 0.762 0 0.211 0 0.573 0 0.809 0 0.792 0 0.643 5 HWE 0.000 1 0.197 4 0.000 0 0.000 0 0.011 9 0.108 5 − BL-24 Na 10 16 5 12 14 8 10.833 3 Ne 4.792 0 9.045 2 1.976 8 9.151 3 5.520 2 5.807 4 6.048 8 Ho 0.724 1 0.500 0 0.000 0 0.848 5 0.702 7 0.321 4 0.516 1 He 0.805 2 0.904 5 0.502 0 0.904 4 0.830 1 0.842 9 0.798 2 PIC 0.763 0 0.880 0 0.462 0 0.881 0 0.804 0 0.805 0 0.765 8 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.215 7 0.000 0 0.000 0 − BL-33 Na 8 21 8 11 14 16 13.000 0 Ne 4.847 3 14.754 1 2.927 1 2.773 4 3.705 2 8.166 7 6.195 6 Ho 0.689 7 0.700 0 0.428 6 0.322 6 0.435 9 0.607 1 0.530 7 He 0.807 6 0.948 0 0.667 9 0.649 9 0.739 6 0.893 5 0.784 4 PIC 0.765 0 0.928 0 0.622 0 0.623 0 0.693 0 0.867 0 0.749 7 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.003 1 − BCM87 Na 8 9 5 9 10 9 8.333 3 Ne 4.072 6 4.422 6 1.436 1 4.204 6 5.345 0 5.333 3 4.135 7 Ho 0.724 1 0.466 7 0.000 0 0.606 1 0.829 3 0.535 7 0.527 0 He 0.767 7 0.787 0 0.308 1 0.773 9 0.822 9 0.827 3 0.714 5 PIC 0.725 0 0.750 0 0.290 0 0.732 0 0.791 0 0.788 0 0.679 3 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 1 0.000 0 0.000 0 − BCM10 Na 6 17 9 12 15 10 11.500 0 Ne 3.689 4 10.526 3 4.702 5 5.613 4 9.391 1 6.400 0 6.720 5 Ho 0.714 3 0.700 0 0.600 0 0.697 0 0.634 1 0.250 0 0.599 2 He 0.742 2 0.920 3 0.798 8 0.834 5 0.904 5 0.859 1 0.843 2 PIC 0.680 0 0.898 0 0.758 0 0.804 0 0.884 0 0.825 0 0.808 2 HWE 0.000 0 0.000 1 0.000 0 0.015 6 0.000 0 0.000 0 − BCM95 Na 9 21 8 14 13 15 13.333 3 Ne 5.339 7 13.235 3 2.110 2 11.000 0 6.331 5 7.466 7 7.580 6 Ho 0.724 1 0.633 3 0.200 0 0.757 6 0.756 1 0.607 1 0.613 0 He 0.827 0 0.940 1 0.533 7 0.923 1 0.852 5 0.881 8 0.826 4 PIC 0.789 0 0.920 0 0.505 0 0.902 0 0.825 0 0.853 0 0.799 0 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.029 9 0.000 0 0.000 0 − BL-3 Na 9 14 10 19 18 14 14.000 0 Ne 3.112 8 10.055 2 1.784 4 14.222 2 10.568 8 9.49 02 8.205 6 Ho 0.150 0 0.333 3 0.171 4 0.458 3 0.208 3 0.409 1 0.288 4 He 0.696 2 0.917 5 0.446 0 0.949 5 0.924 6 0.915 4 0.808 2 PIC 0.653 0 0.892 0 0.430 0 0.925 0 0.898 0 0.886 0 0.780 7 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 − BL-21 Na 11 21 7 11 15 17 13.666 7 Ne 5.360 3 14.876 0 2.822 6 2.998 2 4.224 1 9.286 6 6.594 6 Ho 0.629 6 0.666 7 0.514 3 0.275 9 0.542 9 0.925 9 0.592 6 He 0.828 8 0.948 6 0.655 1 0.678 2 0.774 3 0.909 2 0.799 0 PIC 0.791 0 0.929 0 0.602 0 0.648 0 0.737 0 0.883 0 0.765 0 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.120 0 − BCM91 Na 8 6 3 8 8 7 6.666 7 Ne 1.783 7 2.125 1 1.155 1 2.550 4 3.379 1 4.215 1 2.534 8 Ho 0.103 4 0.333 3 0.028 6 0.363 6 0.450 0 0.107 1 0.231 0 He 0.447 1 0.538 4 0.136 2 0.617 2 0.713 0 0.776 6 0.538 1 PIC 0.427 0 0.506 0 0.128 0 0.567 0 0.654 0 0.733 0 0.502 5 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 − BCM12 Na 11 21 7 11 15 17 13.666 7 Ne 5.360 3 14.876 0 2.822 6 2.998 2 4.224 1 9.286 6 6.594 6 Ho 0.629 6 0.666 7 0.514 3 0.275 9 0.542 9 0.925 9 0.592 6 He 0.828 8 0.948 6 0.655 1 0.678 2 0.774 3 0.909 2 0.799 0 PIC 0.791 0 0.929 0 0.602 0 0.648 0 0.737 0 0.883 0 0.765 0 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.120 0 − BL-34 Na 6 11 5 8 11 8 8.166 7 Ne 2.805 0 7.409 7 1.407 2 6.135 2 6.387 2 5.695 3 4.9733 Ho 0.892 9 0.689 7 0.029 4 0.787 9 0.800 0 0.259 3 0.576 5 He 0.655 2 0.880 2 0.293 7 0.849 9 0.854 1 0.840 0 0.728 9 PIC 0.576 0 0.850 0 0.278 0 0.817 0 0.827 0 0.802 0 0.691 7 HWE 0.000 0 0.000 0 0.000 0 0.087 2 0.000 0 0.000 0 − BCM94 Na 3 12 4 5 7 3 5.666 7 Ne 2.326 4 6.766 9 2.117 5 2.472 2 4.650 1 2.217 8 3.425 2 Ho 0.620 7 0.633 3 0.171 4 0.333 3 0.634 1 0.107 1 0.416 7 He 0.580 2 0.866 7 0.535 4 0.604 7 0.794 6 0.559 1 0.656 8 PIC 0.507 0 0.837 0 0.492 0 0.545 0 0.754 0 0.475 0 0.601 7 HWE 0.006 0 0.005 6 0.000 0 0.000 0 0.000 9 0.000 0 − 注:Na. 等位基因;Ne. 有效等位基因;Ho. 观测杂合度;He. 期望杂合度;PIC. 多态信息含量;HWE. Hardy-Weinberg平衡偏离常数 Note: Na. Number of alleles; Ne. Effective number of alleles; Ho. Observed heterozygosity; He. Expected heterozygosity; PIC. Polymorphism Information Content; HWE. Hardy-Weinberg 表 6 6个斑鳢群体间的遗传距离
Table 6 Genetic distance among six C. maculata populations
群体
Population广州
GZ化州
HZ江华
JH南宁
NN阳江
YJ邵武
SW广州 GZ 化州 HZ 0.117 69 江华 JH 0.476 72 0.268 98 南宁 NN 0.153 89 0.079 37 0.402 79 阳江 YJ 0.120 51 0.067 34 0.361 52 0.106 18 邵武 SW 0.154 59 0.065 88 0.399 60 0.114 65 0.066 38 表 7 6个斑鳢群体的遗传分化系数 (FST,对角线下) 和基因流 (Nm,对角线上)
Table 7 Gene differentiation (FST, above the diagonal) and gene flow indices (Nm, below the diagonal) among six C. maculata populations
群体
Population广州
GZ化州
HZ江华
JH南宁
NN阳江
YJ邵武
SW广州 GZ − 2.124 4 0.524 4 1.624 5 2.074 5 1.617 2 化州 HZ 0.105 3 − 0.929 4 3.150 0 3.712 6 3.794 7 江华 JH 0.322 8 0.212 0 − 0.620 7 0.691 5 0.625 6 南宁 NN 0.133 4 0.073 5 0.287 1 − 2.354 7 2.180 7 阳江 YJ 0.107 6 0.063 1 0.265 5 0.096 0 − 3.766 1 邵武 SW 0.133 9 0.061 8 0.285 5 0.102 9 0.062 3 − 注:Nm=0.25 (1−FST)/FST,下表同此 Note: The same below 表 8 6个斑鳢群体的AMOVA分析
Table 8 Analysis on molecular variance (AMOVA) of six C. maculata populations
变异来源
Source of variation平方和
Sum of squares变异组分
Variance component变异百分比
Variation percentage/
%群体间 Among populations 460.645 1.347 32 15.18 群体内 Within populations 2 796.240 7.529 68 84.82 合计 Total 3 256.884 8.877 00 − -
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期刊类型引用(2)
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