大口黑鲈<i>HSC</i>70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析

李胜杰; 樊佳佳; 姜鹏; 白俊杰; 孙建国; 吴建开; 费志平

doi:10.12131/20180086

大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析

1.
中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广东广州 510380
2.
南京帅丰饲料有限公司，江苏南京 201306
3.
湖州湖旺水产种业有限公司，浙江湖州 313000

基金项目: 渔港建设和渔业产业发展专项 (A201601A12)；中国水产科学研究院基本科研业务费（2016HY-ZC0403）；浙江省农业 (水产) 新品种选育重大科技专项(2016C02055-3)

详细信息

作者简介:
李胜杰(1981 — )，男，博士，副研究员，从事遗传育种研究。E-mail: ssjjli@163.com

中图分类号: S 917.4
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出版历程
- 收稿日期: 2018-05-06
- 修回日期: 2018-06-16
- 网络出版日期: 2018-12-05
- 刊出日期: 2018-12-04

Association analysis of SNPs and diplotype of HSC70-1 gene with growth traits in largemouth bass (Micropterus salmoides)

1.
Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fishery Resource Application and Cultivation, Ministry of Agriculture and Rural Affairs; Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510380, China
2.
Nanjing Shuaifeng Feed Co., Ltd., Nanjing 201306, China
3.
Huzhou Huwan Aquaculture Seed Industry Co., Ltd., Huzhou 313000, China

摘要

摘要: 为了探讨HSC70-1基因对大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状的影响作用，开发与生长性状相关的分子标记，该研究采用PCR技术扩增得到HSC70-1基因的cDNA和DNA全序列，编码区cDNA序列长1 953 bp，编码650个氨基酸，其DNA全序列长3 390 bp，包含8个外显子和7个内含子。采用直接测序法在该基因上筛选到4个单核苷酸多态性(SNP)位点，分别位于核苷酸序列中的第821、第1 105、第1 200和第2 804碱基处，且处于内含子上。SNP标记与性状的关联分析结果表明，C-821G位点上CC基因型个体的体质量和全长均显著高于CG和GG基因型(P<0.05)。A-2804T位点上TT基因型个体的体质量和全长均显著高于AT和AA基因型(P<0.05)。其他位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异(P>0.05)。通过合并基因型发现，双倍型D1 (CC−−CCTT)的各个生长性状表现最优，在体高和全长上显著高于D5。C-821G、A-2804T和D1与生长性状显著相关，可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。
- 大口黑鲈 /
- HSC70-1 /
- 关联分析 /
- 单核苷酸多态性 /
- 生长性状
Abstract: In order to explore the effects of HSC70-1 gene on growth traits of largemouth bass (Micropterus salmoides) and develop growth-related SNPs, we obtained the cDNA of coding region and the complete sequence of HSC70-1 gene by PCR amplification. The encoding region cDNA sequence of HSC70-1 gene was 1 953 bp, encoding 650 amino acids. Its complete sequence was 3 390 bp in length, consisting of 8 exons and 7 introns. We screened four SNPs (at 821, 1 105, 1 200 and 2 804 bp on the introns) by direct sequencing, and found that the individuals with CC genotype of C-821G site had significantly higher values of body mass or total length than those with CG or GG genotypes (P<0.05). At the position of A-2804T, the individuals with TT genotype had significantly higher values of body mass or total length than those with AT or AA genotypes (P<0.05). The other two SNP loci were not significantly correlated with growth traits (P>0.05). The optical combined genotype of HSC70-1 gene was D1 (CC--CCTT), which had significantly higher values of body height or total length than those with D5. The growth-related C-821G, A-2804T and D1 can be useful candidate molecular markers for largemouth bass molecular marker-assisted selection.
- Micropterus salmoides /
- HSC70-1 /
- correlation analysis /
- SNP /
- growth trait

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发展海洋牧场是中国修复近海渔业资源、改良渔业水域环境和促进近海渔业可持续发展的重要政策^[1]。万山群岛海域地处珠江口东南部，外伶仃岛海域位于万山群岛东北部。历史上万山群岛的万山渔场是我国著名渔场之一。然而，多年来受过度捕捞和环境污染等因素影响，万山群岛海域渔业资源衰退、生态环境退化严重^[2]，渔民生产、生活受到严重影响，建设万山群岛海洋牧场、修复海洋资源环境、促进渔业转型升级，已成当务之急。

海洋牧场选址是对拟建海洋牧场海域的地理条件、生物环境条件、物理化学条件及其他因素进行综合调查与分析，确定海洋牧场适宜建设区域的过程。选址作为海洋牧场建设的首要环节，其适宜性关系到建设效果甚至成败。目前，国内外关于海洋牧场的研究多集中于生境建设、生物增殖和利用等方面^[3-4]，而海洋牧场选址适宜性研究尚处于探索阶段。已有研究对阿拉伯湾海域结合海区实际的水深、流速和盐度等海况要素进行人工鱼礁选址^[5]；许强^[6]选取海域功能、可接近性、流速、水质、水深、坡度、底质类型、初级生产力、渔业资源等9个典型指标使用层次分析法进行选址评价；曾旭等^[7]基于多准则决策方法，结合专家系统、层次分析法、GIS空间分析，对浙江舟山群岛东北部马鞍列岛海域海洋牧场进行选址适宜性评价；李英雪^[8]选取环境化学指标 (叶绿素浓度、化学需氧量、无机氮和活性磷酸盐)、环境生物学指标 (浮游动植物生物量、底栖动物生物量和鱼类资源密度) 和物理环境指标 (水深、透明度、悬浮物和沉积物粒径) 等三大指标使用层次分析法进行人工鱼礁选址生态适宜性评价。地理条件是海洋牧场选址的决定性因素之一，但基于海洋地理条件用海适宜性进行海洋牧场选址尤其是基于海岸线稳定性、海洋生态红线、养殖水域滩涂规划等指标进行岛礁海洋牧场选址适宜性评价的研究尚未见报道。

本研究从海岸线稳定性、海洋功能区划、海洋生态红线、养殖水域滩涂规划、海洋工程和设施等5个方面选取34个指标 (表1—表5) 作为海洋牧场选址适宜性评价的因素，建立海洋牧场选址指标体系，并采用地理信息系统空间分析方法对珠海外伶仃岛海域海洋牧场选址进行适宜性评价，以期为海洋牧场选址尤其是岛礁海洋牧场选址提供参考。

表 1 基于海岸线变迁强度的海洋牧场选址评价指标分析

Table 1. Evaluation index of marine ranching location based on coastline change intensity

评价阈值范围 Evaluation threshold range/%	评价结果 Evaluation result	海洋牧场选址适宜程度赋值 Evaluation of suitability of marine ranching site selection
−0.5≤LCI_ij≤0.5	最适宜	3
−1≤LCI_ij<−0.5或0.5≤LCI_ij<1	较适宜	2
LCI_ij<−1或≤LCI_ij>1	一般适宜	1
注：LCI_ij表示LI_ij或AI_ij，表 8同此。 Note: LCI_ij indicates LI_ij or AI_ij. The same case in Table 8.

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表 5 基于海洋工程和设施的海洋牧场选址评价指标分析

Table 5. Evaluation index of marine ranching site selection based on marine engineering and facilities

指标 Index	主要管理要求 Main management requirements	适宜性 Suitability	适宜程度赋值 Evaluation of suitability
水利 Water conservancy	需设置缓冲区安全范围	不适宜	0
海上开采 Offshore mining	需设置缓冲区安全范围	不适宜	0
航道 Channel	需设置缓冲区安全范围	不适宜	0
港区 Port Area	泊船进出停泊装卸货物或者旅客集散	不适宜	0
锚地 Anchorage	船舶在水上抛锚以便安全停泊、避风防台、等待检验引航、从事水上过驳、编解船队及其他作业	不适宜	0
通航密集区 Navigable dense area	单位时间内通过某一航道断面的船舶或船队数量多	不适宜	0
倾废区 Dumping area	向海洋倾泻废物	不适宜	0
海底管线 Submerged pipeline	需设置缓冲区安全范围	不适宜	0
其他海洋工程或设施 Other offshore projects or facilities	海洋工程用海	不适宜	0

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1. 材料与方法

1.1 研究区概况

外伶仃岛是珠海市担杆镇政府所辖38个海岛之一，也是镇政府所在地，西距珠海市区27 nmile，北距深圳29 nmile，香港长洲6 nmile。该岛面积4.23 km²，地势东西高，北部和中部低，东部沿岸较陡，岛中央主峰伶仃峰高311.8 m。岛上水、电、交通、通讯等基础设施齐备，珠海市区有定期客货船只来往，珠海九洲机场开通直升机直航外伶仃岛旅游项目。是珠海十大美丽海岛之一、国家AAAA级海岛风景区，旅游资源丰富。

1.2 指标选取与数据来源

1.2.1 海洋牧场选址的主要影响因素和等级划分

根据建设目的，海洋牧场分为养护型、增殖型和休闲型3类，这3类海洋牧场均为综合型海洋牧场，具有不同程度的资源养护、生物增殖和休闲渔业功能，均可相互转化；资源养护功能占主导地位的为养护型海洋牧场，生物增殖功能占主导地位的为增殖型海洋牧场，休闲渔业功能占主导地位的为休闲型海洋牧场，故本文不再根据建设海洋牧场的目的来讨论分区适宜性。基于地理条件的海洋牧场选址涉及海岸线稳定性、海洋功能区划、海洋生态红线、养殖水域滩涂规划和交通、港口设施等多种因素。因此，在选址时既要确保评价指标全面，又要根据具体实例分析研究区域影响海洋牧场建设的主要因素，使指标体系全面、准确、简洁、有效。目前，海洋牧场选址适宜性尚无明确统一的评价标准，本研究结合已有成果^[9-12]，建立基于地理条件的海洋牧场选址适宜性评价指标体系，开展海洋牧场选址适宜性评价，并依据各项指标对海洋牧场布设的适宜性程度和限制性强度进行等级划分，并赋予相应的数值，用于分析各评估指标在海洋牧场选址适宜性上的相对空间差异，赋值越高代表越适宜海洋牧场建设，最适宜的赋值3，较适宜的赋值2，一般适宜的赋值1，不适宜的赋值0。

1) 基于海岸线稳定性的指标评价和等级划分：海岸线是人类开发利用的重要区域，临近海岸和岛礁的海洋牧场选址要优先考虑海岸线是否稳定，不稳定的海岸线会对海洋牧场长远发展不利。本研究采用某时段内海岸线长度和面积的平均变化百分比来表示海岸线稳定性，岛屿海岸线长度和面积变化强度计算公式如下^[13-14]：

$$ {{\rm{LI}}}_{ij}=\frac{{L}_{j}-{L}_{i}}{{L}_{i}(j-i)}\times 100{\text{%}} $$

(1)

$$ {{\rm{AI}}}_{ij}=\frac{{A}_{j}-{A}_{i}}{{A}_{i}(j-i)}\times 100{\text{%}} $$

(2)

式中：${{\rm{LI}}}_{ij}$ 表示第i至第j年岛屿海岸线长度的变化强度；$ {L}_{j}\,\mathrm{和}\,{L}_{i} $分别表示对应年份岛屿海岸线的长度；${{\rm{AI}}}_{ij}$表示第i至第j年岛屿海岸线所围面积的变化强度；$ {A}_{j}\,\mathrm{和}\,{A}_{i} $分别表示对应年份岛屿海岸线所围面积。岛屿海岸线长度变化强度有正负之分，正值表示岸线向海推进的距离，负值则表示岸线向陆后退的距离。长度变化强度的绝对值越大，海岸线时空变化越明显。岛屿海岸线所围面积变化强度结果值也有正负之分，正值表示岛屿面积增加，负值表示岛屿面积减小。面积变化强度的绝对值越大，岛屿面积变化越明显。

参考张心玉^[14]的研究结果，将海岸线变化强度评价结果划分为海洋牧场选址最适宜、较适宜和一般适宜3个等级，分别赋值为3、2和1 (表1)。

2) 基于海洋基本功能分区的指标评价和等级划分：根据《广东省海洋功能区划》^[15]海洋基本功能分区及管理要求 (表2)，农渔业区养殖区中的底播养殖区、农渔业区中的增殖区、捕捞区、水产种质资源保护区中未与其他保护区重叠区、旅游休闲娱乐区、海洋特别保护区的适度利用区和保留区中通过科学规划和严格论证的海域最适宜选址建设海洋牧场，赋值为3；其次，农渔业区养殖区中的筏式养殖区与网箱养殖区、海洋自然保护区中的实验区、海洋特别保护区中的重点保护区和生态与资源恢复区均为一般适宜选址建设海洋牧场，赋值为1；其他类型的海洋基本功能分区均不适宜选址建设海洋牧场，赋值为0。

表 2 基于海洋基本功能分区及管理要求的海洋牧场选址评价指标分析

Table 2. Evaluation index of marine ranching site selection based on marine basic function zoning and management requirements

指标 Index	二级功能区划分 Secondary functional zoning	主要管理要求 Main management requirements	适宜程度 Suitability	适宜程度赋值 Evaluation of suitability
农渔业区 Agriculture and fishery area	农业围垦区	围垦设施建设	不适宜	0
	养殖区	底播养殖	最适宜	3
		筏式养殖	一般适宜	1
		网箱养殖	一般适宜	1
	增殖区	海水增殖	最适宜	3
	捕捞区	海水捕捞生产	最适宜	3
	水产种质资源保护区	与其他类型保护区重叠	不适宜	0
	水产种质资源保护区	剩余区域	最适宜	3
	渔业基础设施区	渔港和育苗场等渔业基础设施	不适宜	0
港口航运区 Port shipping area	港口区	开发利用港口航道资源	不适宜	0
	航道区			0
	锚地区			0
工业与城镇用海区 Industrial and urban sea area	工业用海区	临海工业、工业园区建设	不适宜	0
工业与城镇用海区 Industrial and urban sea area	城镇用海区	城镇建设	不适宜	0
矿产与能源区 Mineral and energy area	油气区	油气和固体矿产等勘探、开采作业，盐田、可再生能源开发利用	不适宜	0
	固体矿区			0
	盐田区			0
	可再生能源区			0
旅游休闲娱乐区 Tourism leisure and entertainment area	风景旅游区	旅游景区开发和海上文体娱乐活动场所建设	最适宜	3
旅游休闲娱乐区 Tourism leisure and entertainment area	文体休闲娱乐区	旅游景区开发和海上文体娱乐活动场所建设	最适宜	3
海洋保护区 Marine conservation area	海洋自然保护区	核心区：禁止任何单位和个人进入	不适宜	0
		缓冲区：只准进入从事科学研究观测活动	不适宜	0
		实验区：可以进入从事科学试验、教学实习、参观考察、旅游以及驯化、繁殖珍稀、濒危野生动植物等活动	一般适宜 (开发旅游、开展驯化繁殖等活动)	1
	海洋特别保护区	重点保护区：禁止实施各种与保护无关的工程建设活动	一般适宜 (开展人工鱼礁建设、增殖放流等生态修复活动)	1
		适度利用区：鼓励实施与保护区保护目标相一致的生态型资源利用活动，发展生态旅游、生态养殖等海洋生态产业	最适宜	3
		生态与资源恢复区：根据科学研究结果，可以采取适当的人工生态整治与修复措施，恢复海洋生态、资源与关键生境	一般适宜 (开展人工鱼礁建设、增殖放流等生态修复活动)	1
		预留区：严格控制人为干扰，禁止实施改变区内自然生态条件的生产活动和任何形式的工程建设活动	不适宜	0
特殊利用区 Special utilization area	军事区	限制在军事区从事海洋开发利用活动	不适宜	0
特殊利用区 Special utilization area	其他特殊利用区	严禁在海底管线、跨海路桥区内建设永久性建筑物	不适宜	0
保留区 Reserved area	保留区	通过科学规划和严格论证，可开发利用	最适宜	3
保留区 Reserved area	保留区	未通过科学规划和严格论证，不可开发利用	不适宜	0

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3) 基于红线区分类的指标评价和等级划分：海洋生态红线本质上是一种海洋区划管理制度^[16]，海洋牧场选址位置应考虑是否符合其管理要求。根据《广东省海洋生态红线》^[17]红线区分类管控要求 (表3)，海洋自然保护区限制类红线区中的实验区、海洋特别保护区限制类红线区中的生态与资源恢复区及适度利用区、重要河口生态系统生态红线区、重要海滨湿地生态红线区、重要渔业海域生态红线区、特别保护海岛生态红线区中的限制类红线区、重要滨海旅游区生态红线区、重要砂质岸线及邻近海域生态红线区、沙源保护海域生态红线区均为一般适宜选址建设海洋牧场，赋值为1；其他类型均不适宜选址建设海洋牧场，赋值为0。

表 3 基于红线区分类管控要求的海洋牧场选址适宜性分析

Table 3. Suitability analysis of marine ranching site selection based on classification and management requirements of red line area

指标 Index		主要管理要求 Main management requirement	适宜性 Suitability	适宜程度赋值 Evaluation of suitability
海洋保护区生态红线区 Ecological red line area of marine reserve	海洋自然保护区禁止类红线区	核心区和缓冲区：禁止开展任何形式的开发建设活动，无特殊原因，禁止任何单位和个人进入	不适宜	0
	海洋自然保护区限制类红线区	实验区：禁止进行捕捞、挖沙等活动，严格控制河流入海污染物排放，不得新增入海陆源工业直排口，控制养殖规模	一般适宜	1
	海洋特别保护区禁止类红线区	重点保护区：禁止实施各种与保护无关的工程建设活动	不适宜	0
	海洋特别保护区禁止类红线区	预留区：禁止实施改变区内自然生态条件的生产活动和任何形式的工程建设活动	不适宜	0
	海洋特别保护区限制类红线区	生态与资源恢复区：可采取适当的人工生态整治与修复措施，恢复海洋生态、资源与关键生境	一般适宜	1
	海洋特别保护区限制类红线区	适度利用区：确保海洋生态系统安全的前提下，允许适度利用海洋资源，鼓励实施与保护区保护目标相一致的生态型资源利用活动，发展生态旅游、生态养殖等海洋生态产业	一般适宜	1
重要河口生态系统生态红线区 Ecological red line area of important estuary ecosystem	鼓励生态化养殖，加强对受损重要河口生态系统的综合整治与生态修复		一般适宜	1
重要海滨湿地生态红线区 Important coastal wetland ecological red line area	维持海域自然属性，保持自然岸线形态、长度，保持潮滩地形地貌稳定		一般适宜	1
重要渔业海域生态红线区 Ecological red line area in important fishery sea area	开展增殖放流活动，保护和恢复水产资源		一般适宜	1
特别保护海岛生态红线区 Special protection of island ecological red line area	禁止类红线区：禁止开展任何形式的开发建设活动		不适宜	0
	限制类红线区：加强对受损海岛生态系统的整治与修复，维持海域自然属性，保护渔业资源产卵场、育幼场、索饵场和洄游通道		一般适宜	1
自然景观与历史文化遗迹生态红线区 Ecological red line area of natural landscape and historical and cultural relics	严格控制岸线附近的景区建设工程，限制近海养殖活动		不适宜	0
珍稀濒危物种集中分布区生态红线区 Ecological red line area of rare and endangered species concentrated distribution area	生产设施与珍稀濒危物种集中分布区之间应保留一定距离		不适宜	0
重要滨海旅游区生态红线区 Important coastal tourist area ecological red line area	禁止从事可能改变和影响滨海旅游的开发建设活动		一般适宜	1
重要砂质岸线及邻近海域生态红线区 Important sandy shoreline and ecological red line area of adjacent sea area	砂质海岸向海一侧3.5 nmile内禁止采挖海砂、围填海、倾废等开发活动，加强对受损砂质岸线的修复		一般适宜	1
沙源保护海域生态红线区 Ecological red line area of shayuan protected sea area	砂质海岸向海一侧3.5 nmile内禁止采挖海砂、围填海、倾废等开发活动，实施沙滩养护等岸线整治修复工程		一般适宜	1
红树林生态红线区 Mangrove ecological red line area	除科学试验、教学实习、参观考察、旅游以及驯化、繁殖珍稀濒危野生动植物等活动外，限制开展其他活动		不适宜	0
珊瑚礁生态红线区 Coral reef ecological red line area	禁止可能破坏珊瑚礁的开发活动		不适宜	0
海草床生态红线区 Seaweed bed ecological red line area	禁止可能毁坏海草床的开发建设活动		不适宜	0

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4) 基于水域滩涂划分的指标评价和等级划分：养殖水域滩涂规划是渔业管理的基本制度，通过合理布局水产养殖生产，有利于保护水域生态环境，对海洋牧场稳定发展是必要的。综合各地养殖水域滩涂规划管理要求 (表4)，最适宜海洋牧场选址建设的海域是养殖区中的底播养殖区，赋值为3；较适宜区域包含无居民海岛周边海域限养区、重点近岸海域限养区和无居民海岛周围海域禁养区，赋值为2；一般适宜区域包含养殖区中的筏式养殖区与网箱养殖区、海洋自然保护区限养区、海洋特别保护区限养区和海洋生态红线区限养区，赋值为1；其他类型均不适宜选址建设海洋牧场，赋值为0。

表 4 基于水域滩涂划分管理要求的海洋牧场选址评价指标分析

Table 4. Evaluation index of marine ranching site selection based on management requirements of tidal flat division

指标 Index	二级功能区划分 Secondary functional zoning	主要管理要求 Main management requirements	适宜性 Suitability	适宜程度赋值 Evaluation of suitability
养殖区 Culture area	底播养殖区	坚硬海底底质类型，投放海域环境条件适宜	最适宜	3
	网箱养殖区	坚硬海底底质类型，投放海域环境条件适宜	一般适宜	1
	筏式养殖区	浅海与潮间带设置浮动筏架，筏上挂养养殖对象	一般适宜	1
限养区 Limited maintenance area	海洋自然保护区限养区	国家和省已划定的自然保护区实验区和外围保护地带，即一般控制区	一般适宜	1
	海洋特别保护区限养区	渔业开发活动限定为生态养殖	一般适宜	1
	海洋生态红线限养区	禁止进行捕捞、挖沙等活动，严格控制河流入海污染物排放，不得新增入海陆源工业直排口，控制养殖规模	一般适宜	1
	无居民海岛周边海域限养区	进行水产养殖应采取污染防治措施，污染物排放不得超过国家和地方规定的污染物排放标准	较适宜	2
	重点近岸海域限养区	保护海域生态环境，促进近岸海洋综合整治	较适宜	2
禁养区 Forbidden area	海洋自然保护区禁养区	禁止任何单位和个人进入	不适宜	0
	海洋湿地禁养区	保护区之外的其他海洋湿地保护范围	不适宜	0
	海洋特别保护区禁养区	用于珍稀、濒危海洋生物物种，自然遗迹和典型海洋生态系统保护	不适宜	0
	海洋生态红线禁养区	禁止实施改变区内自然生态条件的生产活动和任何形式的工程建设活动	不适宜	0
	建设用海空间禁养区	包括港口航运区、工业与城镇用海区、航道和锚地等	不适宜	0
	近岸海域禁养区	保护近岸海域生态环境，禁止在近岸海域进行养殖活动	不适宜	0
	无居民海岛周围海域禁养区	无居民海岛周围200 m水域可适当开展增殖	较适宜	2

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5) 基于海洋工程和设施的指标评价和等级划分：根据《国家级海洋牧场示范区管理工作规范》^[18]对海洋牧场选址要求 (表5)，需符合国家和地方海域管理、渔业发展规划和海洋牧场建设规划，以及生态保护红线和其他管控要求，与水利、海上开采、航道、港区、锚地、通航密集区、倾废区、海底管线及其他海洋工程设施和国防用海等不相冲突，即与其他海洋工程和设施用海冲突的海域均不适宜建设海洋牧场，均赋值为0。

1.2.2 数据收集与处理

研究区域数据主要包括：1978、1986、1990、1995、2000、2005、2010、2015、2020年等9个时相的外伶仃岛周边海域遥感影像数据，遥感影像均来自Landsat系列，轨道号为122/45，选择成像好、云量相对较少且对研究区域无影响的影像。数据来源于美国地质勘探局 (United States Geological Survey, USGS, https://earthexplorer.usgs.gov/)。海域使用类型数据见表6。2019年4月—2021年3月间每月月中当天 (每月第15天) 的船舶航行数据，源于船讯网 (http://www.shipxy.com/)。用ArcGIS 10.7软件绘制地图，数据来源于全国地理信息资源目录服务系统 (https://www.webmap.cn/, 1∶25万全国基础地理数据库，2019公众版)。

表 6 研究区域海域使用类型

Table 6. Type of sea area usage in survey area

使用类型 Sea area usage of survey area	数据来源 Data source
养殖水域滩涂 Tidal flat in aquaculture waters	《珠海市养殖水域滩涂规划》^[19]
海洋功能区划 Marine functional zoning	《广东省海洋功能区划》^[15]
海洋生态红线 Ocean ecological red line	《广东省海洋生态红线》^[17]
水利 Water conservancy	无此海洋工程
海上开采 Offshore mining	无此海洋工程
航道 Channel	无此海洋工程
港区 Port Area	《中国航路指南 (南海海区)》^[20]
锚地 Anchorage	《中国航路指南 (南海海区)》^[20]
通航密集区 Navigable dense area	AIS数据
倾废区 Dumping area	无此海洋工程
海底管线 Submerged pipeline	《中国航路指南 (南海海区)》^[20]
其他-禁止抛锚禁止捕鱼 Others-no anchoring, no fishing	《中国航路指南 (南海海区)》^[20]

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船舶密度分布实质上是指某一水域中船舶的空间分布，本研究通过对船舶航行数据分析获取研究区域的通航密集区。首先对船舶航行数据进行预处理，包括轨迹数据组织、删除错误记录、删除异常位置，然后采用ArcGIS 10.7软件数据处理平台，利用空间分析模块下Line Density命令生成航迹密度图。

2. 结果

2.1 研究区域确定

海洋生态空间是整体的、系统的和复合的，海洋资源是流动的、立体的，海洋动态变化性强，区域差异性不显著^[21]，由于以上原因目前尚未见有海岛与海岛之间海域区分的研究报道。本研究对外伶仃岛海洋牧场选址研究区域的确定方法，是将其与邻近海岛的最近点进行连线，根据其周围岛礁分布的实际情况，选取外伶仃岛与正北、西北、东北、西南、东南5个方向的岛礁，取这些连线的中点，将这些中点连接成封闭区域，即本研究的研究区域。根据上述方法，计算外伶仃岛到周围岛礁的最短距离 (表7)，确定外伶仃岛拟建海洋牧场区域的面积为78.68 km²(图1)。

表 7 外伶仃岛到周围岛礁的最短距离

Table 7. Shortest distance from Wailingding Island to surrounding island reefs

中点名称 Midpoint name	岛屿名称 Island name	最短距离 Minimum distance/m
A	石鼓洲	9696.2
B	黑洲	6229.3
C	三门洲	4799.6
D	直湾岛	14179.3
E	南丫岛	11000.6
F	长洲	9415.5

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图 1 研究区位置示意图

Figure 1. Location map of survey area

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2.2 外伶仃岛海岸线变迁分析

本研究统计了1978—2020年岛屿海岸线长度和所围面积变化 (图2)。外伶仃岛海岸线总长度从1978年的11.08 km变为2020年的12.04 km，增加了约0.96 km，年均增加0.023 km，变化强度为0.206%，其中2000—2005年和2010—2015年增加较多，2005—2010年则出现较大幅度减少。外伶仃岛海岸线所围成的陆地面积从1978年的4.33 km²增加为2020年的4.38 km²，增加了约0.05 km²，年均增加0.001 km²，变化强度为0.027%，其中1986—1990年增加较多，1995年起开始出现缩小趋势。

图 2 1978—2020年外伶仃岛海岸线长度和面积变化

Figure 2. Changes of coastal line length and area in Wailingding Island from 1978 to 2020

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2.3 指标评价结果

2.3.1 海岸线稳定性分析

根据1978—2020年海岸线变化分析，外伶仃岛42年间长度变化强度为0.206%，面积变化强度为0.027%，根据本研究对海岸线适宜性的评价方法，外伶仃岛长度和面积变化强度均小于0.5%，该海域适宜开展海洋牧场建设。

2.3.2 外伶仃岛海域海洋牧场选址适宜性

按照本研究建立的海洋牧场选址适宜性评价指标，结合外伶仃岛实际情况对其进行海洋牧场选址适宜评价 (表8)。按照广东省海洋功能区划和海洋生态红线的要求，研究区域分别位于万山群岛旅游休闲娱乐区、万山群岛重要渔业海域限制类红线区、部分位于万山群岛重要滨海旅游区限制类红线区 (图3)，适宜进行海洋牧场建设。根据珠海市养殖水域滩涂规划的要求，研究区部分海域位于建设用海空间禁养区和海洋生态红线限养区 (图4-a)，剩余海域适宜进行海洋牧场建设。根据《国家级海洋牧场示范区管理工作规范》要求，研究区内包含的海洋工程设施有港口 (图4-b)、锚地 (图4-c)、通航密集区 (图4-d) 和海底管线 (图4-e)。港口及海底管线均需要注意与其留有足够的安全距离，避免发生安全隐患，对未来海洋牧场建设产生不利影响。

表 8 外伶仃岛海域海洋牧场选址适宜性评价结果

Table 8. Suitability of marine ranching site selection in Wailingding Island

项目 Item	分类 Classification		赋值 Evaluation	面积 Area/km²
海岸线稳定性 Coastline stability	−0.5≤LCI≤0.5		3	—
海洋功能区划 Marine functional zoning	万山群岛旅游休闲娱乐区		3	12.31
海洋功能区划 Marine functional zoning	万山群岛保留区		3	78.68
海洋生态红线 Ocean ecological red line	万山群岛重要滨海旅游区生态红线区		1	12.31
海洋生态红线 Ocean ecological red line	万山群岛重要渔业海域生态红线区		1	78.68
养殖水域滩涂规划 Tidal flat planning in aquaculture waters	建设用海空间禁养区		0	29.34
	海洋生态红线限养区		2	12.31
	养殖区		3	37.68
海洋工程和设施 Marine engineering and facilities	港口及其缓冲区		0	1.47
	锚地		0	3.81
	通航密集区	中等及以上密集	0	34.02
		一般密集	2	22.31
		不密集	3	21.35
	海底管线及其缓冲区		0	27

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图 3 外伶仃岛海域海洋功能区划和生态红线区控制图

Figure 3. Marine functional zoning and ecological red line control chart in Wailingding Island sea area

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图 4 外伶仃岛海域单项因子适宜性评价

Figure 4. Suitability evaluation of individual factors in Wailingding Island sea area

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2.3.3 综合评价结果

本研究中选址适宜性评价结果优先级由高到低依次为不适宜>一般适宜>较适宜>适宜，即研究区域内某一评价指标为不适宜，则该区域最终结果即为不适宜选址建设海洋牧场，故该区域不进行指标相加运算；当所有评价指标均满足适宜条件 (一般适宜、较适宜、最适宜) 时，将指标对应评分相加得出最终评价结果。研究结果表明，综合海岸线稳定性、海洋功能区划、海洋生态红线、养殖水域滩涂规划、海洋工程和设施等因素，最终计算得出外伶仃岛海域一般适宜选址建设海洋牧场区域的分数为15~19，所占面积33.09 km²，不适宜的区域面积为45.59 km²(图5)。

图 5 珠海外伶仃岛海洋牧场选址适宜性评价结果

Figure 5. Suitability evaluation results of marine ranching site selection in Wailingding Island sea area

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3. 讨论

3.1 指标选取准则

海洋牧场选址受地理条件、生物环境条件、物理化学条件等诸多因素影响^[11,22]，其中地理条件是海洋牧场选址的决定性因素之一，对应的指标包括海岸线稳定性、海洋功能区划符合性、海洋生态红线区符合性、养殖水域滩涂符合性和海洋工程和设施符合性。海岸线是发展海洋经济的前沿阵地，具有重要的生态功能和资源价值。岸线侵蚀和人类主导下围填海造成的人工岸线扩张是海岸线变动的主要因素，岸线侵蚀过程带来的影响有海岸带生物多样性资源损失和滨海生态系统服务功能损坏等^[14,23]；人工岸线扩张带来的影响有打破原位及附近海区原有的冲刷与淤积平衡状态、干扰或逆转海岸线的自然演变趋势、海洋环境恶化和海水富营养化问题加重等^[14,24-26]，临近海岸和岛礁的海洋牧场选址要考虑海岸线是否稳定，海岸线变动造成的影响不利于海洋牧场建设及其长远发展。海洋功能区划本质上是一种在开发中实施保护的管理方法，而海洋生态红线区划是以生态系统为基础的管理手段^[27]，海洋生态红线是海洋功能区划定的参照基础，海洋功能区划是实施海洋牧场选址的重要准则，是海域综合开发利用与管理的集中体现，因此在进行海洋牧场选址评价时要考虑到与海洋功能区划、海洋生态红线的兼容性与排他性。海洋生态红线区符合性、养殖水域滩涂符合性、海洋工程和设施符合性同样是实施海洋牧场选址的重要准则，因此在实际开展海洋牧场选址时，有必要将其考虑在内。李文涛和张秀梅^[28]、许强和张守宇^[11]进行人工鱼礁或海洋牧场选址研究时均提到将海洋功能区划符合性纳入选址指标，并未考虑海岸线稳定性、海洋生态红线区符合性、养殖水域滩涂符合性、海洋工程和设施符合性。本研究在进行海洋牧场选址评价时将上述指标均纳入评价体系，且外伶仃岛海洋牧场选址评价结果与其已建人工鱼礁区和已规划海洋牧场区范围较相近，未来海洋牧场建设可与已有鱼礁形成大规模稳定的生态人工鱼礁群，有效修复和构建水产生物的生活和栖息场所，优化海域生态环境。

3.2 海洋牧场选址的对比分析

本研究使用创新性方法建立珠海外伶仃岛海洋牧场选址研究区域，因未查到其他文献中有相关方法的研究报道，故未进行对比分析。国内外针对海洋牧场方面的选址研究多倾向于开展人工鱼礁选址，一致认为鱼礁选址过程是整个海洋牧场建设过程中最重要的环节^[6]，目前使用最普遍的研究方法是层次分析法 (Analytic Hierarchy Process, AHP)。如王飞等^[29]、Mousavi等^[30]、许妍等^[9]基于AHP模型，结合物理环境、生物资源、化学条件等内容建立选址评价指标，完成人工鱼礁选址过程。但层次分析法在建立层次结构模型过程中需要对各准则进行对比，主观性较强，从而在评价准确性上可能存在偏差^[8]。本文使用建立评价指标体系的方法进行海洋牧场选址，说明了排除区域不适合作为海洋牧场选址的原因，具有较强的客观性。评价结果中适宜建设海洋牧场的区域与外伶仃岛已建人工鱼礁区、已规划海洋牧场区范围较相近，进一步验证了本研究建立的评价指标体系方法的可行性和合理性，可为外伶仃岛海洋牧场建设提供技术支撑和参考依据，同时也为我国海洋牧场选址适宜性评价提供借鉴。

许妍等^[9]在2016年同样使用构建指标体系的方法对天津市人工鱼礁选址进行适宜性评价，并证明研究结果具有可行性。许强等^[22]在对舟山市海洋牧场进行初步选址研究时，选取排除图层的内容仅提出考虑海洋功能区划符合性；Erftemijier等^[5]选取排除图层内容时，基于研究区域考虑到管道、电缆、锚地、保护区水深小于5 m的区域等指标，上述研究中的指标体系均不完整，本研究充分考虑研究区域内地理条件用海符合性，对提高海洋牧场选址评价的科学性、有效性和准确性具有较好的参考价值。

3.3 不足与展望

选址是海洋牧场建设的重要环节，科学开展选址工作，是确保海洋牧场在提供生态廊道、保护野生种群、调节流场和物质运输等方面发挥重要作用的基础^[31]。一个恰当的选址过程对海洋牧场建设的成功至关重要，许多研究经验表明，选址建设比后续任何一个环节都更加重要^[32]。在许多情况下，不良的选址被认为是未能达到预期目标的重要原因^[33]。本研究中对海岸线分析，提取的是瞬时水边线，与实际海岸线存在一定误差，未来需要结合海岸线实际调查进行更深入的研究。此外，本研究说明海岸线稳定是适合建设海洋牧场的原因之一，建立评价指标体系说明不适合建设海洋牧场的海域，但并未解释排除后的区域适合建海洋牧场的原因，后续需结合水环境数据、生物资源数据等进行更加深入的研究。

图 1 大口黑鲈HSC70-1 cDNA序列及其推测的氨基酸序列

碱基序列在上，氨基酸序列在下；非细胞器基序RARFEEL用方框表示；C末端的EEVD基序用单下划线标出；2个GGMP基序用双下划线标出；双分型核定位信号用波浪线表示

Figure 1. Nucleotide and deduced amino acid sequences of largemouth bass HSC70-1 cDNA

The nucleotide sequence is in upper row and the amino acid in lower row. The non-organelle eukaryotic consensus motif is boxed. The C-terminal EEVD motif is indicated by “__”. Two consecutive repeats of the tetrapeptide motif GGMP are double-underlined. The NLS is indicated by “~~”.

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表 1 大口黑鲈HSC70-1基因全序列扩增所用的引物名称及序列

Table 1 Primer sequences applied in amplification of largemouth bass HSC70-1 gene

上游引物 forward primer	引物序列 5'−3' primer sequence	下游引物 reverse primer	引物序列 5'−3' primer sequence	产物长度/bp product length
F139	AGTGAGAGGCTGATCGGAGATG	R783	TAGGCTTCAGCAATCTCCTTCATC	645
F672	ATAACACCCGCCCCAAGGTTCAAG	R1294	CCATGCGGTTGTCGAAATCCTCAC	623
F1226	GCATCTTTGAGGTCAAGTCCACTG	R2022	GTAGGTGGTGAAGGTCTGCGTCTG	797
F1923	TCTCTCCCTGGGAATTGAGACCGC	R2684	CCAGCCAGCCAATAACCTCGTTGC	762
F2589	AGTCGACCGTGGAGGATGAAAAGC	R3382	CCTCCTCAATGGTTGGTCCAGAGG	793

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表 2 SNP位点分型所用引物名称及序列

Table 2 Primer sequences applied in each SNP genotyping

位点 SNP locus	上游引物 forward primer	下游引物 reverse primer	延伸引物 extension primer
C-821G	TGAAGCCTACCTCGGAAAAGT	AGCATCCTTAGTGGCCTGGCGC	TTACTTAGCATAGCTCTGGACA
A1105	TCTCTGGCCTCAATGTCCTG	GGTTGTCGAAATCCTCACCG	TTTTTTTTTTCATCTTGAATTGAGGTAATAAA
C-1200T	TCATCTTTGATCTTGGTGGTGG	ACGGACAGCTCTCTTGTTGT	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCGATGGTCAAGATGGAAAC
A-2804T	TCCACCAGCTTATCAGACTGT	GGTCAACCCTCCAAGTAACTT	CTGTAGGGGGTAACTGAAGGGT

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表 3 HSC70-1基因上4个SNP位点的遗传参数

Table 3 Genetic parameters of 4 SNPs in HSC70-1 gene

SNP位点 SNP locus	碱基类型 nucleotide type	有效等位基因数 N_e	期望杂合度 H_e	观测杂合度 H_o	哈温平衡 (P) HWE
C-821G	G/C	1.55	0.645	0.684	0.063 8
A1105	A/−	1.91	0.524	0.951	0.000 0^*
C-1200T	C/T	1.69	0.592	0.430	0.019 3^*
A-2804T	T/A	1.54	0.648	0.688	0.416 3
平均值 average		1.67	0.602	0.688
注：. 偏离Hardy-Weinberg定律(P<0.05) 　Note: . deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05)

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表 4 HSC70-1基因中各SNP位点与生长性状的关联分析 (平均值±标准差)

Table 4 Correlation analysis between different SNP loci of HSC70-1 gene and various growth traits ($ {\overline {\mathit{\boldsymbol{X}}}} \pm {\bf SD}$)

SNP位点 SNP site	基因型 genotype	样本数 number of sample	体质量/g body mass	全长/cm total length	头长/cm head length	体高/cm body depth	尾柄长/cm caudal peduncle length
C-821G	CC	31	573.26±22.87^a	30.26±0.45^a	7.57±0.28	8.75±0.18	8.57±0.17
	CG	136	512.49±10.92^b	29.22±0.21^b	7.36±0.13	8.48±0.09	8.33±0.08
	GG	263	523.32±7.85^b	29.32±0.15^b	7.46±0.10	8.48±0.06	8.28±0.06
A1105	−−	157	524.01±10.23	29.44±0.2	7.41±0.13	8.54±0.08	8.38±0.07
	A−	21	540.70±27.96	29.69±0.55	7.47±0.34	8.66±0.22	8.34±0.20
	AA	252	521.75±8.07	29.28±0.16	7.45±0.10	8.46±0.06	8.28±0.06
C-1200T	CC	185	521.324±9.41	29.24±0.18	7.55±0.12	8.49±0.07	8.30±0.07
	CT	245	525.14±8.18	29.45±0.16	7.35±0.10	8.51±0.06	8.34±0.06
A-2804T	AA	265	523.05±7.82^b	29.34±0.15^b	7.45±0.10	8.49±0.06	8.28±0.06
	AT	134	512.86±11.00^b	29.20±0.22^b	7.37±0.14	8.46±0.09	8.33±0.08
	TT	31	573.26±22.88^a	30.26±0.45^a	7.57±0.28	8.75±0.18	8.57±0.17
注：同列中上标字母不同表示差异显著(P<0.05)，表5同此　Note: Different superscripts within the same column denote significant difference (P<0.05). The same case in Tab.5.

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表 5 HSC70-1基因双倍型与大口黑鲈生长性状的关联性分析 (平均值±标准差)

Table 5 Diplotype of HSC70-1 gene associated with growth traits in largemouth bass (${\overline {\mathit{\boldsymbol{X}}}} \pm {\bf SD}$)

双倍型 diplotype	基因型 (样本数) genotype (n)	体质量/g body mass	全长/cm total length	体高/cm body depth
D1	CC−−CCTT (28)	552.01±103.53	30.14±2.33^a	8.7±0.91^a
D2	GGAACTAA (225)	524.99±139.51	29.47±2.42	8.51±1.05
D3	GGA−CTAA (11)	522.11±84.45	29.53±1.33	8.51±0.73
D4	CG−−CCAT (117)	516.74±102.55	29.29±1.98	8.51±0.89
D5	GGAACCAA (16)	484.46±102.8	27.28±5.27^b	8.08±0.86^b

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其他类型引用(2)

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1. 材料与方法
1.1 研究区概况
1.2 指标选取与数据来源
1.2.1 海洋牧场选址的主要影响因素和等级划分
1.2.2 数据收集与处理
2. 结果
2.1 研究区域确定
2.2 外伶仃岛海岸线变迁分析
2.3 指标评价结果
2.3.1 海岸线稳定性分析
2.3.2 外伶仃岛海域海洋牧场选址适宜性
2.3.3 综合评价结果
3. 讨论
3.1 指标选取准则
3.2 海洋牧场选址的对比分析
3.3 不足与展望

1. 材料与方法
1.1 研究区概况
1.2 指标选取与数据来源
1.2.1 海洋牧场选址的主要影响因素和等级划分
1.2.2 数据收集与处理
2. 结果
2.1 研究区域确定
2.2 外伶仃岛海岸线变迁分析
2.3 指标评价结果
2.3.1 海岸线稳定性分析
2.3.2 外伶仃岛海域海洋牧场选址适宜性
2.3.3 综合评价结果
3. 讨论
3.1 指标选取准则
3.2 海洋牧场选址的对比分析
3.3 不足与展望

参考文献(33)

施引文献(9)

资源附件(0)

大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析

作者简介: 李胜杰(1981 — )，男，博士，副研究员，从事遗传育种研究。E-mail: ssjjli@163.com

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