合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究

王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民

王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民. 合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究[J]. 南方水产科学, 2007, 3(5): 54-60.
引用本文: 王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民. 合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究[J]. 南方水产科学, 2007, 3(5): 54-60.
WANG Xiaoyu, YU Dahui, HUANG Guiju, GUO Yihui, DU Bo, GONG Shiyuan, WANG Aimin. Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata[J]. South China Fisheries Science, 2007, 3(5): 54-60.
Citation: WANG Xiaoyu, YU Dahui, HUANG Guiju, GUO Yihui, DU Bo, GONG Shiyuan, WANG Aimin. Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata[J]. South China Fisheries Science, 2007, 3(5): 54-60.

合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究

基金项目: 

广东省科技计划项目 2002B2150101

广东省自然科学基金项目 037148

详细信息
    作者简介:

    王小玉(1976-), 女, 硕士, 从事海洋生物遗传育种研究。E-mail: yuerxitan@163.com

    通讯作者:

    喻达辉, E-mail: pearlydh@163.com

  • 中图分类号: Q753

Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata

  • 摘要:

    对AFLP标记在合浦珠母贝(Pinctada fucata)印度家系(印度贝♀×印度贝♂,PII)、杂交家系(三亚贝♀×印度贝♂,PSI)和三亚家系(三亚贝♀×三亚贝♂,PSS)的遗传分离及3个家系的遗传多样性进行了分析。3对引物共产生57个位点,分离位点比例为57.4%~87.7%,符合孟德尔规律的分离位点为70.0%~71.0%;1 : 1分离位点占总分离位点的24.0%~45.2%,其中杂交家系的比例最高。3个家系的多态位点比例为93.0%~100.0%,总基因多样性为0.460。家系内的基因多样性为PII 0.434,PSI 0.331,PSS 0.366,平均为0.377±0.030。家系间的遗传分化显著(GST=0.180)。遗传距离分析表明,PSI与PSS之间的遗传距离最大(0.157),PII与PSS之间的遗传距离最小(0.121)。UPGMA系统树表明,PII和PSS的亲缘关系较近,而PSI与这2个家系较远。上述结果表明,第一代家系的遗传多样性仍很高,但家系之间的遗传分化较大。该研究结果对育种过程中遗传资源管理具有一定指导作用。

    Abstract:

    Genetic segregation of AFLP markers in three Pinctada fucata families, i.e. Indian family (Indian♀× Indian♂, PII), hybrid family (Sanya♀×Indian♂, PSI) and Sanya family (Sanya♀×Sanya♂, PSS) as well as their genetic variation was investigated. Three pairs of primers generated 57 loci, among which 57.4%~87.7% were segregated in F1. The proportion of loci segregated in Mendelian ratio over segregated loci ranged from 70.0% to 71.0%, of which 24.0%~45.2% segregated in 1 : 1 ratio. Hybrid family had the highest ratio of 1 : 1 segregating markers. The proportion of polymorphic loci was 93.0%~100.0% for the three families using 0.95 criterion. An overall genetic diversity (HT) was 0.460 and within-family genetic diversities (hS) were 0.434, 0.331, 0.366 for families PII, PSI, PSS, respectively, with an average of 0.377±0.030 (HS). Genetic differentiation among the three families was significant (GST=0.180). Analysis of genetic distances showed that Sanya family PSS was most distant from hybrid family PSI (0.157) while nearest to the Indian family PII (0.121).The UPGMA tree indicated that the two pure families PII and PSS were closely related and grouped together. These observations indicated that genetic variation in F1 family is high while genetic differentiation among families is great and significant. These findings shall be useful in management of genetic resources during breeding of pearl oysters.

  • 虾青素(astaxanthin)是一种非维生素A原的类胡萝卜素,常温下呈紫黑色结晶粉末,熔点224℃,易氧化且对光敏感,不溶于水,易溶于二氯甲烷、氯仿、丙酮等大多数有机溶剂[1]。虾青素最重要的性质在于它的抗氧化性,其分子结构中具有活泼的电子效应,极易与自由基反应而清除自由基[2-3],因而被誉为“超级维生素E”和“超级抗氧化剂”。动物试验表明它有抑制肿瘤发生、增强免疫功能等多方面的生物活性和生理功能,在功能食品和医药等方面应用广泛[4]

    近年来出于安全考虑,人们对生产天然虾青素的兴趣大大提高。目前较有前景的天然虾青素生产来源是甲壳类动物的外壳、酵母菌和藻类。由于甲壳类年产量很大,加工厂的废弃物占原料的70%~85%,是提取虾青素的一种良好来源。据报道,2006年全世界约有54万t粉红虾被加工,以平均每吨废弃物可提取出35 g虾青素估计,每年可获取18 900 kg虾青素[5]

    由于天然虾青素在甲壳类壳中的含量非常低,因而传统的提取和精制方法如碱法破壁法、超声波法、层析法等,提取率均较低,难以满足生产和市场需要。

    负压空化法提取技术是一种崭新的提取方法。其原理是利用负压空化气泡产生强烈的空化效应和机械振动,造成目标物颗粒细胞壁快速破裂,胞内物质被释放;同时负压空化效应使细胞膜和壁的通透性加大,提取溶剂得以瞬间进入,大大促进胞内物质向介质释放、扩散和溶解过程,从而使提取过程在极短时间内完成。这种提取方法具有提取收率高、设备简单、易于操作的特点[6-8]

    文章首次采用负压空化法从河虾的虾壳中提取天然虾青素,变废为宝,提高水产品废弃物的综合利用率,为水产品的综合应用开辟新路,并为负压空化法的工业化提取技术提供理论基础。

    原料为新鲜河虾虾壳,取自河南南阳市白河附近一生产河虾虾仁的冷库车间。

    虾壳预处理是用5%盐酸浸泡、水洗除去盐和矿物质及一些水溶性杂质,将虾壳敲碎,离心甩干,备用。

    自制空化柱(内径为4 cm,上端连接空气流量计和真空泵,下端配有法兰控制空气进量);真空泵;空气流量计;离心机。

    高效液相色谱仪(Waters 510高压泵;Waters 717自动进样器;色谱柱为Novapak C18柱(Φ4.6×150 mm)或Waters Spherisorb. S5W(5 μm silica)硅胶柱(Φ4.6×250 mm);Waters 486紫外检测器,二极管阵列检测器(PDA)。

    甲醇、乙醇、丙酮、乙腈、二氯甲烷等化学试剂均为分析纯。

    量取甲醇、乙醇、丙酮、二氯甲烷各100 mL,分别与10 g虾壳混合,置于空化柱中,进行负压空化提取,时间为30 min,通气量为0.20 m3·h-1,分别取样,样品经12 000 r·min-1离心5 min后采用HPLC检测虾青素的含量。

    量取50%,60%,70%,80%,90%,100%的乙醇溶液各100 mL,分别与10 g虾壳混合,置于空化柱中,进行负压空化提取,时间为30 min,通气量0.20 m3·h-1,分别取样,样品经12 000 r·min-1离心5 min,HPLC检测虾青素含量。

    量取10 g虾壳,与100 mL 80%的乙醇溶液混合,置于空化柱中,进行负压空化提取,时间为1 h,通气量0.20 m3·h-1,每间隔5 min取样,样品经12 000 r·min-1离心5 min后检测虾青素的含量。

    量取3份10 g虾壳,分别用80%乙醇溶液提取3次(料液比分别为1:10,1:20,1:30)进行对比试验,通气量为0.20 m3·h-1,时间为30 min,收集提取液,浓缩至干,分别用100 mL乙醇溶解,取样,样品经12 000 r·min-1离心5 min后采用HPLC检测虾青素的含量。

    量取5份10 g虾壳,分别与100 mL 80%乙醇溶液混合,置于空化柱中,进行负压空化提取,时间为30 min,选择通气量0.10,0.15,0.20,0.25,0.30 m3·h-1进行对比试验,分别取样,样品经12 000 r·min-1离心5 min后采用HPLC检测虾青素的含量。

    HPLC检测。(1)游离虾青素分析。色谱柱为Novapak C18柱,Φ4.6×250 mm;预柱为Waters;流动相A为甲醇-二氯甲烷-水(50:2:3);流速0.6 mL·min-1;检测波长478 run。(2)虾青素酯分析。色谱柱为Novapak C18柱,Φ4.6×250 mm;预柱为Waters;流动相B为甲醇-二氯甲烷-乙腈-水(30:9:7:1.4);流速0.6 mL·min-1;检测波长481 nm。

    游离虾青素分析结束时,色谱柱需要用二氯甲烷-甲醇(1:3)冲洗。它能准确测定游离虾青素的含量,但不适用于正己烷配制的样品溶液的分析。虾青素酯分析准确性较差,但可用于正己烷配制的样品溶液。

    取10 g虾壳鲜物料,用pH值为11.8的NaOH溶液处理,温度为40℃,处理2 h后,水洗至溶液呈中性,在4 800 r·min-1下离心10 min,取沉淀部分加入100 mL 80%乙醇溶液浸提l h,取样,12 000 r·min-1离心5 min,样品采用HPLC进行虾青素含量测定。

    取10 g虾壳鲜物料,加入100 mL 80%乙醇溶液,放入超声机内进行超声提取,时间为35 min,温度为40℃,频率为100 kHz。取样,12 000 r·min-1离心5 min,样品采用HPLC进行虾青素含量测定。

    在提取工艺中,应选择对目标提取物溶解度高、价格便宜、毒性低且易回收的提取溶剂(图 1)。由于负压空化提取法在提取时,溶剂在空化柱内会剧烈混旋,负压作用下气流将带走一部分溶剂,此外如果提取溶剂的挥发性较强会导致过多的溶剂进入空气之中,造成环境污染,所以首选挥发性弱的提取溶剂。

    图  1  不同提取溶剂对虾青素提取率的影响
    1.甲醇;2.乙醇;3.丙西酮;4.二氧甲烷
    Figure  1.  Effect of various solvent on astaxanthin extraction rate
    1.methanol; 2.ethanol; 3.acetone; 4.dichlormethane

    目前,虾青素提取中常用的溶剂有二氯甲烷、丙酮、甲醇和乙醇。二氯甲烷的毒性大,挥发性强,且与物料无法互溶,出现分层现象,给物料的装投和处理带来极大不便;丙酮的提取效果较好,但其挥发性较强,毒性也较大,在物料的提取、溶剂的回收过程中,会造成大量污染,且会繁化操作和产品后处理等程序;甲醇和乙醇的效果相当,故选择毒性较低的乙醇作为提取溶剂[9]

    图 2所示,乙醇浓度越高提取效果越好,这是因为在气泡传质的过程中,提取溶剂借助气泡溃灭或收缩时产生的巨大能量,可以透过细胞壁与提取的目标物充分接触;虾青素不溶于水,当乙醇中含水后,虾青素在提取溶剂中的溶解度降低,与虾青素脂肪粒接触时,无水乙醇可以最大限度的溶解虾青素,使提取更充分,但由于工业化生产的特殊要求,提取溶剂的浓度不宜过高,否则将会提高成本,并且给下一步溶剂回收的再利用造成一定的难度。所以选择浓度为80%的乙醇溶液作为提取溶剂,降低成本。

    图  2  乙醇浓度对虾青素提取率的影响
    Figure  2.  Effect of various ethyl alcohol density on astaxanthin extraction rate

    图 3可知,随着空化时间的增加,虾青素的提取率成上升趋势,在35 min时上升至最高,之后曲线成下降趋势。虽然空化现象可以产生巨大的能量,但是由于空化柱内细胞的数量也很大,要想使提取效果完全,就要使每一个细胞都受到气泡的冲击,而且还要使每一个细胞内的虾青素都被抽提出来,这样就需要一定的提取时间来使气泡多次作用到每一个细胞[10]。虾青素的不稳定性又决定了提取时间不宜过长,所以在提取35 min后提取溶液中虾青素的含量才会降低,由此确定负压空化法提取虾青素的最佳时间为35 min。

    图  3  不同时间对虾青素提取率的影响
    Figure  3.  Effect of various extraction time on astaxanthin extraction rate

    图 4可以看出料液比对虾青素的提取有显著影响,料液比1:10的提取效果最差,较料液比1:20提取率低32.3%,因为料液比过小,料液过分粘稠,空化的效果受到影响,造成了虾青素的提取不完全;料液比1:20与料液比1:30的提取效果相当,但提取的料液比过大,溶剂使用量过多,后期固液分离及溶剂回收负载过重,将会延长生产周期,加大成本。因此,选择最佳料液比为1:20。

    图  4  料液比(体积比)对虾青素提取率的影响
    Figure  4.  Effect of material/fluid ratio (V/V)on astaxanthin extraction rate

    图 5的结果可以知道,最佳通气量为0.20 m3·h-1。通气量的选择要适中,不宜过大或过小,因为当通气量较低时,液相中气含率较小,气泡数量产生较少,气液混旋效果较差,传质表面减少,影响液相与固相间的传质效率;当通气量过大时,传质体系中含气量增加,但空化所需的临界压力减小,同时小气泡的数量减少,空化效果较差,导致传质率降低。

    图  5  通气量对虾青素提取率的影响
    Figure  5.  Effect of ventilation on astaxanthin extraction rate

    综上所述,虾青素的最佳工艺参数为提取溶剂是80%乙醇溶液,提取时间为35 min,料液比为1:20,通气量为0.20 m3·h-1

    在单因素试验的基础上,确定乙醇浓度、提取时间、料液比、通气量4因素,采用L9 (34)的正交试验,以提取率为指标确定最佳条件,见表 1

    表  1  正交试验结果及分析
    Table  1.  Orthogonal test results and analysis
    试验号
    no.
    乙醇浓度/%
    ethyl alcohol density
    A
    提取时间/min
    extraction time
    B
    料液比
    material/fluid ratio
    C
    通气量/m3·h-1
    ventilation
    D
    提取率/%
    extraction rate
    1 1(70) 1(25) 1(1:15) 1(0.15) 1.26
    2 1 2(30) 2(1:20) 2(0.20) 1.44
    3 1 3(35) 3(1:25) 3(0.25) 1.37
    4 2(80) 1 2 3 1.32
    5 2 2 3 1 1.53
    6 2 3 1 2 1.65
    7 3(90) 1 3 2 1.43
    8 3 2 1 3 1.25
    9 3 3 2 1 1.30
    K K1 1.357 1.337 1.387 1.363
    K2 1.500 1.407 1.353 1.507
    K3 1.327 1.440 1.443 1.313
    R 0.173 0.103 0.090 0.194
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    表 1可知,各因素影响极差大小的主次顺序为D>A>B>C,即通气量对提取率的影响最大,乙醇浓度其次,提取时间和料液比对提取率的影响较小。最佳提取工艺条件为D2A2B3C3,即通气量0.20 m3·h-1,乙醇浓度80%,提取时间35 min,料液比1:25。此组合在表 2中未出现,故需做验证试验。而验证试验表明,在最佳条件下,其提取率为1.68%,高于其它组合。

    表  2  不同提取方法提取条件的比较
    Table  2.  Comparison of different extraction methods
    方法
    methods
    提取时间/min
    extraction time
    提取温度/℃
    extraction temperature
    溶剂
    solvent
    碱法破壁提取
    extraction alkaline broken-down wall
    190 40 NaOH(pH=11.8)
    80%乙醇溶液(100 mL)
    80% ethyl alcohol (100 mL)
    超声波法
    ultrasonic wave
    35 40 80%乙醇溶液(100 mL)
    80% ethyl alcohol (100 mL)
    负压空化法
    vacuum cavitations
    35 25 80%乙醇溶液(100 mL)
    80% ethyl alcohol (100 mL)
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    根据检测结果,空化提取法的提取效果优于化学破壁法,提取率较碱法破壁提高26.7%。试验发现,碱对虾青素有一定的破坏作用,在使用pH值为11.8的碱液时,虾青素的损失率最小;但这些精确的溶液条件和较短的处理时间将给大规模生产带来一定难度,操作中的微小误差都将会导致提取率的严重降低。负压空化法提取时间短,对提取温度也无特殊要求(表 2),将原来的破壁提取2步操作合并为一步完成,所以,无论是在提取率还是在操作程序的简化程度方面,负压空化法都是更适合产业化生产的提取方式。

    在提取时间、溶剂以及提取效果3方面,超声提取与负压空化法提取基本相同,但超声法的提取温度要略高于负压空化法超声提取,在实验室规模应用较普遍,处理少量样品时操作简便,液量损失少,但是超声波产生的化学自由基团能使某些敏感活性物质失活,噪声令人难以忍受,而且大容量装置声能传递,散热均有困难,因而超声破碎的应用潜力有限。

    文章研究了负压空化法提取虾壳中虾青素的工艺条件对虾青素提取效果的影响,确定了负压空化法提取最佳工艺参数:提取溶剂为浓度80%的乙醇溶液,提取时间为35 min,料液比为1:20,通气量为0.2 m3·h-1。同时将负压空化法与常用破壁提取方法的提取效果和效率进行了比较,结果表明负压空化法优越于其它方法。

    负压空化法是一种提取虾青素的新方法, 它运用气泡的空化作用将原有的先破壁、后浸提的2步提取工艺缩短为一步完成, 适用于工业生产。一般认为运用此方法提取虾青素时,材料的细胞壁并没有破碎, 而是其通透性发生了改变, 这样就使存在于脂质中的虾青素通过细胞壁溶解在提取溶剂中, 从而实现了虾青素的高效提取。负压空化法更新了破壁提取的传统方法, 为虾青素的提取工艺提供新的思路。

    虾青素作为分布极为广泛的叶黄素,具有独特的着色功能,也能够促进抗体的产生,增强动物的免疫力;在抗氧化性、清除自由基方面,其能力强于β-胡萝卜素;具有水溶性和亲脂性,易溶于二硫化碳、丙酮、苯和氯仿等有机溶剂。因此,虾青素是一种极具潜力的类胡萝卜素添加剂,在食品、饲料、化妆品、医药等领域有着广阔的应用前景。

  • 图  1   用E-ACC/M-CGC引物组合扩增的PII的部分AFLP电泳图谱

    左边二道为雌雄亲本,其余为子代个体

    Figure  1.   Partial AFLP electrophoretic gel for Indian P.fucata family (PII)amplified using E-ACC/M-CGC primer combination

    The first two lanes on the left are female and male parents, respectively.The other lanes represent the F1 individuals.

    图  2   合浦珠母贝家系的UPGMA分子系统树

    PII. 印度贝♀×印度贝♂;PSI. 三亚贝♀×印度贝♂;PSS. 三亚贝♀×三亚贝♂

    Figure  2.   UPGMA tree of P.fucata families based on NEI & LI′s(1979) genetic distance

    PII. Indian P.fucata♀×P.fucata♂; PSI. Sanya P.fucata♀×Indian P.fucata♂; PSS. Sanya P.fucata♀×P.fucata

    表  1   AFLP分子标记在合浦珠母贝家系内的遗传分离与家系遗传多样性

    Table  1   Genetic segregation and diversity within P.fucata families using AFLP markers

    家系
    family
    样本数
    no.
    位点数
    no. loci
    分离位点数
    no. segregating loci
    N S P0.05 hS±S.E. VarI% VarL%
    1:1 3:1
    PII 25 57 12a/10b 23a/5b 7 87.7 100.0 0.434±0.011 52.2 47.8
    PSI 25 54 14a/9b 8a/0b 23 57.4 94.7 0.331±0.022 27.6 72.4
    PSS 26 53 14a/0b 12a/11b 16 69.8 93.0 0.366±0.019 25.6 74.4
    注:N. 不分离位点数;S.分离位点比例;P0.05. 多态位点比例;hS. 家系内的基因多样性;VarI%. 个体差异产生的方差比例;VarL%. 位点差异产生的方差比例;a. 符合孟德尔分离规律的位点数;b. 不符合孟德尔分离规律的位点数
    Note:N. number of non-segregating loci;S. proportion of segregated loci;P0.05. proportion of polymorphic loci at 5% level;hS. gene diversity within family;VarI% and VarL%. percentage of variance due to sampling of individuals and loci, respectively;a. loci segregating in Mendelian ratio;b. loci segregating in distortion
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    表  2   合浦珠母贝家系间的遗传分化(下三角)与遗传距离(上三角)

    Table  2   Pairwise GST (the lower diagonal) and NEI & LI′s (1979) genetic distances (the upper diagonal) among the three P.fucata families

    家系
    family
    印度贝♀×印度贝♂
    Indian P.fucata×P.fucata
    三亚贝♀×印度贝♂
    Sanya P.fucata♀×Indian P.fucata
    三亚贝♀×三亚贝♂
    Sanya P.fucata♀×P.fucata
    PII PSI PSS
    PII - 0.144 0.121
    PSI 0.182 - 0.157
    PSS 0.147 0.214 -
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出版历程
  • 收稿日期:  2007-05-14
  • 修回日期:  2007-05-30
  • 刊出日期:  2007-10-04

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