合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究

王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民

王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民. 合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究[J]. 南方水产科学, 2007, 3(5): 54-60.
引用本文: 王小玉, 喻达辉, 黄桂菊, 郭奕惠, 杜博, 龚世园, 王爱民. 合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究[J]. 南方水产科学, 2007, 3(5): 54-60.
WANG Xiaoyu, YU Dahui, HUANG Guiju, GUO Yihui, DU Bo, GONG Shiyuan, WANG Aimin. Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata[J]. South China Fisheries Science, 2007, 3(5): 54-60.
Citation: WANG Xiaoyu, YU Dahui, HUANG Guiju, GUO Yihui, DU Bo, GONG Shiyuan, WANG Aimin. Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata[J]. South China Fisheries Science, 2007, 3(5): 54-60.

合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究

基金项目: 

广东省科技计划项目 2002B2150101

广东省自然科学基金项目 037148

详细信息
    作者简介:

    王小玉(1976-), 女, 硕士, 从事海洋生物遗传育种研究。E-mail: yuerxitan@163.com

    通讯作者:

    喻达辉, E-mail: pearlydh@163.com

  • 中图分类号: Q753

Genetic segregation of AFLP markers and genetic diversity in three F1 families of pearl oyster Pinctada fucata

  • 摘要:

    对AFLP标记在合浦珠母贝(Pinctada fucata)印度家系(印度贝♀×印度贝♂,PII)、杂交家系(三亚贝♀×印度贝♂,PSI)和三亚家系(三亚贝♀×三亚贝♂,PSS)的遗传分离及3个家系的遗传多样性进行了分析。3对引物共产生57个位点,分离位点比例为57.4%~87.7%,符合孟德尔规律的分离位点为70.0%~71.0%;1 : 1分离位点占总分离位点的24.0%~45.2%,其中杂交家系的比例最高。3个家系的多态位点比例为93.0%~100.0%,总基因多样性为0.460。家系内的基因多样性为PII 0.434,PSI 0.331,PSS 0.366,平均为0.377±0.030。家系间的遗传分化显著(GST=0.180)。遗传距离分析表明,PSI与PSS之间的遗传距离最大(0.157),PII与PSS之间的遗传距离最小(0.121)。UPGMA系统树表明,PII和PSS的亲缘关系较近,而PSI与这2个家系较远。上述结果表明,第一代家系的遗传多样性仍很高,但家系之间的遗传分化较大。该研究结果对育种过程中遗传资源管理具有一定指导作用。

    Abstract:

    Genetic segregation of AFLP markers in three Pinctada fucata families, i.e. Indian family (Indian♀× Indian♂, PII), hybrid family (Sanya♀×Indian♂, PSI) and Sanya family (Sanya♀×Sanya♂, PSS) as well as their genetic variation was investigated. Three pairs of primers generated 57 loci, among which 57.4%~87.7% were segregated in F1. The proportion of loci segregated in Mendelian ratio over segregated loci ranged from 70.0% to 71.0%, of which 24.0%~45.2% segregated in 1 : 1 ratio. Hybrid family had the highest ratio of 1 : 1 segregating markers. The proportion of polymorphic loci was 93.0%~100.0% for the three families using 0.95 criterion. An overall genetic diversity (HT) was 0.460 and within-family genetic diversities (hS) were 0.434, 0.331, 0.366 for families PII, PSI, PSS, respectively, with an average of 0.377±0.030 (HS). Genetic differentiation among the three families was significant (GST=0.180). Analysis of genetic distances showed that Sanya family PSS was most distant from hybrid family PSI (0.157) while nearest to the Indian family PII (0.121).The UPGMA tree indicated that the two pure families PII and PSS were closely related and grouped together. These observations indicated that genetic variation in F1 family is high while genetic differentiation among families is great and significant. These findings shall be useful in management of genetic resources during breeding of pearl oysters.

  • 鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)隶属于柔鱼科鸢乌贼属,广泛分布在印度洋、太平洋的赤道和亚热带等海域,以印度洋西北部海域的资源量为最大[1]。前苏联和日本学者[2-3]曾多次对印度洋鸢乌贼资源进行调查,同时根据种类的发光器、形态特征、肥满度等初步分为大型、中型和小型3个群体,主要是侧重于对其资源量的研究;SNYDER[4]曾对阿拉伯海鸢乌贼大型群体进行了生物学的初步研究;杨德康[5]根据中国拖网渔船在亚丁湾海域兼捕的鸢乌贼,从捕捞时间和渔获物的性腺成熟度来分析,认为鸢乌贼由春生群、夏生群和秋生群3个群体组成;我国于2003~2005年对印度洋西北部海域鸢乌贼资源进行调查研究,对其资源密度及其分布、钓捕技术、渔场形成机制与海洋环境因子之间的关系等作了较全面的分析,对其生物学特性也作了初步分析[6-9],但是对该海域鸢乌贼的种群及其遗传结构没有作出进一步研究。文章是根据2004~2005年2次对印度洋西北部公海海域(13°N~20°N、59°E~64°E)鸢乌贼资源调查中所采集的鸢乌贼肌肉样本,利用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)检测方法,对该海域鸢乌贼种群及其遗传结构进行研究,为其资源评估、群体数量变动分析提供最基础的资料。

    根据2004年9~12月和2005年3~5月2次印度洋西北部公海海域鸢乌贼资源调查结果,在27个站点中共采集鸢乌贼肌肉样本200尾(表 1),其胴长范围为20.3~53.0 cm,平均胴长为36.7 cm。肌肉样本用75%的酒精固定并保存于4℃的冰箱中备用。根据形态学特征及其空间分布,选取了12个站点48尾鸢乌贼的肌肉样本进行RAPD分析(图 1)。

    表  1  印度洋西北部海域鸢乌贼肌肉样品取样时间、地点、样本尾数以及分析的样本尾数
    Table  1.  Sampling localities, sampling dates, total numbers and the numbers used for RAPD analysis ofS.oualaniensis in the northwestern Indian Ocean
    取样时间
    sampling date
    经度/°N
    longitude
    纬度/°E
    latitude
    尾数/ind
    number
    RAPD分析尾数/ind
    numbers used for RAPD analysis
    2004-10-11 65.25 12.78 5 0
    2004-10-12 63.37 13.45 5 0
    2004-10-14 62.55 14.55 5 0
    2004-10-15 62.35 16.38 5 4
    2004-10-16 62.33 18.93 5 4
    2004-10-18 63.00 18.88 5 4
    2004-10-21 63.93 18.95 5 4
    2004-10-22 63.48 18.47 5 0
    2004-10-24 62.83 18.12 5 4
    2004-10-25 61.45 17.17 5 0
    2004-10-26 61.45 17.72 5 0
    2004-10-27 61.50 17.78 10 0
    2004-10-31 60.93 16.32 10 4
    2004-11-01 60.92 15.57 10 0
    2004-11-02 59.42 15.08 10 0
    2004-11-06 59.67 13.17 10 4
    2004-11-07 60.10 13.33 10 4
    2004-11-09 60.92 14.13 10 0
    2004-11-10 61.02 14.50 10 4
    2004-11-12 60.72 14.42 10 4
    2004-11-14 60.78 16.97 10 4
    2004-11-15 60.53 16.87 10 0
    2004-11-17 60.82 15.87 10 4
    2004-11-20 60.45 15.40 10 0
    2005-03-27 60.43 13.00 4 0
    2005-03-31 60.00 15.00 5 0
    2005-04-03 61.05 16.95 6 0
    合计 total 200 48
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格
    图  1  遗传多样性分析的样品采集站点
    Figure  1.  Sampling localities of S.oualaniensis used for RAPD analysis in the northwestern Indian Ocean

    取肌肉样本25~30 mg加液氮后碾碎,-70℃保存备用。采用基因组DNA纯化试剂盒(SK1252,Sangon公司生产)提取基因组DNA。用Beckman DU-650紫外分光光度计检测DNA的含量,并用1%的琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA的质量。检测后的基因组DNA放置于-20℃冰箱中备用。

    PCR-RAPD所采用的随机引物由上海Sangon公司合成。扩增反应中体积为25 μL,其中包括10×Taq buffer 2.5 μL,dNTPs(Fermentas公司生产,25 mol·L-1)0.5 μL,MgCl2(Fermentas公司生产,25 mmol·L-1)2.5 μL,Taq DNA Polymerase(Fermentas公司生产,5 μ·μL-1)0.2 μL,随机引物(Sangon公司生产,50 μmol·μL-1)0.5 μL,基因组DNA 1μL(50~100 ng·μL-1),ddH2O 17.8 μL。

    PCR扩增在GeneAmp PCR System 9700 PCR仪上进行,所有样本对每一个引物都进行1~2次扩增反应。反应条件为经94℃预变性2 min后,接着40个循环,每个循环包括94℃变性15 s,35℃复性60 s,72℃延伸90 s,最后是72℃终延伸10 min,4℃保温。扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳分离,EB染色,凝胶成像系统(genius bio imaging system,GENE公司生产)观察、拍照并记录。

    根据电泳后记录下清晰的扩增条带进行数据统计,在RAPD图谱中相对位置无条带的用“0”表示,在相对位置有条带的用“1”表示,将RAPD图谱转化成0、1矩阵,利用Popgene 1.31软件计算不同站点鸢乌贼样本的遗传相似度(S)和遗传距离(D)。计算公式为:

    $$ S=\frac{2 N_\mathtt{x y}}{N_\mathtt{x}+N_\mathtt{y}} ; D=1-S $$

    式中Nxy为X、Y 2个样本共有的扩增条带,NxNy分别为X、Y样本各自拥有的扩增带。

    采用PHYLIP(phylogeny inference package,Ver.3.5)软件包中的NEIGHBOR程进行UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic average)聚类分析。参照恽锐等[10]的方法,用Shannon多样性指数计算种群的遗传多样性,其平均值即为种群的遗传多样性。计算公式为:

    $$ h=-\sum p_i \log _2 p_i $$

    式中pi为某位点的表型频率,包括有带样本的频率和无带样本的频率,h为该位点的表型多样性,即样本在该位点出现“有带”或“无带”的不确定性。

    利用Arlequin 2.0软件进行分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA),计算其遗传分化指数(GST),GST即为种群间的遗传多样性占种群多样性的比例,以检测鸢乌贼种群内和种群间的遗传变异情况的显著性。计算公式为:

    $$ G_{\mathrm{ST}}=\frac{H_{\mathrm{T}}-H_{\mathrm{S}}}{H_{\mathrm{T}}} $$

    式中HT为种群的总遗传多样性,HS为种群内平均遗传多样性。

    PCR-RAPD试验所使用的16个随机引物中,经过筛选,选取扩增条带丰富且稳定性好的8个引物进行分析,引物序列见表 2。每个引物均可得到条带清晰且重复性好的扩增图谱,扩增条带为3~8,其分子量大小为200~1 500 bp。图 2为引物R8的扩增图谱。

    表  2  所用的随机引物及其序列
    Table  2.  Primers and their sequence used for RAPD analysis
    引物
    primers
    序列
    sequence
    引物
    primers
    序列
    sequence
    R1 5′-ccatcctacc R5 5′-ccatggtgtc
    R2 5′-acagtaccgcc R6 5′-aaccgcgtcc
    R3 5′-gatggctgtg R7 5′-ctcaccgtcc
    R4 5′-ctccccaact R8 5′-acggcgtatg
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格
    图  2  随机引物R8对鸢乌贼肌肉样本的RAPD扩增图谱
    1~16号样本来源于18°N~20°N海域
    Figure  2.  RAPD electrophoresis pattern of S.oualaniensis muscle samples using primer R8
    No.1~16 sampled from 18°N~20°N in the northwestern Indian Ocean.

    将RAPD图谱转化成0、1矩阵,经过POPGENE 1.31处理,根据NEI[11]的方法可得出各个样本间的遗传相似性指数(S)和遗传距离(D)。根据遗传距离,利用PHYLIP软件包中的NEIGHBOR程序进行UPGMA聚类分析,得出48尾鸢乌贼样本的聚类图(图 3)。

    图  3  基于鸢乌贼样本的遗传距离聚类图
    1~16号样本来源于18°N~20°N海域;17~48号样本来源于13°N~18°N海域
    Figure  3.  Dendrogram revealed by UPGMA analysis of S.oualaniensis using Nei′s (1972) genetic distance
    No.1~16 sampled from18°N~20°N in the northwestern Indian Ocean; No.17~48 sampled from 13°N~18°N in the northwestern Indian Ocean.

    图 3可知,18°N~20°N海域4个站点的16尾样本聚集在一起,且样本间的最大遗传距离为0.4858,可以推测认为,该海域的鸢乌贼形成一个种群。而在13°N~18°N海域的8个站点的32尾样本中,除第23号样本外,其余样本都聚集在一起,且样本间的最大遗传距离为0.4767,该海域的鸢乌贼也同样形成一个种群。因此,根据UPGMA聚类分析,可以得出在13°N以北的印度洋西北部海域鸢乌贼存在2个不同种群,且2个种群之间的遗传距离为0.1338,遗传相似性指数为0.8748。

    利用Shannon多样性指数计算印度洋西北部海域鸢乌贼种群的遗传多样性,其平均值即为种群的遗传多样性。计算结果表明,印度洋西北部海域鸢乌贼种群平均每个位点的多样性指数为0.3676±0.1801,由此可以看出其种群的遗传多样性较高,种群分化较大。

    根据获得的RAPD扩增带,计算种群间的多态位点比例(表 3),2个种群多态位点比例分别为68.75%和93.75%,这说明印度洋西北部海域鸢乌贼2个种群均保持较高的遗传多样性。以种群内不同扩增图谱类型之间的遗传差异值为基础,计算种群的遗传多样性,18°N~20°N海域鸢乌贼种群的遗传多样性为0.2072,13°N~18°N海域鸢乌贼种群为0.1656,其平均值为0.1864。

    表  3  印度洋西北部海域鸢乌贼种群多态位点比例与遗传多态性
    Table  3.  Proportion of polymorphic loci and genetic diversity of S.oualaniensis populations in the northwest Indian Ocean
    内容
    content
    18°N~20°N种群
    population located in 18°N~20°N
    13°N~18°N种群
    population located in 13°N~18°N
    多态位点比例/%
    proportion of polymorphic loci
    68.75 93.75
    遗传多态性(平均值±标准差)
    genetic diversity (Mean±SE)
    0.2072±0.1928 0.1656±0.1441
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格

    GST是用来判断种群间的遗传分化情况,当GST < 0.05时,种群间没有遗传分化;当0.05 < GST < 0.15时,种群间的遗传分化程度为中等;当0.15 < GST < 0.25时,种群间有高度的分化;当GST>0.25时,种群间的分化程度非常高。印度洋西北部12°N以北海域鸢乌贼种群总遗传多样性为0.2375,种群内平均遗传多样性为0.1864,可以得出其种群间遗传分化指数为0.2150,即21.5%的遗传变异来自于种群间,而78.5%来自于种群内。该结果表明,不同种群间在遗传背景上存在较大的差异,且种群内的遗传变异水平较高。

    通过对印度洋西北部海域鸢乌贼样本的RAPD分析,并根据遗传距离对其进行UPGMA聚类,发现18°N~20°N海域4个站点的16尾鸢乌贼样本聚集在一起,形成了一个种群,而13°N~18°N海域8个站点的32尾鸢乌贼样本聚集在一起,形成了另一个种群。对这2个不同种群的形态学参数进行统计,18°N~20°N海域鸢乌贼胴长为45.4~53.0 cm,平均胴长为48.9±2.81 cm,而13°N~18°N海域胴长为20.3~51.2 cm,平均胴长为36.3±8.03 cm,优势胴长为32.0~42.0 cm。经单因素方差(ANOVA)分析2个种群间的胴长的P=0.00002 < 0.05,差异性显著。陈新军等[12]认为印度洋西北部海域鸢乌贼分为形态特征存在一定差异性的3个种群:大型种群、中型种群和小型种群,其中大型种群主要分布在18°N以北海域,中型种群主要分布在12°N~18°N海域,小型种群主要分布在12°N以南及赤道附近海域,且这3个种群重叠分布;谷津明彦[3]也认为该海域的鸢乌贼存在3个不同体型的种群,此文所得出的种群结构与陈新军、谷津明彦等研究的结果基本一致。因此,印度洋西北部13°以北海域鸢乌贼种群在形态学与遗传上都可以被区分为18°N~20°N、13°N~18°N 2个不同的种群。

    Shannon多样性指数表示种群间的多样性占总多样性的比例,可以用来估测遗传多样性在种群内和种群间的分布,即估测种群的遗传分化程度。利用Shannon多样性指数计算出的印度洋西北部海域鸢乌贼的遗传多样性指数为0.3676±0.1801,为较高的水平。由于其遗传多样性水平较高,种群分化较大,从侧面可以说明印度洋西北部海域鸢乌贼2个种群在形态上差别很大的原因。

    另外,此研究结果还揭示,与18°N~20°N海域鸢乌贼种群相比,13°N~18°N海域鸢乌贼种群拥有较高的多态性位点比例,而遗传多态性却相对较低(表 3),这一结果可能与所选用8条RAPD引物有关;笔者因此推测出13°N~18°N海域鸢乌贼可能所受的捕捞压力相对较大,生长速度较快。基于此研究的分析结果,该海域鸢乌贼2个种群间在遗传背景上存在较大的差异,且种群内的遗传变异水平较高,笔者认为,对该海域鸢乌贼资源的规模性开发还处于较合理水平。

    种以下类群包括亚种、品种及地理种群等,遗传分析的目的在于了解遗传多样性、鉴别种群、分析种群间的差异大小和微进化等,多数学者采用2种方法对RAPD结果进行处理并对上述问题进行探讨[13-15]:(1)寻找种群的特有遗传标记,据此可以鉴别不同的种群;(2)基于遗传相似率的分析,包括相似率比较、遗传距离分析、聚类分析等。此研究在进行RAPD实验过程中未能寻找到用于区分印度洋西北部海域鸢乌贼2个种群的RAPD分子标记,这可能是由于在此次实验中使用引物较少的原因所造成的。因而,此研究选用了第2种分析方法。

    RAPD技术能够快速、简便地检测大量基因组DNA的遗传变异,只要采用适当的分析方法,不仅可以用于鉴定头足类资源的品系、种群结构并探讨其进化关系,还可以在探讨头足类种群分化等方面发挥重要作用。

  • 图  1   用E-ACC/M-CGC引物组合扩增的PII的部分AFLP电泳图谱

    左边二道为雌雄亲本,其余为子代个体

    Figure  1.   Partial AFLP electrophoretic gel for Indian P.fucata family (PII)amplified using E-ACC/M-CGC primer combination

    The first two lanes on the left are female and male parents, respectively.The other lanes represent the F1 individuals.

    图  2   合浦珠母贝家系的UPGMA分子系统树

    PII. 印度贝♀×印度贝♂;PSI. 三亚贝♀×印度贝♂;PSS. 三亚贝♀×三亚贝♂

    Figure  2.   UPGMA tree of P.fucata families based on NEI & LI′s(1979) genetic distance

    PII. Indian P.fucata♀×P.fucata♂; PSI. Sanya P.fucata♀×Indian P.fucata♂; PSS. Sanya P.fucata♀×P.fucata

    表  1   AFLP分子标记在合浦珠母贝家系内的遗传分离与家系遗传多样性

    Table  1   Genetic segregation and diversity within P.fucata families using AFLP markers

    家系
    family
    样本数
    no.
    位点数
    no. loci
    分离位点数
    no. segregating loci
    N S P0.05 hS±S.E. VarI% VarL%
    1:1 3:1
    PII 25 57 12a/10b 23a/5b 7 87.7 100.0 0.434±0.011 52.2 47.8
    PSI 25 54 14a/9b 8a/0b 23 57.4 94.7 0.331±0.022 27.6 72.4
    PSS 26 53 14a/0b 12a/11b 16 69.8 93.0 0.366±0.019 25.6 74.4
    注:N. 不分离位点数;S.分离位点比例;P0.05. 多态位点比例;hS. 家系内的基因多样性;VarI%. 个体差异产生的方差比例;VarL%. 位点差异产生的方差比例;a. 符合孟德尔分离规律的位点数;b. 不符合孟德尔分离规律的位点数
    Note:N. number of non-segregating loci;S. proportion of segregated loci;P0.05. proportion of polymorphic loci at 5% level;hS. gene diversity within family;VarI% and VarL%. percentage of variance due to sampling of individuals and loci, respectively;a. loci segregating in Mendelian ratio;b. loci segregating in distortion
    下载: 导出CSV

    表  2   合浦珠母贝家系间的遗传分化(下三角)与遗传距离(上三角)

    Table  2   Pairwise GST (the lower diagonal) and NEI & LI′s (1979) genetic distances (the upper diagonal) among the three P.fucata families

    家系
    family
    印度贝♀×印度贝♂
    Indian P.fucata×P.fucata
    三亚贝♀×印度贝♂
    Sanya P.fucata♀×Indian P.fucata
    三亚贝♀×三亚贝♂
    Sanya P.fucata♀×P.fucata
    PII PSI PSS
    PII - 0.144 0.121
    PSI 0.182 - 0.157
    PSS 0.147 0.214 -
    下载: 导出CSV
  • [1]

    LIU Z J, CORDES J F. DNA marker technologies and their applications in aquaculture genetics[J]. Aquac, 2004, 238(1): 1-37. https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/Ch9QZXJpb2RpY2FsRU5HTmV3UzIwMjQwOTEwMTY1MjU1EiBiYWRiMzM5ODk3YWI1NzRhY2UyZGQxMDkyMDk0ZWM1ZhoINzYzeGw5MWg%3D

    [2]

    LI L, GUO X. AFLP-based genetic linkage maps of the Pacific oyster Crassostrea gigas Thunberg[J]. Mar Biotechnol, 2004, 6(1): 26-36. doi: 10.1007/s10126-003-0001-0

    [3] 喻达辉, 王小玉, 黄桂菊, 等. 合浦珠母贝遗传连锁图谱的构建[J]. 中国水产科学, 2007, 14(3): 361-368. doi: 10.3321/j.issn:1005-8737.2007.03.003
    [4]

    YU Z, GUO X. Genetic linkage of the Eastern Oyster, Crassostrea virginica Gmelin[J]. Biol Bull, 2003, 204(3): 327-338. doi: 10.2307/1543603

    [5] 喻达辉, 王小玉, 郭奕惠, 等. RAPD标记在合浦珠母贝家系F1代的分离方式[J]. 南方水产, 2005, 1(6): 1-7. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2005.06.001
    [6]

    LIU Z, NICHOLS A, LI P, et al. Inheritance and usefulness of AFLP markers in channel catfish (Ictalurus punctatus), blue catfish (I. furcatus), and their F1, F2, and backcross hybrids[J]. Mol Gene Genet, 1998, 258(4): 260-268. doi: 10.1007/s004380050730

    [7]

    WOLFUS G M, GARCIA D K, ALCIRVAR-WARREN A. Application of the microsatellite technique for analyzing genetic diversity in shrimp breeding programs[J]. Aquac, 1997, 152(1): 35-47. doi: 10.1016/S0044-8486(96)01527-X

    [8]

    GARCIA D K, FAGGART M A, RHOADES L, et al. Genetic diversity of cultured Penaeus vannamei shrimp using three molecular genetic techniques[J]. Mol Mar Biol Biotechnol, 1994, 3(5): 270-280. https://www.cqvip.com/doc/journal/3131933463

    [9]

    SAMBROOK J, FRITSCH E F, MANIATIS T. Molecular cloning: a laboratory manual [M]. 2nd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989: 954-955.

    [10] 郭奕惠, 黄桂菊, 喻达辉. 合浦珠母贝DNA的抽提和RAPD反应体系的优化[J]. 南方水产, 2006, 2(4): 59-64. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2006.04.010
    [11]

    VOS P, HOGERS R, BLEEKER M, et al. AFLP: new technique for DNA fingerpringting[J]. Nucleic Acids Res, 1995, 23(21): 4 407-4 414. doi: 10.1093/nar/23.21.4407

    [12]

    YU D H, CHU K H. Low genetic differentiation among widely separated populations of the pearl oyster Pinctada fucata as revealed by AFLP[J]. J Exp Mar Biol Ecol, 2006, 333(1): 140-146. doi: 10.1016/j.jembe.2005.12.046

    [13]

    ZHIVOTOVSKY L A. Estimating population structure in diploids with multilocus dominant DNA markers[J]. Mol Ecol, 1999, 8(6): 907-913. doi: 10.1046/j.1365-294x.1999.00620.x

    [14]

    VEKEMANS X, BEAUWENS T, LEMAIRE M, et al. Data from amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers show indication of size homoplasy and of a relationship between degree of homoplasy and fragment size[J]. Mol Ecol, 2002, 11(1): 139-151. doi: 10.1046/j.0962-1083.2001.01415.x

    [15]

    LYNCH M, MILLIGAN B G. Analysis of population genetic structure with RAPD markers[J]. Mol Ecol, 1994, 3(1): 91-99. doi: 10.1111/j.1365-294X.1994.tb00109.x

    [16]

    KRAUSS S L. Accurate gene diversity estimates from amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers[J]. Mol Ecol, 2000, 9(9): 1 241-1 245. doi: 10.1046/j.1365-294x.2000.01001.x

    [17]

    KUMAR S, TAMURA K, NEI M. MEGA3: an integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment[J]. Brief Bioinformatics, 2004, 5(2): 150-163. doi: 10.1093/bib/5.2.150

    [18]

    NEI M, LI W H. Mathematical model for studying genetic variation in term of restriction endonucleases[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1979, 76(10): 5 269-5 273.

    [19] 房经贵, 章镇, 马正强, 等. AFLP标记在两个芒果品种间杂交F1代的多态性及分离方式[J]. 中国农业科学, 2000, 33(3): 19-24. doi: 10.3321/j.issn:0578-1752.2000.03.004
    [20] 尹佟明, 黄敏仁, 王明庥, 等. 利用RAPD标记构建响叶杨和银白杨分子标记连锁图谱[J]. 植物学报, 1999, 41(9): 956-961. doi: 10.3321/j.issn:1672-9072.1999.09.009
    [21] 甘四明, 施季森, 白嘉雨, 等. RAPD标记在桉属种间杂交一代的分离方式研究[J]. 林业科学研究, 2001, 14(2): 125-130. doi: 10.3321/j.issn:1001-1498.2001.02.002
    [22] 刘孟军, SHIN Y U, YAE B W. RAPD标记在苹果属种间杂交一代的分离方式[J]. 园艺学报, 1998, 25(3): 214-219. https://www.cqvip.com/doc/journal/957431610
    [23]

    YU D H, CHU K H. Genetic variation in wild and cultured populations of the pearl oyster Pinctada fucata in southern China[J]. Aquac, 2006, 258(1/4): 220-227. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2006.03.024

    [24]

    YU Z, GUO X. Genetic analysis of selected strains of the eastern oyster (Crassostrea virginica Gmelin) using AFLP and microsatellite markers[J]. Mar Biotechnol, 2004, 6(6): 575-86. https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/Ch9QZXJpb2RpY2FsRU5HTmV3UzIwMjQwOTEwMTY1MjU1EiA2MTBjYmQ2NTI2NTkwODkyNDM4NTYyMDcyZTQ4NTc3YxoIend0ZzgzcXA%3D

    [25]

    BOPPENMAIER J, MELCHINGER A E, SEIT G, et al. Genetic diversity for RFLPs in European maize inbreds: Ⅲ. Relation to performance of crosses within versus between heterotic groups for grain traits[J]. Plant Breeding, 1993, 111(2): 217-226. doi: 10.1111/j.1439-0523.1993.tb00632.x

    [26]

    BENZIE J A H, BALLMENT E, FORBES A T, et al. Mitochondrial DNA variation in Indo-Pacific populations of the giant tiger prawn, Penaeus monodon[J]. Mol Ecol, 2002, 11(12): 2 553-2 569. https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/Ch9QZXJpb2RpY2FsRU5HTmV3UzIwMjQwOTEwMTY1MjU1EiBkOGI0YjM1OGFlNGIxZjhiODc0MDkzODQ0NjM1M2ZiNRoIaHdoNzU5ZnA%3D

图(2)  /  表(2)
计量
  • 文章访问数:  5483
  • HTML全文浏览量:  151
  • PDF下载量:  2887
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2007-05-14
  • 修回日期:  2007-05-30
  • 刊出日期:  2007-10-04

目录

/

返回文章
返回