广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析

孙奉玉, 宋忠魁, 赵鹏, 聂振平, 苏琼, 王芳宇

孙奉玉, 宋忠魁, 赵鹏, 聂振平, 苏琼, 王芳宇. 广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析[J]. 南方水产科学, 2012, 8(2): 30-35. DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2012.02.005
引用本文: 孙奉玉, 宋忠魁, 赵鹏, 聂振平, 苏琼, 王芳宇. 广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析[J]. 南方水产科学, 2012, 8(2): 30-35. DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2012.02.005
SUN Fengyu, SONG Zhongkui, ZHAO Peng, NIE Zhenping, SU Qiong, WANG Fangyu. RAPD analysis of genetic diversity of Scylla paramamosain population in Guangxi and neighboring sea areas[J]. South China Fisheries Science, 2012, 8(2): 30-35. DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2012.02.005
Citation: SUN Fengyu, SONG Zhongkui, ZHAO Peng, NIE Zhenping, SU Qiong, WANG Fangyu. RAPD analysis of genetic diversity of Scylla paramamosain population in Guangxi and neighboring sea areas[J]. South China Fisheries Science, 2012, 8(2): 30-35. DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2012.02.005

广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析

基金项目: 

广西科学基金项目 0991189

广西科学研究与技术开发计划项目 09322003

广西科学研究与技术开发计划项目 11107012-11

广西海洋生物技术重点实验室主任基金项目 GKLMBT-D0801

详细信息
    作者简介:

    孙奉玉(1982-),男,硕士研究生,从事水产生物技术研究。E-mail: sfyumail@163.com

    通讯作者:

    宋忠魁,E-mail: songsir2003@yahoo.com.cn

  • 中图分类号: S917.4

RAPD analysis of genetic diversity of Scylla paramamosain population in Guangxi and neighboring sea areas

  • 摘要:

    采用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹(Scylla paramamosain)6个地理群体的遗传变异和遗传结构,8条10 bp寡核苷酸随机引物扩增99个个体,分析其中的44个位点,31个位点表现出多态性,在种水平的多态位点百分率为70.45%。POPGENE分析结果显示,6个群体的多态位点百分率为29.55%~54.55%,平均为36.97%;群体的遗传多样性自高至低排列为钦州湾群体>党江群体>珍珠湾群体>闸口群体>清化群体>流沙湾群体;群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异,群体间的遗传分化程度较大。AMOVA分析显示,群体内遗传变异占87.03%,群体间遗传变异占12.97%,群体间发生中等程度遗传分化。Mantel检测结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,群体间聚类无明显的地域性分布格局。

    Abstract:

    Random amplified polymorphic DNA (RAPD) technology was employed to investigate the genetic diversity and structure of 6 Scylla paramamosain populations in Guangxi and its neighboring sea areas. We amplified a total of 99 individuals by using 8 random primers with 10 bp in length, and analyzed 44 valid loci, among which 31 loci are disclosed as polymorphism. The percentage of polymorphic locus (PPL) at species level is 70.45%. According to POPGENE analysis, the PPL in the 6 populations ranges from 29.55% to 54.55% with an average of 36.97%. The abundance of genetic diversity is QZW>DJ>ZZW>ZK>QH>LSW. Variance within populations is higher than that among populations, and genetic differentiation among populations reaches higher level. An analysis of molecular variance (AMOVA) shows that variance within populations accounts for 87.03%, and that among populations accounts for 12.97%. However, genetic differentiation among populations only reaches medium level. Mantel test shows that no significant correlation between genetic and geographic distance is detected in the 6 S.paramamosain populations. Cluster analysis indicates that the distribution of these populations displays no apparent geographic pattern.

  • 细菌性疾病会对水产养殖业造成重大经济损失,目前水产动物细菌性疾病的治疗仍以抗生素为主,但由于不科学的药物使用,目前水产病原菌的耐药问题十分严重[1-2]。乳酸菌作为一类普遍认同的益生菌,其生长过程中能产生细菌素、过氧化氢和有机酸等代谢产物,这些代谢产物能抑制病原菌的繁殖和生长[3]。因此,作为一种抗生素替代物的乳酸菌受到越来越多的关注。

    乳酸菌应用于水产行业以来,研究多集中于促进水产动物生长、提高动物免疫力等方面,而其益生特性的研究则多集中于水产动物肠道定植、体外抑菌[4]以及对消化道低pH[5]和胆盐[6]环境的适应性方面。但乳酸菌是一类能利用可发酵糖产生大量乳酸的细菌统称,现有研究显示这类细菌中包含能分解明胶、导致溶血的致病菌[7];此外,细菌耐药基因转移的情况普遍存在[8],且已有研究指出大肠杆菌(Escherichia coli)和乳链球菌(Streptococcus lactis)之间能转移卡那霉素抗性[9]。因此,以具有溶血、分解明胶能力或耐药特性未知的乳酸菌菌株作为口服益生菌对机体有严重的安全隐患。目前对于水产领域应用乳酸菌的安全性评估相对薄弱,尤其是相关菌株耐药性的研究鲜有报道。故本研究对实验室保存的2株乳酸菌[乳酸菌S60 (干酪乳杆菌Lactobacillus casei) 和S72 (植物乳杆菌L. plantarum)]开展益生特性和安全性研究,评价其作为鱼类口服益生菌的可行性,为其后续的实际应用提供理论依据。

    实验中所用乳酸菌S60、S72和指示菌嗜水气单胞菌 (Aeromonas hydrophila)、维氏气单胞菌 (A. veronii)、无乳链球菌 (S. agalactiae)、迟缓爱德华氏菌 (Edwardsiella tarda)、创伤弧菌 (Vibrio vulnificus)、副溶血弧菌 (V. parahemolyticus)均由本实验室分离保存,且经16S rDNA和常规细菌学鉴定。

    LB培养基、MRS培养基、BHI培养基均购于青岛高科技工业园海博生物科技有限公司,明胶培养基 (杭州滨和微生物试剂有限公司),血平板 (广东环凯微生物科技有限公司),牛胆盐 (胆酸质量分数≥60%,叶源生物),5%脱纤维绵羊血(南京森贝伽生物科技有限公司),氨苄青霉素 (USP级)、硫酸卡那霉素 (USP级)、链霉素 (720 IU·mg−1)、恩诺沙星 (质量分数98%)、氟苯尼考 (质量分数98%) 和盐酸多西环素 (质量分数≥98%) 均购于上海阿拉丁生化科技股份有限公司,磺胺甲唑 (质量分数98%,上海麦克林生化科技有限公司)。血液生化试剂盒[(谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶 (AST)、乳酸脱氢酶 (LDH)]均购于上海执诚生物科技有限公司。

    全波长酶标仪 (Multiskan G,Thermo Scientific),高速冷冻离心机 (赛默飞世尔科技有限公司),细菌浊度仪SGZ-6AXJ (上海悦丰仪器仪表有限公司),全自动生化分析仪BS-400 (深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司),智能生化培养箱 (无锡华泽科技有限公司),震荡培养箱ZQL-180S (上海知楚仪器有限公司)。

    实验鱼为异育银鲫 (Carassius auratus),由中国水产科学研究院淡水渔业研究中心南泉基地提供,鱼体健康无伤,体质量为 (150±12) g,体长为 (17±3) cm (n=100)。实验前,异育银鲫于循环养殖系统中暂养2周,水温为 (26±1) ℃,持续充氧,光周期同自然光,使用商品化颗粒饲料饲喂,日投饵量按体质量的3%计算,一天3次。

    取乳酸菌菌种于MRS培养基中过夜培养活化 (30 ℃、180 r·min−1),次日将活化好的培养物100 μL接入5 mL新鲜MRS培养基 (30 ℃、180 r·min−1) 培养18 h,然后按1∶100稀释作为菌种,再以20 μL·mL−1接种,设置3个平行。分别在接种后的第0、第3、第6、第9、第12、第15、第24、第27、第30、第33和第36小时取菌液,使用酶标仪测定光密度 (OD600)。以时间为横坐标,OD600为纵坐标,绘制生长曲线。同时在接种后的第0、第12、第24、第36、第48、第60和第72小时检测发酵液pH,评价其产酸能力。

    参照杨媛媛等[10]方法检测耐酸能力;参照任世英等[11]方法制备含乳酸菌的MRS平板以检测菌株胆盐耐受能力。

    选择常见的水产病原菌——嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、无乳链球菌、迟缓爱德华氏菌、创伤弧菌、副溶血弧菌作为指示菌,参照杨媛媛等[10]方法,检测实验菌株的抑菌能力。最终将数据统一调整至菌斑直径为5 mm时的抑菌直径。计算公式为抑菌直径=(抑菌圈直径1/菌斑直径1+抑菌圈直径2/菌斑直径2+抑菌圈直径3/菌斑直径3)/3×5。

    参照任世英等[11]方法制备含指示菌的LB琼脂平板,对发酵液进行预处理以分析其所含抑菌物质特性。

    将含实验菌的菌液接种于明胶培养基,30 ℃培养48 h,取出置于4 ℃ 30 min。取出检查明胶培养基的状态;同时设置阴性对照组 (以无菌生理盐水代替实验菌) 和阳性对照组 (以嗜水气单胞菌代替实验菌)。接种实验菌的明胶培养基与阴性对照一样为完全凝固的状态,表示实验菌不分解明胶,若同阳性对照一样完全呈液态则表明实验菌能分解明胶,介于两者之间呈半固体则表明实验菌有较弱的分解明胶的能力。

    将活化的菌株划线接种于含有体积分数为5%脱纤维绵羊血的血琼脂平板上,30 ℃倒置培养24~48 h,观察记录菌落周围是否有溶血的透明圈。为避免实验菌产酸引起的溶血对血平板结果造成干扰,参照Mao等[12]的方法同时开展体外溶血实验。

    同1.4.2制备含实验菌的MRS平板,打孔备用 (每个平板打孔5个)。以生理盐水配置抗生素质量浓度为256 μg·mL−1、128 μg·mL−1、64 μg·mL−1、32 μg·mL−1和16 μg·mL−1的药液,按150 μL每孔加入到之前准备好的含实验菌的MRS平板,每个浓度重复3次。4 ℃扩散4 h后,转入培养箱30 ℃ 培养48 h后,测量记录抑菌圈直径,判读其抗生素耐受能力。

    将过夜培养的乳酸菌和嗜水气单胞菌,以5 000 r·min−1离心10 min收集菌体,PBS缓冲液洗涤3次。以PBS缓冲液调节乳酸菌浓度为1.0×109 CFU·mL−1,嗜水气单胞菌浓度为5.0×106 CFU·mL−1。设置4个处理组,每组3个平行,每个平行10尾鱼[空白对照组、S60组、S72组和嗜水气单胞菌(A.h)组]。对实验组每尾银鲫腹腔注射0.5 mL菌液,阴性对照组腹腔注射0.5 mL PBS缓冲液。每天定时检查实验鱼的死亡情况,持续观察96 h。96 h后将实验鱼捞出,麻醉 (MS-222 100 mg·mL−1) 检查鱼体,尾椎静脉取血,4 ℃、5 000 r·min−1离心10 min收集血浆供血液生化检测 (ALT、AST和LDH),剖检成活的实验鱼,观察内脏器官有无病变。

    实验数据差异性分析使用SPSS 24.0统计软件中的单因素方差分析 (One-Way ANOVA) 和独立样本t-检验分析,显著性水平设置为P<0.05。

    乳酸菌S60和S72的生长曲线呈典型的“S”形,可以观察到明显的迟缓期、对数生长期和稳定期 (图1)。从S72生长曲线上可以发现其迟缓期约为6 h,S60的迟缓期约为9 h,明显长于S72。表明在相同培养条件下,S72具有更快的生长速度,这与菌落形态方面的结果一致。

    图  1  生长曲线
    Fig. 1  Growth curve

    发酵液pH检测结果显示,乳酸菌S60和S72这2株的产酸最大值均出现在培养第24小时附近,2株乳酸菌的产酸能力基本一致,最低pH均约4.0 (图2)。

    图  2  2株乳酸菌的产酸能力
    Fig. 2  Acid production of two strains of lactic acid bacteria

    耐酸实验结果显示乳酸菌S60和S72经pH为4.5的PBS处理2 h后均能成活,由此显示2株乳酸菌能耐受pH为4.5的酸性环境。胆盐耐受实验结果显示,乳酸菌S60和S72能完全耐受0.1%的胆盐浓度,而在胆盐浓度>0.2%时,其生长受到了一定程度的抑制,可以观察到明显的抑菌圈 (表1)。

    表  1  乳酸菌对酸、胆盐的耐受能力
    Table  1  Acid and bile tolerance of two strains of lactic acid bacteria n=3
    pH乳酸菌 lactic acid bacteria胆盐/%
    bile salt
    抑菌圈直径/mm inhibition zone diameter
    S60S72S60S72
    3.5 0 8 8
    4.5 + + 0.1 8 8
    5.5 + + 0.2 12 12
    7.4 + + 0.3 15 16
    0.5 19 19
    注:−. 无菌生长;+. 有菌生长
    Note: −. bacteria can not grow; +. bacteria can grow
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    用嗜水气单胞菌作为指示菌,以1 mol·L−1 氢氧化钠 (NaOH)加热、胰蛋白酶和蛋白酶K分别处理发酵液上清作为实验组,未处理的发酵上清液为对照组,测定抑菌圈大小。结果显示,对照组有明显的抑菌圈,而实验组无。说明2株乳酸菌主要通过发酵过程中产生的有机酸 (低pH)实现了对嗜水气单胞菌的抑制作用。

    抑菌实验结果显示,2株乳酸菌均能不同程度地抑制6株指示菌的生长 (表2),其中对嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌和创伤弧菌的抑菌能力最强,对副溶血弧菌的抑菌效果次之,对无乳链球菌和迟缓爱德华氏菌的抑菌能力最弱。2株乳酸菌在同一种病原菌中的抑菌效果差异不显著 (P>0.05),而同一乳酸菌菌株对不同病原菌的抑菌效果差异显著 (P<0.05)。

    表  2  乳酸菌对鱼源致病菌的抑菌活性
    Table  2  Antimicrobial activity of two strains of lactic acid bacteria against six fish pathogens $\overline{{\mathit{\boldsymbol{ X }}}} {\bf \pm} {\bf{SD,}}\;{\mathit{\boldsymbol{n}}}{\bf = 5} $
    致病菌
    pathogens
    抑菌圈直径/mm inhibition zone diameter
    S60S72
    嗜水气单胞菌 A. hydrophila 26.88±2.43b 24.9±1.48C
    维氏气单胞菌 A. veronii 28.85±2.45b 28.25±2.46B
    创伤弧菌 V. vulnificus 33.87±1.96a 35.6±1.07A
    无乳链球菌 S. agalactiae 8.33±2.38d 9.7±0.96E
    副溶血弧菌 V. parahemolyticus 15.23±0.78c 13.1±1.82D*
    迟缓爱德华氏菌 E. tarda 9.23±2.42d 13.05±1.92D*
    注:不同大小写字母表示2株乳酸菌分别针对不同病原菌的抑菌能力的差异显著(P<0.05);*. 2株乳酸菌对同一病原菌的抑菌能力差异显著(P<0.05)Note: Different letters indicate statistical difference in bacteriostatic ability of the same lactobacillus strain among different pathogenic bacteria (P<0.05); *. statistical difference in bacteriostatic ability of different lactobacillus strains on the same pathogenic bacteria (P<0.05)
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    划线接种血平板24 h后,2株乳酸菌形成的菌落周围无明显变化,阳性对照组 (嗜水气单胞菌) 菌落周围出现了明显的透明圈。第48小时菌落周围颜色变淡,无明显透明圈出现,阳性对照组的透明圈进一步增大 (图3)。体外溶血实验显示,2株乳酸菌发酵液的溶血率与对照组无显著差异,溶血率约5.0%,而嗜水气单胞菌发酵液引起的溶血率显著高于对照组 (P<0.05),溶血率约72.0% (图4)。由此可见2株乳酸菌不存在溶血相关的毒力因子,也不存在溶血方面的隐患。

    图  3  2株乳酸菌在血平板上的溶血表现
    Fig. 3  Hemolysis activity of two strains of lactic acid bacteria on blood plate
    图  4  2株乳酸菌的溶血能力
    Fig. 4  Hemolytic activity of two strains of lactic acid bacteria

    2株乳酸菌接入明胶培养基培养48 h后,经4 ℃处理,与阴性对照组一样仍然保持凝固状态,而接种指示菌 (嗜水气单胞菌) 的阳性对照组呈液态 (图5)。由此显示2株乳酸菌均无降解明胶的能力,不存在相关风险。

    图  5  2株乳酸菌分解明胶的能力
    Fig. 5  Gelatinolytic activity of two strains of lactic acid bacteria

    药敏实验结果显示,2株乳酸菌总体上对硫酸卡那霉素、链霉素和磺胺甲唑耐药,对氨苄青霉素、恩诺沙星、氟苯尼考和多西环素敏感。然而通过进一步的比较分析则发现2株乳酸菌对2种氨基糖胺类抗生素耐药;但S72对2种氨基糖胺类抗生素的高浓度剂量仍有一定的敏感性,对恩诺沙星低浓度剂量则表现出完全耐受 (表3)。

    表  3  2株乳酸菌的耐药特性
    Table  3  Results of antibiotic susceptibility test of two strains of lactic acid bacteria
    菌株
    bacterial strain
    药物质量浓度/μg·mL−1 drug concentration
    S60 S72
    抑菌圈直径/mm
    inhibition zone diameter
    256 128 64 32 16 256 128 64 32 16
    氨苄青霉素 ampicillin 30 26 24 20 17 40 35 32 30 28
    硫酸卡那霉素 kanamycin 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8
    链霉素 streptomycin 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8
    恩诺沙星 enoxacin 26 21 19 17 10 19 16 13 8 8
    氟苯尼考 flufenicol 32 29 26 20 15 34 29 25 24 18
    盐酸多西环素 doxycycline 37 34 28 24 21 34 28 24 21 16
    磺胺甲唑 sulfamethoxazole 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
    生理盐水 physiological saline 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
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    鱼体攻毒后,S72组仅在第72小时出现了1尾死鱼,死亡鱼类注射部位有炎症和出血症状,体表其他部分也有广泛的出血现象。其他时间点并未出现死鱼现象。对照组和S60组在整个实验期间均无死鱼出现。阳性对照组在攻毒24 h后陆续出现死鱼的情况,在实验结束时的累计死亡率达46.67% (图6),且死亡鱼类在注射部位有炎症和出血现象,鱼体其他部位也有严重的出血现象。96 h后对存活的实验鱼进行检查,结果显示S60和S72组剩余的实验鱼体表在注射部位均有轻微的炎症迹象,而进一步解剖检查显示,鱼体腹腔无腹水存在,体内脏器无明显病变情况。

    图  6  细菌感染实验
    Fig. 6  Artificial infection experiment

    攻毒实验96 h后,鱼类血液生化检测结果显示S60和S72组鱼类血液ALT、AST和LDH 的水平和对照组无显著差异 (P>0.05,表4)。说明S60和S72攻毒并未造成鱼类组织损伤。而高达1.0×109 CFU·mL−1的细菌腹腔注射仅出现了1尾实验鱼的死亡,且第96小时血液生化检查结果显示剩余鱼类并未出现明显的组织损伤;与此同时嗜水气单胞菌以5.0×106 CFU·mL−1的浓度攻毒,却导致近50%的实验鱼死亡。由此可见,2株乳酸菌仍具有较高的安全性。

    表  4  2株乳酸菌对银鲫血液生化指标的影响
    Table  4  Effects of two strains of lactic acid bacteria on blood biochemical index of C. auratus challenged with two lactic acid bacteria U·L−1n=5
    项目
    index
    对照组
    control
    乳酸菌 lactic acid bacteria嗜水气单胞菌组
    A.h
    S60S72
    谷丙转氨酶 ALT6.39±1.946.19±3.244.96±1.844.21±1.19
    谷草转氨酶 AST323.52±65.91321.44±105.27391±133.81330.55±118.34
    乳酸脱氢酶 LDH116.53±38.9788.54±43.3965.14±37.2673.35±31.90
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    消化道中的pH和胆盐对细菌繁殖生长具有抑制作用,因此益生菌在消化道中的益生作用与其对消化道环境的耐受能力密切相关。人类医学研究表明消化道pH受饮食组成影响,食物的存在能提高益生菌在胃内的成活率[13]。此外,将壳聚糖等生物高分子与菌剂混合应用也能显著提高益生菌在低pH条件下的成活率[14]。而现有资料显示有胃鱼类的胃内pH最低能达2[15],因此本研究中的2株乳酸菌需要辅以饵料、生物高分子或经过一段时间的耐酸驯化[13]才能更好地应用于有胃鱼类。而无胃鱼类,如鲤科鱼类,其消化道内pH近中性[10],因此本研究中的2株乳酸菌能适应其消化道pH。

    胆汁能阻止细菌黏附到肠道黏膜的顶端,避免细胞损伤[6],但也对乳酸菌的生存产生了胁迫。本研究中的2株乳酸菌能耐受0.1%的胆盐,而参考海水鱼类数据,胆囊内胆盐含量在0.2%~1.0%,进入肠道会被进一步稀释[15]。并且胆盐质量浓度在0.03%~0.3%范围内波动的肠道环境,尚能分离到不耐受0.1%胆盐浓度的乳酸菌[13]。因此认为2株乳酸菌能耐受鱼类肠道中的胆盐环境。

    乳酸菌是目前公认的肠道有益微生物,大量研究显示乳酸菌对于肠道微生物群落稳定[14]、与人类[16]和水产养殖动物[4]的健康密切相关。虹鳟 (Oncorhynchus mykiss)[17]、凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)[18]和海参 (Apostichopus japonicus)[19]等养殖实验均显示在日粮中添加乳酸菌能促进养殖动物的生长,提高抗病力和肠道内有害菌产生竞争,发挥保护肠道的作用[20]。本研究结果显示乳酸菌S72比S60的繁殖速度快,更易取得竞争优势,和其他细菌竞争肠道上皮细胞的黏附位点[4,21]、营养物质[8]以及减少病原菌的定植[22];此外,乳酸菌能通过产生乳酸[23-24]、细菌素、过氧化氢及小分子肽类等[20,25]代谢产物对肠道致病菌产生抑菌或杀菌作用,而快速繁殖的能力也意味着更多活性物质的产生,从而发挥更强的抑菌或杀菌效果。本研究结果显示2株乳酸菌产生的抑菌物质均为代谢过程中产生的有机酸类,与其他关于乳酸菌抑菌物质的研究结果[3,23]类似,并非每一株乳酸菌都能产生所有类型的抑菌物质,可见乳酸菌产生的抑菌物质种类和菌株、菌种有关。而Kiymaci等[23]发现乳酸菌所产生的有机酸对病原菌不仅有抑制效果,而且能削弱病原菌的毒力。此外,胞外的一些成分如多糖、蛋白等也具有改善机体免疫[26]和吸附肠道内有害物质[27]的能力,但这些潜在功能有待研究论证。

    溶血素是病原菌致病的重要毒力因子,研究表明溶血素不仅表现为溶解红细胞,其具备的穿孔能力、酯酶活性或表面活性作用能损伤多种细胞,诱发细胞凋亡甚至造成细胞裂解死亡[28]。而乳酸菌是一类能利用糖产生乳酸的细菌统称,其中某些种属具有溶血能力,如闫肃等[7]研究发现,所检视的48株乳酸菌中有9株具有溶血活性。因此,需要对候选益生菌的溶血能力进行检测,从而避免相关毒力的风险。本研究中2株乳酸菌溶血活性的检测结果显示,在血平板实验培养后期 (48 h) 乳酸菌菌落周围有颜色变淡的情况出现,与闫肃等[7]研究中将近68.75%的乳酸菌菌株 (检视菌株总数48株) 的溶血表型一致,因此认为这一现象与低pH相关,且在进一步的体外溶血实验中得到证实。由此可见,2株乳酸菌不产生溶血活性物质。

    抗菌药物在保证人类和动物健康的同时[8],也带来了严重的耐药问题,现有资料显示,水产养殖动物主要细菌性病原的耐药现象普遍存在[1,29]。恩诺沙星、氟苯尼考、多西环素和磺胺甲唑是目前用于水产养殖动物细菌性疾病防治的主要药物[30]。鉴于乳酸菌可能涉及的青霉素类[31]、氨基糖苷类[32]和四环素类[33]的耐药基因及其耐药基因可转移的风险。本文结合药敏实验结果,首先排除了本研究中2株乳酸菌在恩诺沙星、氟苯尼考和多西环素耐药性转移方面的风险。而磺胺类药物的耐药现象是否和获得外源性耐药基因 (sul1、sul2和sul3)[33-34]相关需进一步研究。尤其是确认是否携带sul1耐药基因,因为该耐药基因的扩散传播与整合子相关,不仅水平转移概率高,而且拥有更广泛的宿主范围[35]。本研究明确了候选益生菌的耐药特性不仅能有效的规避耐药转移风险,且为科学用药提供指导意见。

    在肠道菌群稳态失衡时,常常会出现细菌位移,出现非致病菌感染致病的结果[36]。虽然鲜有哺乳动物食源性乳酸菌引起疾病的报道[8],但应用到水产养殖动物中的一些菌株却暴露出一些安全隐患,如一株植物乳杆菌[37]在应用过程中对达氏鳇(Huso huso)[37]引起了组织损伤。因此,为评估2株乳酸菌潜在的条件致病风险,本研究采取腹腔注射的形式,以高达1.0×109 CFU·mL−1的浓度进行了动物攻毒实验。结果表明乳酸菌S60在整个养殖实验过程中未引起实验鱼的死亡;而乳酸菌S72仅导致了1尾实验鱼死亡 (死亡率3.33%),相较于浓度仅为5.0×106 CFU·mL−1的嗜水气单胞菌 (典型条件致病菌) 所造成将近50%的实验鱼死亡,2株乳酸菌的安全性仍然很高。并且在攻毒处理后96 h的血液生化分析结果表明,实验组鱼类和对照组鱼类在组织损伤方面并未表现出显著差异,由此可见,在第96小时实验鱼基本已恢复到正常状态。综上,2株乳酸菌具备抑制常见鱼类病原菌的能力,对银鲫无明显致病性,可作为银鲫口服益生菌开发的资源储备。

  • 图  1   引物S24对拟穴青蟹部分个体的扩增结果

    M.分子量标准(100 bp ladder plus);1~19.闸口群体的19个个体

    Figure  1.   RAPD amplification in some individuals of S.paramamosain using primer S24

    M.marker (100 bp ladder plus); 1~19.19 individuals representing ZK population

    图  2   拟穴青蟹6个群体基于Nei′s无偏遗传距离的UPGMA系统树图

    Figure  2.   UPGMA dendrogram of 6 S.paramamosain populations based on Nei′s unbiased genetic distance

    表  1   RAPD引物序列及退火温度

    Table  1   Primer sequences for RAPD and annealing temperature

    引物编号
    primer No.
    引物序列(5→3′)
    primer sequence
    退火温度/℃
    annealing temperature
    S15 GGAGGGTGTT 36.0
    S24 AATCGGGCTG 36.0
    S31 CAATCGCCGT 36.0
    S58 GAGAGCCAAC 36.0
    S68 TGGACCGGTG 36.0
    S83 GAGCCCTCCA 36.0
    S103 AGACGTCCAC 36.0
    S398 ACCACCCACC 36.0
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    表  2   拟穴青蟹群体的遗传多样性

    Table  2   Genetic diversity parameters of S.paramamosain populations

    项目
    item
    样本数/个
    number of specimen(NS)
    多态位点数/个
    number of polymorphic locus (NPL)
    多态位点百分率/%
    percentage of polymorphic locus (PPL)
    观察等位基因数
    observed number of alleles (Na)
    有效等位基因数
    effective numeber of alleles (Ne)
    Nei′s基因多样性
    gene diversity(h)
    Shannon′s信息指数
    Shannon′s information index(I)
    党江DJ 19 17 38.64 1.386 4±0.492 5 1.276 1±0.382 7 0.155 8±0.208 1 0.227 1±0.298 6
    闸口ZK 19 16 36.36 1.363 6±0.486 6 1.258 2±0.363 1 0.148 5±0.202 5 0.216 9±0.293 4
    珍珠湾ZZW 14 17 38.64 1.386 4±0.492 5 1.274 1±0.387 5 0.154 0±0.207 6 0.224 8±0.297 0
    钦州湾QZW 13 24 54.55 1.545 5±0.503 7 1.375 8±0.397 5 0.213 2±0.214 2 0.312 1±0.305 5
    清化QH 19 15 34.09 1.340 9±0.479 5 1.251 3±0.391 6 0.138 1±0.206 6 0.200 1±0.293 5
    流沙湾LSW 15 13 29.55 1.295 5±0.461 5 1.177 8±0.308 0 0.106 6±0.175 3 0.159 9±0.257 7
    平均average 16.5 17 36.97 1.369 7 1.268 8 0.152 7 0.223 5
    物种水平at species level 99 31 70.45 1.704 5±0.461 5 1.296 3±0.335 9 0.184 3±0.177 7 0.290 9±0.250 2
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    表  3   拟穴青蟹6个群体基因多样性的Nei′s分析

    Table  3   Nei′s analysis of gene diversity in 6 S.paramamosain populations

    项目
    item
    总基因多样性
    total gene diversity (Ht)
    群体内基因多样性
    gene diversity within population (Hs)
    基因分化系数
    coefficient of gene differentiation(Gst)
    基因流
    gene flow(Nm)
    平均 average 0.187 2 0.152 7 0.184 3 2.212 9
    标准差 standard deviation 0.031 6 0.023 9
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    表  4   拟穴青蟹6个群体的AMOVA分析

    Table  4   AMOVA analysis of 6 S.paramamosain populations

    谱系结构
    source of variation
    自由度
    degree of freedom (df)
    方差总和
    sum of squared deviation (SSD)
    平均方差
    mean of squared deviation (MSD)
    变异组分
    variance component
    变异百分率/%
    percentage of total variance
    群体间 among populations 5 43.407 8.681 0.375 12.97
    群体内 within populations 93 234.290 2.519 2.519 87.03
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    表  5   拟穴青蟹6个群体间的地理距离(对角线上方)和遗传距离(对角线下方)

    Table  5   Geographic (above diagonal) and genetic distance (below diagonal) among 6 S.paramamosain populations km

    项目 item 党江 DJ 闸口 ZK 珍珠湾 ZZW 钦州湾 QZW 清化 QH 流沙湾 LSW
    党江 DJ 53.53 88.63 53.28 383.77 165.20
    闸口 ZK 0.023 4 140.79 101.60 434.87 156.80
    珍珠湾 ZZW 0.037 3 0.065 1 38.83 306.54 220.77
    钦州湾 QZW 0.060 2 0.093 8 0.023 6 344.13 204.32
    清化 QH 0.038 3 0.042 1 0.040 0 0.062 1 422.49
    流沙湾 LSW 0.023 7 0.033 1 0.030 7 0.068 8 0.021 2
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  • 收稿日期:  2011-12-08
  • 修回日期:  2012-01-17
  • 刊出日期:  2012-04-04

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