基于环境DNA技术的西江珍稀鱼类省级自然保护区鱼类多样性研究

钟占友, 邓洪, 寇春妮, 陈蔚涛, 武智, 李跃飞, 夏雨果, 李慧峰, 李捷, 朱书礼

钟占友, 邓洪, 寇春妮, 陈蔚涛, 武智, 李跃飞, 夏雨果, 李慧峰, 李捷, 朱书礼. 基于环境DNA技术的西江珍稀鱼类省级自然保护区鱼类多样性研究[J]. 南方水产科学, 2025, 21(2): 47-58. DOI: 10.12131/20240173
引用本文: 钟占友, 邓洪, 寇春妮, 陈蔚涛, 武智, 李跃飞, 夏雨果, 李慧峰, 李捷, 朱书礼. 基于环境DNA技术的西江珍稀鱼类省级自然保护区鱼类多样性研究[J]. 南方水产科学, 2025, 21(2): 47-58. DOI: 10.12131/20240173
ZHONG Zhanyou, DENG Hong, KOU Chunni, CHEN Weitao, WU Zhi, LI Yuefei, XIA Yuguo, LI Huifeng, LI Jie, ZHU Shuli. Research on fish diversity in Xijiang Rare Fish Provincial Nature Reserve based on environmental DNA technology[J]. South China Fisheries Science, 2025, 21(2): 47-58. DOI: 10.12131/20240173
Citation: ZHONG Zhanyou, DENG Hong, KOU Chunni, CHEN Weitao, WU Zhi, LI Yuefei, XIA Yuguo, LI Huifeng, LI Jie, ZHU Shuli. Research on fish diversity in Xijiang Rare Fish Provincial Nature Reserve based on environmental DNA technology[J]. South China Fisheries Science, 2025, 21(2): 47-58. DOI: 10.12131/20240173

基于环境DNA技术的西江珍稀鱼类省级自然保护区鱼类多样性研究

基金项目: 农业农村部财政专项“珠江流域渔业资源与栖息地调查”;中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助 (2023TD10)
详细信息
    作者简介:

    钟占友 (1998—),男,硕士研究生,研究方向为渔业资源。E-mail: zzyyd0106@163.com

    通讯作者:

    李 捷 (1979—),男,研究员,博士,研究方向为渔业资源及生态学。E-mail: lijie1561@163.com

    朱书礼 (1987—),男,助理研究员,硕士,研究方向为渔业资源及分子生态学。E-mail: zshuli2009@126.com

  • 中图分类号: S 932.4

Research on fish diversity in Xijiang Rare Fish Provincial Nature Reserve based on environmental DNA technology

  • 摘要:

    为更好地保护西江珍稀鱼类省级自然保护区的鱼类资源,利用基于COI12S rRNA 2个基因标记的环境DNA技术 (Environmental DNA, eDNA),对保护区江段的左岸、中间和右岸共计18个采样站位开展了鱼类种类组成及河段不同横向断面的鱼类多样性分析。结果发现,COI12S rRNA 2个基因共检测出53种鱼类,隶属于4目12科48属;12S rRNA基因检测出47种鱼类,COI基因检测出19种鱼类,2个基因同时检测出的鱼类有13种。基于序列丰度的Alpha多样性分析结果显示,2个基因的结果一致支持保护区江段左岸的鱼类物种数和Chao1丰富度最高,说明左岸具有较高的鱼类多样性。基于12S rRNA基因的Beta多样性结果发现,保护区的左岸、中间和右岸的鱼类组成存在显著性差异。研究结果可为保护区鱼类生物多样性的保护和动态监测提供基础资料与技术支持。

    Abstract:

    To better protect the fish resources in the Xijiang Rare Fish Provincial Nature Reserve, we used the environmental DNA (eDNA) technology to analyze the fish species composition and fish diversity at different cross sections of 18 sampling stations on the left, middle and right banks of the river section. Two molecular markers, i.e. COI and 12S rRNA, were used in this study. The results show that the two genes of 12S rRNA and COI were detected in 53 fish species, belonging to 48 genera, 12 families and 4 orders. Forty-seven and nineteen fish species were examined based on 12S rRNA and COI, respectively. In addition, 13 shared fish species were discovered by using the two gene markers. Alpha diversity analysis based on sequence abundance shows that the two markers unanimously supported the highest number of fish species and the highest richness of Chao 1 index on the left bank of the river section, indicating that the left bank appears to have higher fish diversity than the middle and right banks. Beta diversity analysis based on 12S rRNA shows obvious differences in the fish composition on the left, middle and right banks. The research provides basic data and technical support for the protection and dynamic monitoring of fish biodiversity in this nature reserve.

  • 氯霉素(chloramphenicol,CAP)是一种具有旋光活性的高效广谱抗菌药,农业生产上可以有效治疗家畜家禽及水产生物所患的由致病性革兰阴性菌引起的疾病[1-3]。然而,氯霉素可以引起一系列严重的“三致”毒性和临床不良反应[4]。氯霉素对实验动物的致癌性证据充分,而对人体的致癌性证据有限。因此世界卫生组织(World Health Organization,WHO)中的国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer,IARC)在1990年将其归为2A类致癌物质(对人很可能致癌)[1,5]。此外,氯霉素可通过短期可逆性的骨髓抑制,引起各类血细胞的减少,如血小板减少性紫癜、粒细胞缺乏症等。严重时氯霉素可引起不可逆的再生障碍性贫血,患者造血功能极少恢复,虽然发生较晚但死亡率高,而且存活者也容易发生粒细胞性白血病。氯霉素的另一个严重不良反应是会引起灰婴综合征(gray baby syndrome,GBS),摄入大剂量氯霉素后,血药浓度异常增高引起婴儿的循环衰竭[6]

    因此,我国农业部235号公告明确规定,氯霉素为禁止用于所有食品动物的药物,在所有食品动物中不得检出[7]。近年来,有媒体报道称在贝类产品中检出氯霉素,原因可能是运输者为了防止贝类在运输途中滋生细菌,人为非法添加氯霉素。针对该情况,笔者对2015—2017年市场、渔获码头贝类进行了跟踪抽样调查,采用GB/T 20756—2006液相色谱-串联质谱法,对贝类样品中氯霉素残留状况进行了检测,并采用国际食品法典委员会(CAC)推荐的遗传毒性致癌物危险性评估技术——暴露边界比(margin of exposure,MOE)法[8],通过@risk软件对贝类中非法添加氯霉素可能引起的食品安全风险进行了评估。

    目前,MOE法在风险评估中应用广泛[9-10]。MOE是对人或实验动物产生很小但可测量作用的剂量,与估计的人的暴露量之间的比率。遗传毒性的致癌物的MOE值通过该类物质的基准剂量最低限值(lower confidence limit on the benchmark dose,BMDL) 与估计人群暴露量的比值计算得到,BMDL是描述遗传毒性致癌物危害特征的起点。MOE值越小,说明该物质对人类的致癌危险性越大,反之就越小。王君和吴永宁[8]运用MOE法评价了遗传毒性致癌物丙烯酰胺的危险性;Thompson等[11]综合了机械学和药代动力学信息,得出了六价铬的参考剂量和MOE值;Okauru等[12]运用MOE法比较了多环芳烃和热水对食管癌发病的风险。本研究采用MOE法评价氯霉素的暴露量,可以很好地衡量相关风险。

    @risk软件是一款基于蒙特卡罗模拟技术[13]加载到Microsoft Excel上进行风险评估和决策分析的专业软件[14],该软件为Excel增添了高级模型和风险分析功能,允许在建立模型时应用各种概率分布函数,对各种可能出现的结果进行模拟,得出构成风险的各种事件的发生概率,并能够以各种图表展示分析结果[13,15-16]

    本研究首次采用蒙特卡罗模拟技术,基于@risk 7.5.2版本,通过对检测到的市售贝类产品中氯霉素质量分数数据进行分布拟合,并模拟抽样10 000次[13,16-17],进而得到膳食暴露量的概率分布曲线及其中位数(P50)和第95百分位数(P95)的值,通过计算膳食摄入量和人群估计暴露量,对所得结果进行暴露边界比评价。属于定量的风险评估方法,得到的数据直观,可与其他类似风险进行横向比较。该方法可以较好地评估市售贝类产品中氯霉素的暴露风险,对该风险曾经发生、现在已基本消除的情况进行量化描述,以期说明通过加大执法力度进行风险管理可以消除该风险。

    2015—2017年,根据《水产品抽样规范》(GB/T 30891—2014)的抽样方法,在市场采集贝类样品,每个档口只采集1个贝类品种且只算作1个样品,样品取净肉400 g,共300个样品,包括东风螺(Babylonia areolata)、翡翠贻贝(Perna viridis)、文蛤(Meretrix meretrix)、菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)、杂色蛤仔(R. variegata)、波纹巴非蛤(Paphia undulata)等。具体采样情况见表1。所采样品包括蛤类、螺类、贻贝等,均为市场常见品种,能够一定程度上反映当地贝类的消费情况。

    表  1  2015—2017年市售贝类产品采样情况
    Table  1.  Sample collection of commercially available shellfish in 2015−2017
    年份
    year
    样品种类
    species
    数量
    quantity
    2015 文蛤 Meretrix meretrix 23
    菲律宾蛤仔 Ruditapes philippinarum 23
    杂色蛤仔 R. variegata 33
    波纹巴非蛤 Paphia undulata 10
    东风螺 Babylonia areolata 11
    小计 subtotal 100
    2016 文蛤 M. meretrix 26
    波纹巴非蛤 P. undulata 11
    菲律宾蛤仔 R. philippinarum 8
    翡翠贻贝 P. viridis 55
    小计 subtotal 100
    2017 文蛤 M. meretrix 15
    杂色蛤仔 R. variegata 6
    波纹巴非蛤 P. undulata 12
    翡翠贻贝 P. viridis 67
    小计 subtotal 100
    总计 total 300
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    氯霉素(Dr.Ehrenstorfer,99.9%)、氯霉素-d5溶液(Dr.Ehrenstorfer,100.0 μg·mL–1)、正己烷(Sigma,≥95%)、乙酸乙酯(Sigma,≥99.7%)、甲醇(Fisher Scientific,99.9%)、氢氧化铵溶液(Macklin,25%~28%)、无水硫酸钠(广州化学试剂厂,≥99.0%)

    API 3000-Agilent 1200 Series液相色谱-串联质谱仪、METTLER TOLEDO XS204电子天平、Thermo Scientific BIOFUGE STRATOS离心机、IKA MS3 basic涡旋振荡器、IKA T25 digital组织匀浆机、BUCHI R-215旋转蒸发仪。

    根据《可食动物肌肉、肝脏和水产品中氯霉素、甲砜霉素、氟苯尼考残留量的测定 液相色谱-串联质谱法》(GB/T 20756—2006)的相关规定进行检测。测定中采用空白实验、平行双样、质控样品测定、阳性复测等进行内部质量控制。

    采用标准曲线法得到供试液中氯霉素的体积分数,贝类产品中氯霉素的残留量X=cV/mc为供试液中氯霉素的体积分数,V为溶解残余物所用体积,m为贝类样品的质量。

    1) 贝类产品中氯霉素质量分数数据的分布拟合。采用@risk软件,将贝类产品中氯霉素质量分数的检测值进行分布拟合。参照世界卫生组织《食品中痕量污染物的可靠评价》[18]和美国环境保护署(USEPA)建议的数据处理方法[19-20],对于未检出样品按方法最低检出浓度的1/2进行处理取值,本研究中氯霉素的方法检出限为0.1 μg·kg–1,故对于未检出样品按照0.05 μg·kg–1进行处理取值。将得到的不同拟合曲线的拟合度运用卡方检验、安德森-达林检验、柯尔莫可洛夫-斯米洛夫检验这3种统计检验方法进行检验,并综合考虑3种方法的结果,最终确定最佳拟合分布[16-17,21-22]

    2) 膳食摄入量。根据GEMS/Food在2012年发布的数据,我国所在的G09区(东亚及东南亚地区),软体动物的平均摄入量为12.2 g·d–1 [23],采用最保守的估计值10 g·d–1为贝类产品的膳食摄入量。本研究在软件中设定膳食摄入量为(10±3) g·d–1μ=10 g·d–1σ=1的随机变化正态分布函数。

    3) 每人每日膳食平均暴露量 [以下简称膳食暴露量(estimated dietary exposure,EXP)]。计算公式为:

    $${\rm{EX}}{{\rm{P}}_{\rm{D}}}{{ = C}} \times I_D$$ (1)

    其中EXPD为日膳食暴露量,C为贝类产品中氯霉素的质量分数,ID为日膳食摄入量。根据以上公式,将相关参数(包括软件拟合的贝类产品中氯霉素质量分数的分布函数)输入@risk软件,随机从贝类产品中氯霉素质量分数分布中抽取数值计算膳食暴露量,每次模拟过程循环10 000次,得到膳食暴露量P50和P95的值。

    暴露边界比评估。采用CAC推荐的遗传毒性致癌物危险性评估技术——MOE法[8,10,24]对市售贝类产品中氯霉素残留进行风险特征描述。根据公式MOE=BMDL/EXP,结合动物及临床实验数据,将BMDL定为每千克体质量1 mg·d–1

    EXP计算公式为EXP=EXPD/mb,其中mb为标准人体质量,按照60 kg计算,膳食暴露量按照公式(1)得到的膳食暴露量的P50和P95取值。

    通过得到的MOE的P50和P95值进行评价,参照加拿大卫生部对于具有遗传毒性致癌物的MOE结果判定方法进行判定,即MOE值<5 000、5 000~500 000以及>500 000时分别表示被评估的危害物属于高、中、低危害程度[7]

    所有样品均采用国标方法检测,经仪器分析的数据见表2。其中2015年的检出率为33%,2016年的检出率为3%,2017年的全部100个样品均未检出氯霉素残留,故在本研究中不继续计算2017年氯霉素的膳食暴露量。

    表  2  2015—2017年市售贝类产品中氯霉素残留检测结果
    Table  2.  Result of determination of chloramphenicol residues in commercially available shellfish in 2015−2017
    年份
    year
    采集样品数
    quantity of collected samples
    阳性样品数
    quantity of positive samples
    检出值/μg·kg–1
    range of concentration
    2015 100 33 0.36~4 050
    2016 100 3 50.4~820
    2017 100 0
    总计 total 300 36 0.36~4 050
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    根据2.1的检测结果,在软件中分别进行2015年、2016年数据的分布拟合,经3种检验综合评价,数据更符合正态分布,得到最优的拟合曲线,分别为:

    2015年,RiskNormal (121.43, 524.71, RiskTruncate(0, ))

    2016年,RiskNormal (9.412 5, 82.293, RiskTruncate(0, ))

    根据公式 (1),将得到的@risk相关参数(表3)输入软件中。

    表  3  氯霉素的膳食暴露量分析@risk软件计算参数
    Table  3.  @risk parameter to calculate dietary exposure of chloramphenicol
    描述
    description
    分布
    distribution
    2015年氯霉素残留量 chloramphenicol residue, 2015 RiskNormal (121.43, 524.71, RiskTruncate(0, ))
    2015年膳食摄入量 daily intake, 2015 RiskNormal (0.01, 1, RiskTruncate(0.007, 0.013))
    2015年膳食暴露量 dietary exposure, 2015 RiskOutput()+B1*B2
    2016年氯霉素残留量 chloramphenicol residue, 2016 RiskNormal (9.4125, 82.293, RiskTruncate(0, ))
    2016年膳食摄入量 daily intake, 2016 RiskNormal (0.01, 1, RiskTruncate(0.007, 0.013))
    2016年膳食暴露量 dietary exposure, 2016 RiskOutput()+B4*B5
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    在@risk软件中进行蒙特卡罗模拟,每次模拟过程循环10 000次,得到的膳食暴露量的概率分布曲线见图1

    图  1  氯霉素的膳食暴露量概率分布曲线
    Figure  1.  Probability distribution curve of dietary exposure of chloramphenicol

    根据得到的氯霉素的膳食暴露量概率分布曲线,分别得到对应年份膳食暴露量的P50和P95 (表4)。

    表  4  氯霉素的膳食暴露量
    Table  4.  Dietary exposure of chloramphenicol
    年份
    year
    膳食暴露量/μg·kg–1 dietary exposure
    概率分布中位百分数
    P50
    概率分布第95百分位数
    P95
    2015 3.91 11.5
    2016 0.579 1.73
    2017
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    本研究采用单一食品选择研究法,定量估计的分析方式,通过计算得到的暴露量以及MOE值见表5。2015年居民消费贝类产品所致氯霉素的平均暴露量为每千克体质量0.065 1 μg·d–1,计算得到的MOE值为15 361,介于5 000~500 000,按照加拿大卫生部的标准,属于中危害水平。高暴露量人群的暴露量为每千克体质量0.192 μg·d–1,计算得到的MOE值为5 208,介于5 000~500 000,按照加拿大卫生部的标准,属于中危害水平。2016年居民消费贝类产品所致氯霉素的平均暴露量为每千克体质量0.009 65 μg·d–1,计算得到的MOE值为103 627,介于5 000~500 000,按照加拿大卫生部的标准,属于中危害水平。高暴露量人群的暴露量为每千克体质量0.028 8 μg·d–1,计算得到的MOE值为34 722,介于5 000~500 000,按照加拿大卫生部的标准,属于中危害水平。2017年由于在市售贝类产品中未检出氯霉素,属于无危害水平。

    表  5  氯霉素的人群估计暴露量及暴露边界比
    Table  5.  Estimated dietary exposure and margin of exposure of chloramphenicol
    年份
    year
    人群估计暴露量/μg·d–1
    EXP
    暴露边界比
    MOE
    概率分布中位百分数
    P50
    概率分布第95百分位数
    P95
    概率分布中位百分数
    P50
    概率分布第95百分位数
    P95
    2015 0.065 1 0.192 15 361 5 208
    2016 0.009 65 0.028 8 103 627 34 722
    2017
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    目前的致癌理论认为,遗传毒性致癌物是一类通过诱发体细胞基因突变从而激活致癌基因或者灭活抑癌基因的表达从而诱发癌变的致癌物,在体细胞基因中几个分子甚至一个分子的基因突变就有可能诱发癌症[8]。氯霉素的致癌性也有类似特征,给其危害的评估带来一定困难。对市售贝类产品中氯霉素残留进行暴露评估,是一种行之有效的方法。

    在致畸性研究中,氯霉素未表现出对大鼠、兔的致畸作用,但即使小剂量给药,均可引起高死胎率。几乎所有氯霉素致突变研究,均可得到阳性结果。氯霉素在离体细胞实验中可引发DNA断裂、染色体畸变并增加姐妹染色单体互换[25]。对于具有遗传毒性和致癌性的物质,传统假设它们没有阈值,并在任意暴露水平都会存在一定风险。故氯霉素无每日允许摄入量(acceptable daily intake,ADI)值,在世界粮农组织/世界卫生组织的报告中同样认为其无ADI值[3]

    BMDL的取值通常根据实验动物及临床实验数据得到,根据WHO的国际化学品安全规划(International Programme on Chemical Safety,IPCS)提出的“化学品危险性评估的剂量-反应分析建模的原则”[9],风险评估时可通过实验数据的拟合分析得到基准剂量(benchmark dose,BMD),进而得到BMDL值。由于氯霉素尚缺少BMDL值,需要根据各方面的实验数据综合考虑。研究表明,小鼠单次口服每千克体质量50 μg·d–1和100 μg·d–1的氯霉素可以引起染色体畸变[8]。成人或较大儿童应用氯霉素剂量大于每千克体质量100 μg·d–1,早产儿或新生儿大于每千克体质量25 μg·d–1可能引起灰婴综合征[2],氯霉素注射液的临床用量为成人每日0.5~1 g[6],按60 kg标准人体质量折算后为每千克体质量8~17 μg·d–1。以上剂量均为短期给药剂量,综合考虑长期食用的影响,本研究采用的BMDL为每千克体质量0.1 μg·d–1。该取值是否合理,仍需要更多数据进行评估。

    我国农业部235号公告明确规定氯霉素为禁用药物[3]。早在1969年,世界卫生组织(WHO)食品添加剂联合专家委员会(JECFA)和联合国粮农组织(FAO)第12届会议就建议禁止使用氯霉素[5,22]。在欧盟规定(EEC) No.2377/90以及以后的各版本限量标准中,氯霉素被列在不制定残留限量标准(禁用)的物质中[11]。氯霉素在各个国家均无最高残留限量值(maximum residue limit,MRL)。

    我国相关水产品检验检测标准中,由于采用的方法不同,氯霉素的检出限在0.1~0.3 μg·kg–1。欧盟委员会2003/181/EC决议的官方公报[26]以及全球水产养殖联盟(Global Aquaculture Alliance,GAA)制定的最佳水产养殖规范(Best Aquaculture Practice,BAP)中关于水产品中氯霉素残留的最低执行限量要求(minimum required performance limits,MRPL)为0.3 μg·kg–1

    本研究氯霉素的检出限为0.1 μg·kg–1,符合相关规定和检测要求;同时对于未检出的样品采用检出限的1/2进行处理取值符合相关指南的要求。

    相对其他海产品,我国消费者人群贝类的膳食摄入量数据在文献报道中较少涉及。根据GEMS/Food在2012年发布的数据,我国所在的G09区,软体动物(包括贝类和头足类)的平均摄入量为12.2 g·d–1,该区淡水鱼的平均摄入量为27.0 g·d–1,海水鱼的平均摄入量为1.29 g·d–1,甲壳类的平均摄入量为5.29 g·d–1 [23]。《2002年中国居民营养与状况调查报告》中只统计了鱼类及虾蟹类的数据,数据显示我国居民平均每标准人日鱼类摄入量为24.8 g、虾蟹类的摄入量为4.8 g[27]。《广东省居民膳食营养与健康状况十年变化分析》(2002—2012)中只统计了鱼虾类的数据,每标准人日鱼虾类摄入量为56.8 g[28]。《中国居民营养与健康状况监测2010—2013年综合报告》的数据也只统计了鱼虾类的数据,城乡居民平均每标准人日鱼虾类摄入量为23.7 g,与2002年相比下降了5.9 g[29]。唐洪磊等[30]2006年的调查显示,广东省沿海城市,虾蟹贝类居民日均摄入量中值为24.8 g·d–1,均值为66.6 g·d–1。综合以上数据,本研究将10 g·d–1定为估计的我国居民贝类产品的膳食摄入量。

    MOE分析技术是欧洲食品安全局在2005年FAO/WHO JECFA第64次会议上提出的,是评估遗传毒性致癌物危险性的有效方法。目前,虽然对于MOE值的分界值界定,国际社会尚没有一个公认值,不同国家及其机构的判定标准不一,但均可作为判定物质安全性的参考。加拿大卫生部对于MOE值分别界定了5 000和500 000两个分界值,分别界定出被评估危害物质危害程度的高、中、低[8]。英国癌症委员会(COC)的一个草案认为,MOE值达到10 000时可能已经足够安全。欧盟也认为MOE值达到10 000或以上,风险即较低[8,10,31]。本研究综合以上标准,采用较严格的加拿大卫生部标准,可以较好地区分不同年度市售贝类产品中氯霉素残留风险的严重程度。

    在2015年之前,市售贝类产品中人为违规添加氯霉素的情况均无人报道,其严重程度亦无从考量。自从2015年有媒体报道相关问题以来,政府部门便采取了一系列行动,以期能有效地控制该问题。本研究在2017年的采样检测时发现,市售贝类产品中氯霉素残留量已低于检测限,证明该问题已基本得到有效控制,对消费者的健康危害低。同时,监管部门仍应持续保持对此类风险问题的关注,以防死灰复燃。

  • 图  1   采样站位示意图

    注:L1—L6 为左岸区域;M1—M6 为中间区域;R1—R6 为右岸区域。

    Figure  1.   Information of sampling stations

    Note: L1–L6 are the left bank area; M1–M6 are the middle area; R1–R6 are the right bank area.

    图  2   各区域鱼类物种组成

    Figure  2.   Composition of fish species of each area

    图  3   不同横向采样断面平均物种数与Alpha多样性指数

    注:a和b表示12S rRNA的鉴定结果;c和d表示COI的鉴定结果。

    Figure  3.   Average species number and Alpha diversity indexes of different transverse sections

    Note: a and b represent identification results based on 12S rRNA; c and d represent identification results based on COI.

    图  4   基于12S rRNA (左) 和COI基因 (右) 的各区域eDNA检测鱼类组成相似性

    Figure  4.   Composition similarity of fish detected in each area based on 12S rRNA (Left) and COI gene (Right) of eDNA

    表  1   基于12S rRNACOI基因检测的物种名录及序列数

    Table  1   List of fish species and sequence number of detected based on 12S rRNA and COI genes

    种类
    Species
    12S rRNA COI
    左岸
    Left bank
    中间
    Middle bank
    右岸
    Right bank
    左岸
    Left bank
    中间
    Middle bank
    右岸
    Right bank
    鲤形目 Cypriniformes
     鲤科 Cyprinidae
      宽鳍鱲 Zacco platypus 54 93 8 171 0 0 0
      马口鱼 Opsariichthys bidens 0 0 0 1 308 1 403 1 677
      南方波鱼 Rasbora steineri 0 0 0 709 1 155 693
      青鱼 Mylopharyngodon piceus 14 043 436 1 699 0 0 0
      草鱼 Ctenopharyngodon idella 4 639 22 577 6 209 594 270 442
      鳤 Ochetobius elongatus 6 521 78 12 0 0 0
      鳡 Elopichthys bambusa 35 532 12 799 10128 1 699 1 437 498
      赤眼鳟 Squaliobarbus curriculus 90 047 28 123 23 347 197 1 0
      银飘鱼 Pseudolaubuca sinensis 2 781 20 893 275 0 0 0
      鳊 Parabramis pekinensis 4 774 487 494 0 0 0
      䱗 Hemiculter leucisculus 853 176 224 336 29 961 0 0 0
      细鳊 Metzia formosae 3 0 0 0 0 0
      南方拟䱗 Pseudohemiculter dispar 0 0 0 543 6 0
      海南似鱎 Toxabramis houdemeri 4 0 0 0 0 0
      广东鲂 Megalobrama terminalis 3 268 50 479 9 171 12 54 1
      海南鲌 Chanodichthys erythropterus 0 0 1 0 0 0
      黄尾鲴 Xenocypris davidi 953 229 383 550 20 524 4 070 1 059 95
      圆吻鲴 Distoechodon tumirostris 5 2 2 0 0 0
      鲢 Hypophthalmichthys molitrix 36 452 379 14 407 74 406 46
      鳙 Aristichthys nobilis 29 337 16 072 22 872 0 0 0
      银鮈 Squalidus argentatus 1 6 433 4 0 100 0
      福建小鳔鮈 Microphysogobio fukiensis 1 1 866 0 0 0 0
      兴凯鱊 Acanthorhodeus chankaensis 3 260 0 0 0 0 0
      越南鱊 Acheilognathus tonkinensis 0 0 482 6 52 0
      高体鳑鲏 Rhodeus ocellatus 5 521 78 071 1 760 0 25 0
      倒刺鲃 Spinibarbus denticulatus 37 1 3 098 0 0 0
      虹彩光唇鱼 Acrossocheilus iridescens 0 23 6 0 0 0
      鲮 Cirrhinus molitorella 60 257 55 395 26 860 0 0 0
      纹唇鱼 Osteochilus salsburyi 0 18 581 0 0 0 0
      鲤 Cyprinus carpio 62 807 63 992 53 396 145 13 158
      鲫 Carassius cuvieri 12 1 0 0 0 0
     平鳍鳅科 Homalopteridae
      平舟原缨口鳅 Vanmanenia pingchowensis 0 0 9 0 0 0
    鲇形目 Siluriformes
     鲇科 Siluridae
      鲇 Silurus asotus 831 0 0 0 0 0
      大口鲇 Silurus meridionalis 565 0 0 0 0 0
     胡子鲇科 Clariidae
      革胡子鲇 Clarias gariepinus▲● 1 0 0 0 0 0
     甲鲶科 Loricariidae
      豹纹翼甲鲇 Pterygoplichthys pardalis▲● 4 853 8 315 0 0 0
     长臀鮈科 Cranoglanididae
      长臀鮈 Cranoglanis bouderius 0 0 191 0 0 0
     鲿科 Bagridae
      黄颡鱼 Pelteobagrus fulvidraco 0 0 905 0 0 0
      瓦氏黄颡鱼 Pseudobagrus vachelli 0 0 0 1 000 388 376
      粗唇鮈 Pseudobagrus crassilabris 947 0 1 303 25 0 0
      条纹鮈 Tachysurus virgatus 863 0 0 0 0 0
      斑鳠 Hemibagrus guttatus 178 4 233 49 0 0 0
    鲈形目 Perciformes
     鮨鲈科 Percichthyidae
      斑鳜 Siniperca scherzeri 1 106 0 0 0 0 0
      波纹鳜 Siniperca undulata 626 2 0 0 0 0
      大眼鳜 Siniperca knerii 0 0 0 2 0 0
      花鲈 Lateolabrax japonicus 0 0 0 27 133 0
     刺臀鱼科 Centrarchidae
      大口黑鲈 Micropterus salmoides▲● 1 075 0 0 0 0 0
     丽鱼科 Cichlidae
      齐氏罗非鱼 Coptodon zillii▲● 8 762 6 784 5 0 530 0
      尼罗罗非鱼 Oreochromis niloticus 3 927 3 5 660 641 1 192 296
     鰕虎鱼科 Gobiidae
      金黄舌鰕虎 Glossogobius aureus 356 2 291 4 0 0 0
      粘皮鲻鰕虎 Mugilogobius myxodermus 1 10 3 0 0 0
      波氏吻鰕虎 Rhinogobius cliffordpopei 6 11 266 82 0 0 0
    鲀形目 Tetraodontiformes
     鲀科 Tetraodontidae
      弓斑东方鲀Takifugu ocellatus 2 013 27 400 10 454 0 0 0
    注:▲. 外来物种;★. 国家重点保护水生野生动物;●. 与李捷等[21]2006—2008年保护区调查相比的新增种类。 Note: ▲. Alien species; ★. National key protected aquatic wildlife; ●. New species compared with the conservation area survey conducted by Li et al[21] from 2006 to 2008.
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    表  2   各区域Alpha多样性指数

    Table  2   Alpha diversity index of each area

    区域
    Area
    物种数
    Species index
    Chao1指数
    Chao1 index
    香农指数
    Shannon index
    辛普森指数
    Gini-Simpson index
    覆盖度
    Coverage
    12S rRNA COI 12S rRNA COI 12S rRNA COI 12S rRNA COI 12S rRNA COI
    L1 26 10 1.94 1.20 1.60 1.60 0.70 0.69 1.00 1.00
    L2 28 8 2.11 0.98 1.67 0.34 0.72 0.13 1.00 1.00
    L3 31 9 2.32 1.08 1.20 0.51 0.60 0.20 1.00 1.00
    L4 27 3 2.02 0.46 1.66 0.41 0.71 0.21 1.00 1.00
    L5 24 3 1.79 0.41 1.36 0.70 0.67 0.48 1.00 0.99
    L6 32 8 2.41 1.01 1.65 1.17 0.72 0.64 1.00 0.99
    M1 28 4 2.22 0.63 2.18 0.89 0.85 0.55 1.00 0.99
    M2 27 5 2.16 0.70 2.17 1.15 0.86 0.61 1.00 1.00
    M3 21 4 1.63 0.45 1.61 0.79 0.77 0.49 1.00 1.00
    M4 24 3 1.86 0.28 1.53 0.55 0.66 0.34 1.00 1.00
    M5 29 3 2.27 0.45 1.78 0.71 0.75 0.48 1.00 0.99
    M6 23 3 1.81 0.37 1.83 0.71 0.75 0.50 1.00 0.99
    R1 25 4 2.35 0.52 1.40 0.89 0.60 0.55 0.99 0.99
    R2 29 5 2.54 0.92 1.83 0.88 0.76 0.45 1.00 0.98
    R3 24 6 2.12 0.87 1.97 0.54 0.80 0.25 0.99 0.99
    R4 24 5 2.11 0.91 1.66 1.11 0.67 0.60 0.99 0.99
    R5 21 1 1.72 0 2.24 0 0.85 0 1.00 0.97
    R6 17 2 1.39 0.91 1.55 0.64 0.73 0.67 1.00 0.98
    注:L1—L6为左岸区域;M1—M6为中间区域;R1—R6为右岸区域。 Note: L1–L6 are the left bank area; M1–M6 are the middle area; R1–R6 are the right bank area.
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出版历程
  • 收稿日期:  2024-07-22
  • 修回日期:  2024-11-27
  • 录用日期:  2025-01-08
  • 网络出版日期:  2025-02-08
  • 刊出日期:  2025-04-04

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