凡纳滨对虾淡化养殖池塘浮游细菌群落时空变化及其对理化因子的响应

祁峰, 热比古丽·沙吾提, 咸玉兰, 韩军军, 米乃瓦尔·木衣提, 陈韩飞, 孙世萍, 马燕武, 陈朋

祁峰, 热比古丽·沙吾提, 咸玉兰, 韩军军, 米乃瓦尔·木衣提, 陈韩飞, 孙世萍, 马燕武, 陈朋. 凡纳滨对虾淡化养殖池塘浮游细菌群落时空变化及其对理化因子的响应[J]. 南方水产科学, 2023, 19(2): 50-61. DOI: 10.12131/20220192
引用本文: 祁峰, 热比古丽·沙吾提, 咸玉兰, 韩军军, 米乃瓦尔·木衣提, 陈韩飞, 孙世萍, 马燕武, 陈朋. 凡纳滨对虾淡化养殖池塘浮游细菌群落时空变化及其对理化因子的响应[J]. 南方水产科学, 2023, 19(2): 50-61. DOI: 10.12131/20220192
QI Feng, SHAWUTI Rebiguli, XIAN Yulan, HAN Junjun, MUYITI Minawaer, CHEN Hanfei, SUN Shiping, MA Yanwu, CHEN Peng. Spatio-temporal changes of bacterioplankton communities in Litopenaeus vannamei desalinated ponds and their responses to physicochemical factors[J]. South China Fisheries Science, 2023, 19(2): 50-61. DOI: 10.12131/20220192
Citation: QI Feng, SHAWUTI Rebiguli, XIAN Yulan, HAN Junjun, MUYITI Minawaer, CHEN Hanfei, SUN Shiping, MA Yanwu, CHEN Peng. Spatio-temporal changes of bacterioplankton communities in Litopenaeus vannamei desalinated ponds and their responses to physicochemical factors[J]. South China Fisheries Science, 2023, 19(2): 50-61. DOI: 10.12131/20220192

凡纳滨对虾淡化养殖池塘浮游细菌群落时空变化及其对理化因子的响应

基金项目: 新疆维吾尔自治区自然科学计划 (自然科学基金) 面上项目 (2020D01A102)
详细信息
    作者简介:

    祁 峰 (1981—),男,高级工程师,硕士,研究方向为水域生态学。E-mail: 6481135@qq.com

    通讯作者:

    陈 朋 (1983—),男,高级工程师,硕士,研究方向为渔业生态学。E-mail: 290189260@qq.com

  • 中图分类号: S 917.1

Spatio-temporal changes of bacterioplankton communities in Litopenaeus vannamei desalinated ponds and their responses to physicochemical factors

  • 摘要: 浮游细菌调控是对虾养殖水体环境控制策略的核心内容,探究浮游细菌群落构建的一般规律,可进一步推动对虾养殖水体水质调控技术的研究。运用16S rRNA高通量测序技术,对凡纳滨对虾 (Litopenaeus vannamei) 淡化养殖池塘进行了12次周际调查。结果显示,48个样品共获得2 854个操作分类单元 (Operational taxonomic units, OTU,97%相似性),序列比对发现古细菌2门1纲1科1属,细菌30门59纲98目199科433属,其中优势菌群25属。优势菌群在组成上有较高的相似性,但各池优势菌群在分布和相对丰度变动上有较大差异。各池系统发育多样性指数总平均值为77.57,变幅为24.39~111.65;香农多样性指数总平均值为3.96,变幅为2.64~5.06;物种丰富度指数总平均值为716,变幅为229~1 054。非度量多维标度分析 (Non-metric multidimensional scaling, NMDS) 表明各池塘浮游细菌群落在养殖初期差异较大,中、后期差异减小,冗余分析 (Redundancy analysis, RDA) 显示活性磷、碱度、溶解氧和硫化物可显著影响浮游细菌的群落结构。
    Abstract: The regulation of bacterioplankton is the core content of the environmental control strategy in shrimp aquaculture. Exploring the general rules of the construction of bacterioplankton community can further promote the research on water quality regulation for shrimp ponds. Using 16s rRNA high-throughput sequencing technology, we conducted 12 weekly surveys in Litopenaeus vannamei desalinated ponds.The results indicate that a total of 2 854 OTUs (97% similarity) were obtained from 48 samples (Archaea belonged to 2 phyla, 1 class, 1 family and 1 genus; and bacteria belonged to 30 phyla, 59 classes, 98 orders, 199 families and 433 genera, among which 25 genera were dominant flora). The dominant flora had high similarity in the composition, but with great differences in the distribution and relative abundance in each pond. The total average phylogenetic diversity index was 77.57, ranging from 24.39 to 111.65; the total average Shannon diversity index was 3.96, ranging from 2.64 to 5.06; the total average species richness index was 716, ranging from 229 to 1 054. NMDS analysis shows that the community structure of bacterioplankton in each pond varied greatly at the early stage of aquaculture, but not so greatly at the middle and late stages. The results of redundancy analysis shows that the labile phosphorus, total alkalinity, dissolved oxygen and sulfide were the main environmental factors affecting the distribution characteristics of community structure of bacterioplankton.
  • 石花菜(Gelidium amansii)别名海冻菜、红丝、凤尾,是中国重要的经济红藻之一,生长于大干潮线附近及以下6~10 m的海岩上,常见于中国黄海、渤海沿岸,浙江、福建以及台湾沿海也有生长[1]。石花菜是一种利用价值极高的药食两用海藻,不仅营养成分丰富,而且具有降血脂、降血糖、清热解暑、清肺化痰等药用功效[2-3]。Kang等[4]对石花菜提取物的抗肥胖生物活性进行了研究,结果表明石花菜提取物的摄入可大幅降低高脂饮食小鼠(Mus musculus)的体质量,其作用机制可抑制脂肪细胞中脂肪原基因的表达,从而减少脂肪生成;另有多项研究表明,饮食中补充石花菜可有效改善高果糖饮食大鼠的胰岛素抵抗及高脂血症,同时还可降低糖尿病大鼠患慢性炎症和心血管疾病的风险[5-6]。在石花菜所含的多种生物活性物质中,多糖的含量高、用途广泛、可利用度高,尤其受到研究者的关注,从石花菜中提取分离得到的多糖类物质已被证实具有抑菌、抗氧化、抗凝血等生物活性[3,7-8]

    藻类多糖的提取方法众多,目前常见的主要有热水浸提法、酸碱浸提法,新型提取技术有酶法、微波辅助提取法、超声辅助提取法等。近年来,酶提法作用条件温和、提取率高,在提取多糖的过程中可较好地保留其生物活性,因而逐渐得到广泛应用[9-10]。酶在制备多糖的过程中主要起2种作用:1)利用酶的催化活性和高选择性,在较为温和的条件下特异地降解细胞壁等阻碍多糖溶出的屏障,加速多糖的释放[11-12];2)利用酶来降解粗多糖以制备低分子量多糖[13]。海藻细胞壁主要含纤维素,通过纤维素酶处理,可以高效地破坏细胞壁的组织结构,加快海藻多糖的溶出;而木瓜蛋白酶不仅对多糖的提取起到辅助作用,还可促使原料中蛋白质水解,从而脱除部分蛋白,提升溶出液中多糖的纯度[14]。石花菜属中国北方常见红藻,但国内外对其多糖的提取方法的研究有限,目前石花菜多糖的提取仍依赖于传统的水提醇沉方法,此法虽安全简单,但耗时长且温度高,易引起多糖的降解[15],所提多糖质量远不及酶法等新型提取方法[16-17]。因此,本研究以石花菜为实验材料,确定复合酶配比为m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1[18-19],采用复合酶法提取石花菜粗多糖,在单因素实验的基础上运用响应面法优化复合酶法提取石花菜粗多糖的工艺,以期为石花菜天然食品、药品的综合开发利用提供参考依据。

    石花菜干品来源于山东省威海市;纤维素酶(酶活性≥30 U·mg−1)、木瓜蛋白酶(酶活性≥2.0×105 U·mg−1)为生物试剂;葡萄糖标准品、无水乙醇、浓硫酸、苯酚、丙酮等均购于广州领驭生物科技有限公司,为分析纯。

    EYELA N-1000型旋转蒸发仪(上海亚荣生化仪器厂);TDZ5-WS台式低速离心机(湖南湘仪实验室仪器开发有限公司);SUNRISE吸光酶标仪(瑞士TECAN公司);THZ-82回旋水浴恒温振荡器(常州金坛精达仪器制造有限公司);DHG-9145A型电热恒温鼓风干燥箱(上海一恒科技有限公司);Alpha 1-4冷冻干燥仪(德国Christ有限责任公司);GB204电子天平[瑞士METTLER仪器(中国)有限公司];79-1磁力加热搅拌器(天津市赛德利斯实验分析仪器制造厂)。

    本实验采用复合酶法对石花菜粗多糖进行提取,具体工艺流程为:石花菜(干品)→反复清洗去杂质→50 ℃烘箱干燥→粉碎过筛(40目)→按一定料液比加水→50 ℃预热10 min→加入适量复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1]→恒温酶解→沸水浴灭酶15 min→离心(4 000 r·min−1,10 min)→取上清液→测提取率。

    采用苯酚-硫酸法[20]测定石花菜粗多糖提取率(定义为苯酚-硫酸法计算得到的多糖质量占藻粉质量的百分比)。以葡萄糖为标准品,于490 nm处测定吸光度并绘制标准曲线。经线性回归得标准曲线方程A=6.395x+0.009 9,相关系数R²=0.999。式中x为多糖质量浓度(mg·mL−1),A为吸光度。用下式转化得到石花菜粗多糖溶液中多糖的质量浓度:

    $$ {\text{粗多糖提取率}} = \frac{{\left( {A - 0.009\;9} \right) \times V}}{{6.395\;m}} \times 0.9 \times 100{\text{%}} $$

    式中A为苯酚-硫酸法测定的粗多糖溶液吸光度,V为粗多糖溶液体积(mL),m为石花菜藻粉质量(mg);转化系数为0.9。

    分别以不同的复合酶添加量、酶解时间、酶解温度和料液比(g·mL–1,下同)进行单因素实验,分析各因素对于酶解提取石花菜粗多糖的影响。

    1)复合酶添加量对粗多糖提取率的影响。分别称取1 g石花菜藻粉,置于5个容量为100 mL的锥形瓶中,按照藻粉质量的1%、1.5%、2%、2.5%、3%加入复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1),在料液比1∶30、酶解温度60 ℃条件下水浴振荡提取120 min,4 000 r·min−1转速下离心10 min,取上清液测定总糖质量分数。

    2)酶解时间对粗多糖提取率的影响。固定复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1]添加量为藻粉质量2%、料液比1∶30、酶解温度60 ℃,研究不同酶解时间(60、90、120、150和180 min)对粗多糖提取率的影响。

    3)酶解温度对粗多糖提取率的影响。固定复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) = 2∶1]添加量为藻粉质量的2%、料液比1∶30、酶解时间120 min,研究不同酶解温度(45、50、55、60和65 ℃)对粗多糖提取率的影响。

    4)料液比对粗多糖提取率的影响。固定复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1]添加量为藻粉质量的2%、酶解时间120 min、酶解温度60 ℃,研究不同料液比(1∶20、1∶30、1∶40、1∶50、1∶60)对粗多糖提取率的影响。

    在单因素实验的基础上,选取酶添加量(A)、酶解温度(B)、料液比(C) 3个主导因素,每个因素设3个水平,以石花菜粗多糖提取率为响应值,采用Design-Expert 10软件进行三因素三水平Box-Behnken实验设计,通过响应面分析对复合酶法提取石花菜粗多糖的工艺进行优化[21-23]。实验因素及水平见表1

    表  1  响应面分析因素水平表
    Table  1.  Factors and levels used in response surface analysis
    水平
    level
    因素 factor
    酶添加量 (A) /%
    enzyme addition
    酶解温度 (B) /℃
    enzymatic hydrolysis temperature
    料液比 (C) /
    (g·mL−1)
    solid-liquid ratio
    −1 1551∶20
    02601∶30
    13651∶40
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    通过软件Microsoft Excel 2010和IBM SPSS Statistics 23进行实验数据的统计分析以及响应面曲面模型的回归方程和显著性统计分析。采用单因素方差分析(One-Way ANOVA)进行多重比较,P<0.05为差异显著。

    复合酶添加量为1%~2%时,粗多糖提取率随着酶量的增加而提高,并在酶量大于2%时呈下降趋势(图1-a),这与吴金松等[24]研究的甘蔗(Saccharum officinarum)渣中水溶粗多糖的酶法提取最佳工艺中所得结论一致。复合酶作用于石花菜细胞壁结构,使其降解,从而加速了细胞内容物的释放。随着复合酶添加量的增加,酶和底物接触的机会也随之增加,在相同时间内释放出的粗多糖含量也因此升高。此后若进一步增加酶量,由于酶分子已达饱和状态,部分复合酶不能再与底物结合,不仅不会增加粗多糖的提取率,还会造成复合酶的浪费。因此,选取复合酶添加量为2%。

    图  1  不同因素对粗多糖提取率的影响
    Figure  1.  Effect of different factors on extraction yield of polysaccharide

    酶解的前120 min,随着反应时间的延长,石花菜粗多糖的提取率呈上升趋势,并在120 min时达到最高(图1-b),此时酶和底物得到充分反应;但在酶解120 min后,随着时间延长粗多糖的提取率下降,可能是由于提出来的粗多糖再次分解导致提取量降低(图1-b),这可能和复合酶发挥作用的最适反应时间及最适反应温度有关,说明不一定酶解时间越长越能发挥复合酶的活力。陈胜军等[25]通过响应面实验对胰蛋白酶提取鲍鱼(Haliotis sp.)内脏多糖的工艺进行优化,单因素实验中发现酶解时间为1~2 h时多糖提取率逐渐增加,超过2 h后多糖提取率反而下降,推测可能是在酶解2 h时多糖得到最大程度的溶出,而酶解时间过长酶解液易变质,从而导致多糖提取率下降。综上,最佳的石花菜酶解时间为120 min。

    当温度低于60 ℃时,随着温度的升高,石花菜粗多糖的提取率不断升高,尤其在60 ℃前提取率升高最为明显(图1-c),该温度可能是木瓜蛋白酶与纤维素酶在实验条件下的最适温度;温度大于60 ℃后,石花菜粗多糖的提取率大幅度下降,可能是温度过高引起了复合酶活力的下降,从而使得提取率也随之降低。刘焕燕等[26]在利用复合酶提取毛竹笋(Phyllostachys heterocycla)多糖时也得出了相似的结论,其发现在酶解温度为30~50 ℃时多糖的提取率逐渐上升,温度高于50 ℃时多糖得率出现下降,分析可能是由于温度过高导致酶失活。因此,选择石花菜粗多糖的酶解温度为60 ℃。

    石花菜粗多糖的提取率随料液比的增加呈先升高后降低的趋势,且在料液比为1∶30时达到最大(图1-d)。最初提取率的升高可能是因溶剂增多扩大了反应体系中复合酶与石花菜藻粉接触的面积,增加了石花菜粗多糖的浓度梯度从而使得更多的多糖被溶出;后期随着溶剂的进一步增加,反应体系中的酶浓度受到较大影响,可能导致提取率的降低。此外,料液比过高还会导致后续工艺的操作负担[27-28]。雍成文等[29]在复合酶法提取黄秋葵(Abelmoschus esculentus)多糖的研究中发现,在料液比为1∶30时黄秋葵多糖达到最大提取率,超过或低于此比率,多糖的提取率均会有所下降,主要原因在于多糖从植物细胞壁溶出到溶剂中的过程取决于质量浓度差的推动,溶剂越多则质量浓度差越大,因而推动力增强,但溶剂量若超过一定范围,则会引起复合酶质量浓度的降低,进而降低了复合酶的催化效率。综上,最佳料液比确定为1∶30。

    根据单因素实验结果,选取复合酶添加量、酶解温度及料液比这3个主导因素进行三因素三水平的响应面实验分析,响应面实验设计方案及结果见表2

    表  2  响应面实验设计方案及结果
    Table  2.  Program and test results of RSM
    编号
    No.
    因素 factor粗多糖提取率 (Y) /%
    extraction yield of polysaccharide
    酶添加量 (A) /%
    enzymes addition
    酶解温度 (B) /℃
    enzymatic hydrolysis temperature
    料液比 (C) /(g·mL−1)
    solid-liquid ratio
    1 2 60 1∶30 15.50
    2 1 60 1∶40 12.18
    3 3 60 1∶20 11.94
    4 1 55 1∶30 8.97
    5 2 60 1∶30 15.27
    6 2 60 1∶30 15.79
    7 2 60 1∶30 16.57
    8 2 60 1∶30 15.76
    9 2 65 1∶40 10.40
    10 3 65 1∶30 11.37
    11 3 60 1∶40 13.94
    12 3 55 1∶30 9.20
    13 2 65 1∶20 8.28
    14 1 65 1∶30 9.01
    15 2 55 1∶20 7.20
    16 2 55 1∶40 8.52
    17 1 60 1∶20 11.34
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    以复合酶添加量、酶解温度和料液比作为研究对象条件,以石花菜粗多糖的提取率为响应值,共得到17个实验点(表2)。利用Design-Expert 10软件对表2中的数据进行多元回归拟合,最终得到石花菜粗多糖提取率(Y)对复合酶添加量(A)、酶解温度(B)、料液比(C)三因素的二次多项回归模型为Y=15.78+0.617A+0.647B+0.785C+0.533AB+0.288AC+0.199BC−1.195A2−4.943B2−2.235C2

    对复合酶法提取石花菜粗多糖的响应面数学模型进行方差分析(表3)。结果显示,该实验模型极显著(P<0.000 1),失拟项不显著(P>0.05),表明模型可用;模型的相关系数R2=0.993 0,$ {R}_{\rm adj}^2$=0.984 0,说明该回归模型可对99.3%的结果值变化规律做出解释,基本可用于复合酶提取石花菜粗多糖的分析和预测[30-31]。此外,在此模型中ABAB项均显著(P<0.05),CA2B2C2项均为极显著(P<0.01,表3),分析可知所选3个因素对石花菜粗多糖提取率影响的主次为C (料液比)>B (酶解温度)>A (复合酶添加量)。

    表  3  模型回归方程方差分析
    Table  3.  ANOVA of regression equation
    方差来源
    source
    平方和
    SS
    自由度
    df
    均方
    MS
    FP显著性
    significance
    模型 model 152.86 9 16.98 110.34 < 0.000 1 ***
    A 3.04 1 3.04 19.77 0.003 **
    B 3.34 1 3.34 21.73 0.002 3 **
    C 4.92 1 4.92 31.99 0.000 7 ***
    AB 1.14 1 1.14 7.38 0.029 9 *
    AC 0.33 1 0.33 2.15 0.185 9
    BC 0.16 1 0.16 1.03 0.343 2
    A2 6.01 1 6.01 39.05 0.000 4 ***
    B2 102.88 1 102.88 668.41 < 0.000 1 ***
    C2 21.02 1 21.02 136.59 < 0.000 1 ***
    残差 residual 1.08 7 0.15
    失拟项 lack of fit 0.12 3 0.04 0.17 0.913 5
    绝对误差 pure error 0.96 4 0.24
    总误差 total error 153.93 16
    注:*. 差异显著(P<0.05);**. 差异极显著(P<0.01);***. 差异极极显著(P<0.001) Note: *. significant difference (P<0.05); **. very significant difference (P<0.01); ***. extremely significant difference (P<0.001)
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    各因素以及因素之间的交互作用对响应值的影响见图2。在等高线图中圆形等高线表示相应变量之间的交互作用不显著,而椭圆形或马鞍形等形状则表明因素之间有较为显著的交互作用[32]

    图  2  两因素交互作用对多糖提取率的响应面图和等高线图
    Y. 粗多糖提取率;A. 酶添加量;B. 酶解温度;C. 料液比
    Figure  2.  Response surface and contour plots of variable parameters on extraction yield of polysaccharide
    Y. extraction yield of polysaccharide; A. enzyme addition; B. enzymatic hydrolysis temperature; C. solid-liquid ratio

    通过比较响应曲面图的陡峭程度可发现,料液比对粗多糖得率的影响最大,其次是酶解温度,这与方差分析结果吻合。复合酶添加量(A)和酶解温度(B)交互影响显著(P<0.05,图2)。在复合酶添加量一定的情况下,随着酶解温度的升高,石花菜粗多糖的提取率呈先增加后下降的趋势,这可能是最初随着酶解温度升高,反应体系的温度逐渐接近复合酶的最适反应温度,酶促反应速度不断加快,因而提取率不断升高;当酶解温度继续升高,高温可能会引起酶蛋白的变性失活,酶活力降低致使提取率下降。当酶解温度一定时,随复合酶添加量的增加,粗多糖提取率亦先不断增加后略有下降,这是因为在底物浓度一定的情况下,随着复合酶添加量的增加,复合酶和石花菜细胞壁的接触机会增加,酶解作用得到加强,使得提取率有所升高;当溶液中复合酶浓度过大时,酶蛋白自身发生水解,反而使提取率有所下降。复合酶添加量与料液比、酶解温度与料液比之间交互影响不显著。

    利用Design-Expert 10软件进行分析,得到石花菜粗多糖的最佳复合酶辅助提取条件为复合酶添加量2.30%、酶解温度60.43 ℃、料液比1∶32。在此条件下,石花菜粗多糖的提取率最高,预测为15.98%。考虑实际操作条件,对此优化后工艺参数进行修正,修正后为复合酶添加量2.30%、酶解温度60.5 ℃、料液比1∶32。以此结果为条件做3组平行实验进行验证,发现该条件下石花菜粗多糖提取率为16.18%,与预测值基本一致,充分证明了该响应面法优化所得的工艺条件准确可靠,说明所得模型具有实用价值。

    本实验以石花菜为原料,运用响应面实验设计及分析方法,对复合酶[m (木瓜蛋白酶)∶m (纤维素酶) =2∶1]法提取石花菜粗多糖的工艺参数进行优化,得出复合酶法提取石花菜粗多糖的最佳工艺条件为复合酶添加量2.30%、酶解温度60.43 ℃、料液比1∶32、酶解时间120 min。在此条件下石花菜粗多糖的提取率约为15.98%。

    除酶法提取外,目前藻类多糖较常用的提取方法还有热水浸提法及超声波辅助提取法等,许瑞波等[33]对石花菜多糖的热水浸提方法进行了优化,结果显示在其最佳提取工艺条件下石花菜多糖的提取率为30.17%,该提取率虽高于复合酶提取法,但需重复提取3次,每次2 h,耗时长且工艺繁琐;刘言炜等[34]采用超声波辅助冻融法提取蓝藻多糖,通过响应面实验确定最佳提取工艺为超声波功率487.20 W、超声温度66.52 ℃、液料比24.72∶1,在此条件下蓝藻多糖提取率为6.17%,此法引入的杂质少、操作简单,但提取率较低。

    综合各种因素分析来看,复合酶法提取石花菜粗多糖可在提取过程中有效破除石花菜细胞壁,在相对温和的提取条件下促使多糖的溶出;同时,木瓜蛋白酶的加入可将部分结合蛋白水解,起到初步的脱蛋白作用,为后续分离纯化提供方便,所得多糖质量高,具有实用价值。经过复合酶提取得到的粗多糖中含有部分非多糖杂质,在后续的实验中将对石花菜粗多糖进行进一步的分离纯化,以及对纯化后的多糖进行相关生物活性研究,以期为制备具有良好生物活性的天然多糖提供资源准备。

  • 图  1   凡纳滨对虾养殖池塘门水平的浮游细菌组成

    Figure  1.   Composition of bacteriaoplankon at phylum level in L. vannamei ponds

    图  2   各池塘优势菌群组成及变动

    Figure  2.   Composition and changes of dominant flora in each pond

    图  3   3口池塘的α多样性系数分析

    注:箱体上中下线分别为75、50 (中位数) 和25分位数,轴须线最长不超过1.5倍箱体范围,黑色空心圆表示平均数;差异显著性用* (P<0.05)、** (P<0.01)以及*** (P<0.001) 表示;图中的样本量:A:n=22、B:n=12、C:n=12。

    Figure  3.   α diversity index analysis of bacterioplankton in three ponds

    Note: The upper, middle and lower lines of the box are 75, 50 (Median) and 25 quantiles, respectively. The maximum length of whiskers shall not exceed 1.5 times of the box range. The black hollow circles represent the average values. The significant differences were represented by * (P<0.05), ** (P<0.01) and *** (P<0.001). The numbers of replicated samples in this figure are: A: n=22; B: n=12; C: n=12.

    图  4   凡纳滨对虾养殖池塘浮游细菌群落NMDS分析

    Figure  4.   NMDS analysis of bacterioplankton community in L. vannamei pond

    图  5   各池浮游细菌属水平上共有和特有属的数量

    Figure  5.   Number of common and endemic genera of bacterioplankton at genus level in each pond

    图  6   各池浮游细菌群落的线性判别分析 (菌群LDA>4)

    Figure  6.   Linear discriminant analysis of bacterioplankton community in each pond (Bacterial flora with LDA>4)

    图  7   优势菌群分布和群落多样性 (H') 与主要理化因子之间的关系 (II型标尺)

    注:Aci. 不动杆菌属;Aer. 气单胞菌属;Fla. 黄杆菌属;Gem. 芽殖杆菌属;GpI. GpIIa;Ilu. 微酸菌属;Lim. 湖栖菌属;Pol. 多核杆菌;Rho. 红杆菌属;Sed. 沉积物杆状菌属;Spa. 发光细菌属;Sph. 鞘脂菌属。

    Figure  7.   Species associations of dominan flora and diversity (H') with environmental factors (Scaling II)

    Note: Aci. Acinetobacter sp.; Aer. Aeromonas sp.; Fla. Flavobacterium sp.; Gem. Gemmobacter sp.; GpI. GpIIa; Ilu. Ilumatobacter sp.; Lim. Limnohabitans sp.; Pol. Polynucleobacter sp.; Rho. Rhodobacter sp.; Sed. Sediminibacterium sp.; Spa. Spartobacteria genera incertae sedis; Sph. Sphingomonas sp..

    表  1   凡纳滨对虾养殖池塘水体主要理化因子

    Table  1   Environmental factors in L. vannamei ponds

    环境因子
    Environmental factor
    池塘A
    Pond A
    池塘B
    Pond B
    池塘C
    Pond C
    水温 Temperature/℃ 26.19±2.01 26.15±1.57 26.37±2.00
    pH 8.10±0.50 8.29±0.37 8.30±0.38
    溶解氧质量浓度 DO/(mg·L−1) 8.00±0.68 8.45±1.17 8.11±1.15
    铵态氮质量浓度 NH4-N/(mg·L−1) 0.45±0.73 0.44±0.39 0.33±0.27
    亚硝酸氮质量浓度 NO2-N/(mg·L−1) 0.01±0.01 0.01±0.01 0.01±0.01
    硝酸态氮质量浓度 NO3-N/(mg·L−1) 0.34±0.44 0.41±0.42 0.48±0.53
    活性磷质量浓度 PO4-P/(mg·L−1) 0.12±0.14 0.37±0.24 0.22±0.28
    活性硅酸盐质量浓度 SiO3-Si/(mg·L−1) 11.2±3.55 12.38±7.38 4.03±2.98
    高锰酸盐指数 CODMn/(mg·L−1) 8.34±7.19 6.12±3.18 5.34±2.91
    叶绿素 a 质量浓度 Chl-a/(mg·L−1) 75.78±131.01 56.13±42.81 58.36±61.48
    硫化物质量浓度 Sul/(mg·L−1) 0.03±0.04 0.02±0.01 0.02±0.01
    矿化度质量浓度 Mineralization degree/(mg·L−1) 1209.44±2445.58 813.39±171.69 814.35±41.91
    碱度 ALK/(mg·L−1) 138.18±12.06 115.32±33.82 84.46±14.73
    总硬度 Total hardness/(mg·L−1) 362.76±395.28 476.5±227.34 349.36±60.18
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    表  2   各样本有效序列数据统计

    Table  2   Valid sequences of each sample

    样品
    Sample
    条形码
    Barcode
    有效序列
    Valid sequence/条
    碱基数
    Base number
    平均长度
    Mean length/bp
    最短序列长度
    Min. length/bp
    最长序列长度
    Max. length/bp
    S1GTAACA82 73634 604 966418.26363469
    S2CCAGAC81 90534 619 470422.68361476
    S3GGTGAA56 85923 683 959416.54367475
    S4TGCATC85 21235 667 198418.57353469
    S5TCGACC83 24634 547 936415.01365470
    S6GTCGCG73 82930 547 465413.76362453
    S7CGGATG83 66234 668 763414.39356465
    S8GTGAAA84 38434 811 366412.54350466
    S9ATCTTG100 94541 590 813412.01350452
    S10TATGCA73 80130 659 241415.43352459
    S11GTAACA86 47135 924 249415.45354471
    S12GCGAGG90 43237 722 526417.14351465
    S13CACGAT54 43922 735 194417.63373465
    S14GCGGTA44 22718 478 585417.81352471
    S15TATCGA61 43125 638 627417.36359473
    S16ATCACG52 38421 792 829416.02376471
    S17CGGATG99 21141 215 038415.43360473
    S18CGCATA100 00141 427 908414.27372476
    S19TGCATC65 71227 246 907414.64359476
    S20TCAGTA76 02931 690 841416.83362471
    S21CGGCAC75 20231 405 455417.61364469
    S22ATCACG71 60530 328 221423.55352470
    S23CGGATG63 35826 635 233420.39367470
    S24GTGAAA56 42923 698 925419.98350471
    S25TCAGTA92 40038 487 742416.53355435
    S26GAAGTG87 30537 043 958424.31368448
    S27TCGACC94 07539 472 386419.58360464
    S28CTTGTA52 27322 054 548421.91373472
    S29GTTTCG44 69718 684 447418.02360462
    S30ATCTTG59 73725 072 871419.72365465
    S32GCCATC78 46232 993 239420.5357474
    S33TGTGTT69 61329 167 734419.00351474
    S34CTTGTA56 08323 551 548419.94356471
    S35GTTTCG45 70118 993 334415.60359464
    S36TTCGTA46 33719 212 573414.63356468
    S37CCAGAC51 97821 598 326415.53372436
    S38AGCAGT77 23331 835 991412.21350470
    S39GAGGAA75 22631 060 291412.89370468
    S40AAGGTA46 92019 633 227418.44352450
    S41ATCACG43 98318 242 559414.76352469
    S42TAGGAC66 63927 702 230415.71356470
    S43TGGACG49 20620 369 621413.97357472
    S44AGAACA50 32220 765 128412.65356469
    S45GGTGTG41 16917 011 770413.22350471
    S46AACTAT67 69128 070 176414.68357468
    S47ACTGCG60 22025 559 117424.43359474
    S48TGTGTT94 26139 467 506418.7355474
    S49TAGGAC86 90436 530 365420.35353467
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  • [1]

    CABELLO F C. Heavy use of prophylactic antibiotics in aquaculture: a growing problem for human and animal healthy and for the environment[J]. Environ Microbiol, 2006, 8: 1137-1144. doi: 10.1111/j.1462-2920.2006.01054.x

    [2]

    MA Z, SONG X, WAN R, et al. A modified water quality index for intensive shrimp ponds of Litopenaeus vannamei[J]. Ecol Indic, 2013, 24: 287-293. doi: 10.1016/j.ecolind.2012.06.024

    [3]

    GONZALEZ J M, SIMO R, MASSANA R, et al. Bacterial community structure associated with a dimethylsulfo niopropionate-producing North Atlantic algal bloom[J]. Appl Environ Microb, 2000, 66: 4237-4246. doi: 10.1128/AEM.66.10.4237-4246.2000

    [4]

    WEI C L, ZENG Y H, TANG K X, et al. Comparison of bacterioplankton communities in three mariculture ponds farming different commercial animals in subtropical Chinese coast[J]. Hydrobiologia, 2009, 632: 107-126. doi: 10.1007/s10750-009-9831-8

    [5]

    CARON D A. Inorganic nutrients, bacteria, and the microbial loop[J]. Microb Ecol, 1994, 28: 295-298. doi: 10.1007/BF00166820

    [6]

    COTNER J B, BIDDANDA B. Small players, large role: microbial influence on biogeochemical processes in pelagic aquatic ecosystems[J]. Ecosystems, 2002, 5: 105-121. doi: 10.1007/s10021-001-0059-3

    [7]

    LEMONNIER H, COURTIES C, MUGNIER C, et al. Nutrient and microbial dynamics in eutrophying shrimp ponds affected or unaffected by vibriosis[J]. Mar Pollut Bull 2010, 60: 402-411.

    [8]

    AMANN R I. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation[J]. Microbiol Rev, 1995, 59: 143-169. doi: 10.1128/mr.59.1.143-169.1995

    [9]

    LI C, LIU J, CHEN X, et al. Determinism governs the succession of disturbed bacterioplankton communities in a coastal maricultural ecosystem[J]. Sci Total Environ, 2022, 828: 154457. doi: 10.1016/j.scitotenv.2022.154457

    [10]

    LIU C H, CHANG F H, YANG J W, et al. Free-living marine bacterioplankton composition and diversity along the Kuroshio region[J]. Deep-Sea Res I, 2022, 183: 103741. doi: 10.1016/j.dsr.2022.103741

    [11]

    LU Z B, REN Z M, LIN W H, et al. Succession, sources, and assembly of bacterial community in the developing crab larval microbiome[J]. Aquaculture, 2021, 548: 737600.

    [12]

    LIU Y P, PAN B Z, ZHU X Z, et al. Patterns of microbial communities and their relationships with water quality in a large-scale water transfer system[J]. J Environ Manage, 2022, 319: 115678. doi: 10.1016/j.jenvman.2022.115678

    [13] 靳燕, 邱莹, 董志, 等. 北运河浮游细菌集合群落空间变化的环境解释[J]. 中国环境科学, 2021, 41(3): 1378-1386. doi: 10.3969/j.issn.1000-6923.2021.03.041
    [14] 杨淑芳. 凡纳滨对虾养殖池塘水质动态变化及细菌多样性研究[D]. 厦门: 集美大学, 2017: 10-19.
    [15] 张皓. 养殖环境微生物群落的动态变化及与水环境的互作[D]. 苏州: 苏州大学, 2015: 16-29.
    [16]

    YANG W, ZHENG C, ZHENG Z M, et al. Nutrient enrichment during shrimp cultivation alters bacterioplankton assemblies and destroys community stability[J]. Ecotox Environ Safe, 2018, 156: 366-374. doi: 10.1016/j.ecoenv.2018.03.043

    [17]

    YANG W Z, ZHENG J Y, CHEN Q, et al. Succession of bacterioplankton community in intensive shrimp (Litopenaeus vannamei) aquaculture systems[J]. Aquaculture, 2018, 497: 200-213. doi: 10.1016/j.aquaculture.2018.07.053

    [18] 国家环境保护总局水和废水检测分析方法编委会. 水和废水检测分析方法(第四版)[M]. 北京: 中国环境科学出版社, 2002: 30-152.
    [19]

    EDGAR R C. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST[J]. Bioinformatics, 2010, 26(19): 2460-2461. doi: 10.1093/bioinformatics/btq461

    [20]

    AKSNES D L, WASSMANN P. Modeling the significance of zooplankton grazing for export production[J]. Limnol Oceanogr, 1993, 38(5): 978-985. doi: 10.4319/lo.1993.38.5.0978

    [21]

    FAITH D P. Conservation evaluation and phylogenetic diversity[J]. Biol Conserv, 1992, 61: 1-10. doi: 10.1016/0006-3207(92)91201-3

    [22]

    SHANNON C E, WEAVER W. The mathematical theory of communication[M]. Urbana, IL: University of Illinois Press, 1949: 55-187.

    [23] 杨家新. 微生物生态学[M]. 北京: 化学工业出版社, 2004: 45-134.
    [24]

    HAN J H, BAEK K, LEE M H. Lacibacter nakdongensis sp. nov., isolated from river sediment[J]. Int J Syst Evol Microbiol, 2017, 67: 352-356. doi: 10.1099/ijsem.0.001631

    [25]

    WITCZAK P, CYDZIK-KWIATKOWSKA A, ZIELIŃSKA M. Treatment of the liquid phase of digestate from a biogas plant for water reuse[J]. Bio Tech, 2019, 276: 226-235. doi: 10.1016/j.biortech.2018.12.077

    [26]

    XUAN L, SHENG Z, LU J, et al. Bacterioplankton community responses and the potential ecological thresholds along disturbance gradients[J]. Sci Total Environ, 2019, 696: 134015. doi: 10.1016/j.scitotenv.2019.134015

    [27]

    YANG Y, GAO Y, HUANG X, et al. Adaptive shifts of bacterioplankton communities in response to nitrogen enrichment in a highly polluted river[J]. Environ Pollut, 2019, 245: 290-299. doi: 10.1016/j.envpol.2018.11.002

    [28]

    COMTE J, del GIORGIO P A. Composition influences the pathway but not the outcome of the metabolic response of bacterioplankton to resource shifts[J]. PLoS One, 2011, 6: e25266. doi: 10.1371/journal.pone.0025266

    [29]

    ADAMOVICH B V, MEDVINSKY A B, NIKITINA L V, et al. Relations between variations in the lake bacterioplankton abundance and the lake trophic state: evidence from the 20-year monitoring[J]. Ecol Indic, 2019, 7: 120-129.

    [30] 吕锡斌, 吴云成, 陈良强, 等. 赤水河流域浮游细菌群落特征及其与水质的关系[J]. 环境科学学报, 2021, 41(11): 4596-4605. doi: 10.13671/j.hjkxxb.2021.0125
    [31]

    JING X Y, GOU H, GONG Y, et al. Seasonal dynamics of the coastal bacterioplankton at intensive fish-farming areas of the Yellow Sea, China revealed by high-throughput sequencing[J]. Mar Pollut Bull, 2019, 139: 366-375. doi: 10.1016/j.marpolbul.2018.12.052

    [32]

    SHADE A, HANNES P, STEVEN D A, et al. Fundamentals of microbial community resistance and resilience[J]. Front Microbiol, 2012, 19(3): 417.

    [33] 郭远涛. 吸附固定化对藻菌共生体在畜禽养殖废水处理中的强化效果研究[D]. 南昌: 南昌大学, 2021: 12-36.
    [34]

    CAVENDER-BARES J, KOZAK K H, FINE P V A, et al. The merging of community ecology and phylogenetic biology[J]. Ecol Lett, 2009, 12: 693-715. doi: 10.1111/j.1461-0248.2009.01314.x

    [35]

    CHESSON P. Mechanisms of maintenance of species diversity[J]. Annu Rev Ecol Syst, 2000, 31: 343-366. doi: 10.1146/annurev.ecolsys.31.1.343

    [36]

    FAN L M, HU G D, QIU L P, et al. Variations in bacterioplankton communities in aquaculture ponds and the influencing factors during the peak period of culture[J]. Environ Pollut, 2020, 258: 113656. doi: 10.1016/j.envpol.2019.113656

    [37]

    IVES A R, CARPENTER S R. Stability and diversity of ecosystems[J]. Science, 2007, 317: 58-62. doi: 10.1126/science.1133258

    [38]

    YACHI S, LOREAU M. Biodiversity and ecosystem productivity in a fluctuating environment: the insurance hypothesis[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1999, 96: 1463-1468. doi: 10.1073/pnas.96.4.1463

    [39] 胡晓娟, 李卓佳, 曹煜成, 等. 强天气干扰条件下粤西凡纳滨对虾养殖池塘细菌群落动态特征[J]. 南方水产科学, 2012, 8(5): 52-59. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2012.05.008
    [40]

    CONNELL J H. Diversity in tropical rain forests and coral reefs: high diversity of trees and corals is maintained only in a non-equilibrium state[J]. Science, 1978, 199: 1302-1310. doi: 10.1126/science.199.4335.1302

  • 期刊类型引用(10)

    1. 杨超,赵国庆,韩海斌,张衡,商宸,苏冰,刘思源,蒋佩雯,相德龙,罗民波. 西北太平洋公海远东拟沙丁鱼渔业生物学特征. 海洋渔业. 2024(01): 20-31 . 百度学术
    2. 何露雪,付东洋,李忠炉,王焕,孙琰,刘贝,余果. 南海西北部蓝圆鲹时空分布及其与环境因子的关系. 渔业科学进展. 2023(01): 24-34 . 百度学术
    3. 崔国辰,玄文丹,魏裙倚,陶迎新,苏施,余谦超,朱文斌. 基于SST和Chl-a的西南大西洋阿根廷滑柔鱼渔场时空变动分析. 浙江海洋大学学报(自然科学版). 2023(01): 10-19 . 百度学术
    4. 刘思源,张衡,杨超,方舟. 西北太平洋远东拟沙丁鱼与日本鲭种群动态特征及其与环境因子关系研究进展. 大连海洋大学学报. 2023(02): 357-368 . 百度学术
    5. 杨超,张衡,韩海斌,赵国庆,石永闯,徐博,蒋沛雯,严云志,葛雅丽. 北太平洋远东拟沙丁鱼渔场时空分布及其最适环境特征. 渔业科学进展. 2023(04): 99-110 . 百度学术
    6. 刘思源,张衡,杨超,方舟. 基于最大熵模型的西北太平洋远东拟沙丁鱼和日本鲭栖息地差异. 上海海洋大学学报. 2023(04): 806-817 . 百度学术
    7. 赵国庆,吴祖立,崔雪森,樊伟,石永闯,肖戈,唐峰华. 基于空间自相关模型的西北太平洋日本鲭渔场时空变动研究. 海洋学报. 2022(01): 22-35 . 百度学术
    8. 赵国庆,石永闯,樊伟,崔雪森,唐峰华. 西北太平洋灯光围网主要渔获物组成及渔场变动研究. 南方水产科学. 2022(01): 33-42 . 本站查看
    9. 董恩和,林建杰,罗俊荣,张衡,严云志,葛雅丽,陈云云,杨超,韩海斌. 我国公海渔业发展现状、影响因素与应对措施. 渔业信息与战略. 2022(01): 12-18 . 百度学术
    10. 孙永文,张胜茂,唐峰华,王书献,樊伟,范秀梅,杨胜龙. 基于卫星船位数据的北太平洋作业渔船分布及类型研究. 中国农业科技导报. 2022(08): 207-217 . 百度学术

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出版历程
  • 收稿日期:  2022-07-10
  • 修回日期:  2022-09-27
  • 录用日期:  2022-10-23
  • 网络出版日期:  2022-10-26
  • 刊出日期:  2023-04-04

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