海洋细菌来源 β-琼胶酶的生物信息学分析与高效制备

尤钰娴, 解文嫣, 班宵逢, 孔昊存, 李才明, 李兆丰

尤钰娴, 解文嫣, 班宵逢, 孔昊存, 李才明, 李兆丰. 海洋细菌来源 β-琼胶酶的生物信息学分析与高效制备[J]. 南方水产科学, 2022, 18(2): 1-12. DOI: 10.12131/20210330
引用本文: 尤钰娴, 解文嫣, 班宵逢, 孔昊存, 李才明, 李兆丰. 海洋细菌来源 β-琼胶酶的生物信息学分析与高效制备[J]. 南方水产科学, 2022, 18(2): 1-12. DOI: 10.12131/20210330
YOU Yuxian, XIE Wenyan, BAN Xiaofeng, KONG Haocun, LI Caiming, LI Zhaofeng. Bioinformatics analysis and efficient preparation of β-agarase from marine bacteria[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(2): 1-12. DOI: 10.12131/20210330
Citation: YOU Yuxian, XIE Wenyan, BAN Xiaofeng, KONG Haocun, LI Caiming, LI Zhaofeng. Bioinformatics analysis and efficient preparation of β-agarase from marine bacteria[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(2): 1-12. DOI: 10.12131/20210330

海洋细菌来源 β-琼胶酶的生物信息学分析与高效制备

基金项目: 国家重点研发计划项目 (2019YFD0901901)
详细信息
    作者简介:

    尤钰娴 (1996—),女,博士研究生,研究方向为淀粉生物技术。E-mail: yuxianyou@stu.jiangnan.edu.cn

    通讯作者:

    李兆丰 (1979—),男,教授,博士,从事淀粉生物技术研究。E-mail: zfli@jiangnan.edu.cn

  • 中图分类号: Q 814.9

Bioinformatics analysis and efficient preparation of β-agarase from marine bacteria

  • 摘要: 为丰富优质琼胶酶品类,充分利用海藻资源,实现功能性琼胶寡糖的高效制备,采用基因组挖矿技术挖掘得到一个来源于海洋细菌——淡黄色噬琼胶菌 (Agarivorans gilvus) WH0801的β-琼胶酶 (β-AGA酶),利用生物信息学分析对该酶的理化性质和结构特征进行预测,发现该酶为非分泌性蛋白。在此基础上,采用分子生物学手段引入信号肽,实现了该酶在大肠杆菌 (Escherichia coli) 中的胞外表达,并通过发酵调控策略优化提高其生产效率。结果表明,采用种龄5 h的种子培养液进行发酵,发酵出发培养基为TB (pH 7.0),碳源为6 g·L−1的果糖,氮源为30 g·L−1的酵母提取液Ⅱ,于25 ℃培养2 h后加入终浓度为0.025 mmol·L−1的IPTG诱导48 h,此条件下发酵所得酶活为16.72 U·mL−1,相比初始酶活提高了约5倍,证明β-AGA酶具有良好的工业应用潜力。
    Abstract: In order to expand the high-quality agarase categories, make full use of seaweed resources, and realize the efficient preparation of functional agar oligosaccharides, we derived a β-agarase from the marine bacterium (Agarivorans gilvus WH0801)(β-AGAase) by using genome mining technology, and predicted its physical and chemical properties as well as structural characteristics by bioinformatics analysis. Based on the results, β-AGAase is a non-secreted protein. The β-AGAase was extracellular expressed in Escherichia coli through the introduction of signal peptides by molecular biology methods, and its production efficiency was significantly enhanced through fermentation regulation strategy optimization. The optimal fermentation conditions are as followed: seed culture medium with an inoculation time of 5 h; fermentation starting medium was TB (pH 7.0); carbon source was 6 g·L−1 of fructose; nitrogen source was 30 g·L−1 of yeast extract II. After being cultured at 25 ℃ for 2 h, IPTG was added with a final concentration of 0.025 mmol·L−1 for 48 h induction. Under these conditions, the obtained enzyme activity was 16.72 U·mL−1 and was about 5 times higher than the initial enzyme activity, which proves that β-AGAase is of great potential for industrial application.
  • 环保酵素起源于泰国,2006年由Rosukon博士利用有机固体废物开发获得。环保酵素是由废弃水果或其果皮、蔬菜、糖 (白糖、红糖或蜜糖) 和水发酵而成[1],为复杂的多物质混合体系,包含水、发酵菌、蛋白质 (酶)、有机酸和无机盐等[2]。其中,发酵菌种的差异会导致酵素成分的不同,这也是酵素值得深入研究的原因之一。环保酵素具有较高的酶活性和抑菌性,在农业研究中发现,环保酵素可作为有机肥料[3-4],作物土质改良剂[5],蔬菜病害[6]、虫害[7]防治剂等。在水产养殖中,具有促进有益藻类生长[3]、降低养殖污泥中有机物含量[8-9]、改善养殖水质[10]、提高水产动物饲料利用率[4]和增强养殖动物免疫力[11]等作用。近年来,环保酵素的应用范围仅局限于马来西亚、日本及中国台湾地区,而中国大陆地区尚未广泛推行,应用方面的报道甚少[12]。对于将环保酵素作为水产病原微生物抑制剂相关方面的研究则更为匮乏。

    细菌性疾病一直是制约水产养殖业健康和可持续发展的关键因素之一,许多水生微生物如嗜水气单胞菌 (Aeromonas hydrophila)[13]、维氏气单胞菌 (A. veronii)[14]、坎氏弧菌 (Vibrio campbellii)[15-17]、轮虫弧菌 (V. rotiferianus)[18]、迟缓爱德华氏菌 (Edwardsiella tarda)[19]、副溶血弧菌 (V. parahemolyticus)[20]、哈维氏弧菌 (V. harveyi)[21-22]等均可引起水产动物患病,严重者还可致其死亡。目前,抗生素、化学药物仍然是治疗水产动物细菌病的最有效措施,然而由于养殖经济动物体内的药物残留及病原菌耐药性问题,寻找抗生素及化学药物的安全替代品已成为治疗水产动物细菌病的重要课题。环保酵素中存在大量的酶、益生菌、有机酸等物质,具有抑制水产病原菌的潜力,因此,开展环保酵素对水产病原菌的控制研究十分必要。

    本文旨在探讨自制环保酵素对弧菌科4种主要水产病原菌 (坎氏弧菌SP-1、哈维氏弧菌SP-1、轮虫弧菌SP-1及嗜水气单胞菌245) 的体外抑制作用,初步确定所用的自制环保酵素在抑菌过程中发挥抑菌功能的主要物质。用自制环保酵素短时间药浴的方式评估其对嗜水气单胞菌攻毒斑马鱼 (Danio rerio) 的保护效果,分离并鉴定发酵后期自制环保酵素中的优势发酵菌株,为环保酵素的标准化生产及其在水产养殖中的推广应用提供理论依据。

    水产病原菌:坎氏弧菌SP-1、哈维氏弧菌SP-1、轮虫弧菌SP-1、嗜水气单胞菌245均分离自天津地区发病鱼,经过16S rRNA基因序列信息鉴定,保存于天津市水产生态及养殖重点实验室。细菌培养材料:卢里亚·伯塔尼 (Luria-Bertani, LB) 肉汤、LB琼脂、酵母浸出粉胨葡萄糖 (Yeast extract peptone dextrose, YPD) 肉汤、YPD琼脂购自北京陆桥技术股份有限公司。自制环保酵素采用萎蔫枯黄但未腐烂的清洁蔬菜、水果,在可排气发酵桶中自然发酵12个月制成。试验用斑马鱼购自天津市西青区张家窝镇水族市场。

    多功能酶标仪 (4MK2,赛默飞世尔科技有限公司Thermofisher);高速冷冻离心机 (YZB/GER 1841-2014, Thermofisher)。

    取环保酵素的上清液,以0.22 μm无菌滤膜过滤去除酵素中的微生物,制备无菌酵素上清液。采用96孔板比浊法,将4株对数末期病原菌以1%接种量分别接种至LB液体培养基 [ 初始浓度为 (1~3) ×107 CFU·mL−1]。添加不同浓度的无菌酵素上清液使其终体积分数介于2%~14%,以在LB液体培养基中加入与环保酵素同等体积生理盐水的样品作为空白对照组。30 ℃静置培养24 h,以多功能酶标仪测定OD600值,与未接种微生物的培养基 (含相同浓度酵素) 相比,以OD值不增加的最低酵素浓度作为最小抑菌浓度 (MIC)。

    将4株对数末期病原菌以1%接种量分别接种至LB液体培养基 [ 初始浓度为 (1~3) ×107 CFU·mL−1]。在各病原菌培养液中添加不同体积分数的酵素无菌上清液,使其终体积分数介于10%~17%,加入同等体积生理盐水作为对照组。4 ℃静置培养24 h,吸取10 μL处理液在LB固体平板上划线,培养24 h后观察是否有菌落出现,以没有菌落出现的最低酵素体积分数为最低杀菌浓度 (MBC)。

    使用嗜水气单胞菌245对斑马鱼进行浸泡攻毒,以自制酵素对斑马鱼进行攻毒保护。试验分为对照组、攻毒组与酵素处理组,每组3个平行,每个平行组有7尾体型相近的健康斑马鱼[ 体质量 (437±16) mg]。对照组使用无菌水养殖,攻毒组使用嗜水气单胞菌245 (1×109 CFU·mL−1) 浸泡;各组在处理12 h后,均将养殖用水更换为无菌水。酵素处理组在病原菌攻毒12 h后,使用体积分数为8%的酵素无菌上清液对斑马鱼药浴30 min,其余2组在无菌水中处理30 min。药浴结束后,各组均再次更换无菌水,禁食暂养。然后开始记录斑马鱼的存活情况,24 h后统计各组斑马鱼的总体死亡率。

    温度敏感性试验:将自制酵素无菌上清液分别在60、80、100、121 ℃下加热30 min,冷却至室温;pH敏感性试验:以1 mol·L−1 NaOH和1 mol·L−1 HCl 无菌溶液将自制酵素无菌上清液pH分别调至5.0、6.0、7.0、8.0;蛋白酶敏感性试验:将 2 g·L−1的胃蛋白酶溶液以1∶1比例加入自制酵素无菌上清液,37 ℃静置1 h;以未经任何处理的自制酵素无菌上清液作为对照,以96孔板生长抑制法检测上述处理对自制酵素抑菌活性的影响。

    将少量酵素分别在LB固体培养基、YPD固体培养基上均匀涂布,培养24 h后挑取菌落,采用划线法纯化。记录菌落形态并用光学显微镜观察菌体形态。提取菌种DNA,扩增并测定其ITS1-ITS4的DNA序列,构建菌株系统发育树。

    试验数据采用Excel 2010软件计算数据的标准偏差;用Origin 8.0软件绘图;通过SPSS 13.0软件进行单因素方差分析 (SNK,α=0.05或0.01)。每项实验重复3次,每次重复包含至少3个平行。

    自制酵素无菌上清液对4种病原菌的生长抑制作用见图1。低浓度酵素对菌体生长无明显的抑制作用,但随着酵素浓度提高,细菌培养液吸光值迅速降低,表明高浓度酵素可明显抑制菌群生长。不同指示菌开始出现生长抑制的酵素浓度不同,轮虫弧菌SP-1对酵素最敏感,哈维氏弧菌SP-1和坎氏弧菌SP-1其次,嗜水气单胞菌245最低。自制酵素无菌上清液对轮虫弧菌SP-1、坎氏弧菌SP-1、嗜水气单胞菌245及哈维氏弧菌SP-1的MIC分别是体积分数为6.2%、11.5%、 11% 和11%的酵素。

    图  1  环保酵素无菌上清液对水产病原菌的生长抑制作用
    Figure  1.  Inhibitory activity of sterile supernatant of garbage enzyme against aquatic pathogens

    自制酵素无菌上清液对轮虫弧菌SP-1、哈维氏弧菌SP-1、嗜水气单胞菌245及坎氏弧菌SP-1的致死作用见表1。自制酵素对嗜水气单胞菌245的致死作用较强,最小致死浓度是体积分数为12.0%的酵素。酵素对轮虫弧菌SP-1、坎氏弧菌SP-1和哈维氏弧菌SP-1的致死能力稍弱,最小致死浓度是体积分数为16.0%的酵素。

    表  1  自制环保酵素无菌上清液对水产病原菌的致死作用
    Table  1.  Lethal effects of sterile supernatant of home-made garbage enzyme against aquatic pathogens
    病原菌
    Pathogen
    酵素体积分数 Enzyme volume fraction/%
    17.016.516.015.515.014.514.013.513.012.512.011.010.0
    嗜水气单胞菌 245 A. hydrophila 245 + +
    轮虫弧菌 SP-1 V. rotifer SP-1 + + + + + + + + + +
    哈维氏弧菌 SP-1 V. harveyi SP-1 + + + + + + + + + +
    坎氏弧菌 SP-1 V. candida SP-1 + + + + + + + + + +
    注:+. 平板上有菌落生长;−. 无菌落 Note: +. Growth of bacterial colony on agar; −. No colony
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    空白对照组斑马鱼在试验期间死亡率为0。嗜水气单胞菌245对斑马鱼的致死率较高,试验鱼用1×109 CFU·mL−1的嗜水气单胞菌浸泡攻毒12 h,换水移除病原菌后24 h内全部死亡 (图2)。使用8%自制酵素药浴30 min能够显著降低嗜水气单胞菌攻毒斑马鱼的死亡率 [(9.5±6.49) %]。与攻毒组相比,酵素药浴使嗜水气单胞菌对斑马鱼的致死率显著降低了[(90.5±6.49)%, P<0.01]。

    图  2  自制环保酵素无菌上清液对嗜水气单胞菌攻毒斑马鱼的保护作用
    **. 组间数据有显著差异 (P<0.01)
    Figure  2.  Protective effect of sterile supernatant of home-made garbage enzyme on Danio rerio challenged with A. hydrophila
    **. Very significant difference between different columns (P<0.01).

    为分析自制酵素中的有效作用物质,本研究考察了酵素在不同pH、温度下,以及在蛋白酶处理后抑菌效果的变化 (图3)。在不同温度处理下 (图3-a),酵素对4种病原菌的抑制率无显著变化 (P>0.05),表明抑菌物质的热稳定性高。蛋白酶处理未影响酵素对4种病原菌的抑菌率 (图3-b),表明酵素中未含有抑制4种指示菌的蛋白质或肽类物质。将pH从酵素的原始pH (4.0) 调节至接近中性的过程中,抑菌率逐渐下降 (图3-c);当pH为8时,酵素对哈维氏弧菌SP-1和嗜水气单胞菌245完全失去抑菌活性,但对轮虫弧菌SP-1和坎氏弧菌SP-1仍有部分抑菌活性。结果表明自制酵素对水产病原菌的抑制作用存在低pH依赖性,抑菌活性成分主要为酸性物质或在酸性条件下发挥作用。

    图  3  不同温度 (a)、蛋白酶 (b) 和pH (c) 处理后对酵素的抑菌效果
    不同字母表示有显著性差异 (P<0.05)
    Figure  3.  Effect of heating (a), protease (b) and pH (c) on inhibitory activity of home-made garbage enzyme against aquatic pathogens
    Different letters indicate significant differences (P<0.05).

    为得到抑菌活性物质的产生菌,同时为环保酵素的标准化生产提供发酵菌株,从自制酵素中分离得到1株酵母菌,命名为bj001。菌株bj001在YPD培养基上呈乳白色,菌落大而厚、呈圆形、光滑湿润有黏性,易被挑起 (图4-a)。光学显微镜下观察bj001菌体形态为香肠状,宽度2~3 μm,长度5~10 μm (图4-b)。

    图  4  自制环保酵素发酵菌株bj001的菌落和菌体形态
    a. bj001菌落形态;b. bj001菌体在光学显微镜下的形态 (放大倍数10×100)
    Figure  4.  Colony and cell morphology of fermentation strain bj001 from home-made garbage enzyme
    a. Colony morphology of bj001; b. Morphological characteristics of bj001 cells under light optical microscope (Magnification 10×100)

    提取bj001酵母的基因组,扩增并测定ITS1~ITS4的DNA序列信息,与美国国家生物信息中心 (NCBI) 数据库中已发表的序列进行同源性比对,并依据ITS1~ITS4序列同源性建立系统发育树。结果表明bj001菌株与毕赤酵母属的库德毕赤酵母 (Pichia kudriavzevii) 菌株AUMC 10709、CY902、GY1同源性最高,与库德毕赤酵母菌株ATCC 6258同源性次之 (图5)。因此鉴定菌株bj001为库德毕赤酵母,并命名为库德毕赤酵母bj001。

    图  5  基于ITS序列构建的库德毕赤酵母bj001系统发育树
    Figure  5.  Phylogenetic tree of P. kurdii bj001 constructed based on ITS sequence

    本研究证明了自制酵素对多株水产革兰氏阴性病原菌有良好的抑制和杀灭作用,对坎氏弧菌SP-1、哈维氏弧菌SP-1、轮虫弧菌SP-1和嗜水气单胞菌245的MIC 分别是体积分数为11.5%、11%、6.2%和11%的酵素,MBC分别是体积分数为16%、16%、16%和12%的酵素。酵素的抑菌能力在其他研究中也有报道,如董银卯等[23]研究显示,2%的膏状酵素对大肠杆菌 (Escherichia coli)、铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa)、金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 的抑制率分别为19.21%、33.2%、38.01%。红茶菌酵素对金黄色葡萄球菌和大肠杆菌有较强的抑制能力[24]。青梅酵素对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和枯草芽孢杆菌 (Bacillus subtilis) 有良好的抑制效果[25]。Neupane和Khadka[26]利用番木瓜 (Carica papaya)、复合水果以及蔬菜制备的不同酵素,对金黄色葡萄球菌、芽孢杆菌、志贺氏菌 (Shigella Castellani)、铜绿假单胞菌、伤寒沙门氏菌 (Salmonella typhi) 以及大肠杆菌均有不同程度的抑制作用;这些均与本研究结果相似,证明酵素对致病菌的广泛抑制潜力。本研究仅考察了自制酵素对水产养殖中4种革兰氏阴性病原菌的抑制效果。由于各研究所用的指示菌不同,因此无法准确比较研究中酵素抑菌性能的高低。

    此外,本研究所采用的自制环保酵素还可作为药物通过短暂药浴来发挥抑菌功效,显著降低嗜水气单胞菌攻毒斑马鱼的致死率。嗜水气单胞菌是造成水产动物细菌性疾病的重要病原菌之一,毒性菌株在感染水产动物后往往发病快、死亡率高[27],且多数嗜水气单胞菌有很强的广谱耐药性[28],难以控制。本研究采用体积分数为8%自制环保酵素无菌上清液浸泡30 min,可以使嗜水气单胞菌对斑马鱼的致死率降低 (90.5±6.49)%。可见本研究的自制环保酵素有作为药物治疗水产动物嗜水气单胞菌病的潜力。

    本研究发现自制环保酵素的自然pH约4.0,且抑菌活性主要依赖于低pH,耐热性好且对蛋白酶不敏感,表明其主要抑菌活性成分是非蛋白类酸性物质。根据报道,可以推测自制环保酵素中的有效抑菌成分为混合的有机酸;有机酸对各类微生物具有广谱抑制能力[29]。据报道,以果蔬制备的酵素中含有丰富的有机酸,黑加仑酵素的总酸质量浓度可达26.5 g·L−1,主要为柠檬酸、苹果酸、草酸、奎宁酸和莽草酸[30]。蒋增良[31]测定的以树莓、蓝莓和葡萄为原料制备的天然酵素中有机酸包括酒石酸、莽草酸、乙酸和柠檬酸、丙酮酸等;张梦梅等[32]检测到市售酵素产品中的有机酸为草酸、苹果酸、乳酸和乙酸。这与本研究中自制环保酵素主要抑菌成分敏感性的研究结果相吻合。进一步精细分析环保酵素中有效抑菌成分的特性及各物质含量,有利于优化酵素的发酵工艺,并确定环保酵素在水产养殖中的应用方式。

    酵素的活性物质由发酵剂发酵蔬菜水果原料产生,因此活性成分的含量与发酵剂种类密切相关[24, 33-35]。果蔬酵素的发酵通常由多种微生物参与,是一个随时间不断变化的复杂多菌发酵过程。目前,酵素的制作过程主要依赖于发酵原料中的野生微生物群落和自然环境温度,发酵过程较为随机[36-37],已从微生物酵素中分离纯化得到的发酵菌主要为酵母菌和醋酸菌[38]。凌空等 [39]发现主要发酵菌株随着发酵时间而变化,发酵初期尚有乳酸菌参与,发酵到18个月时,果蔬酵素中的发酵菌株为毛榛毕赤酵母 (P. mandshurica)。蒋增良[31]发现发酵12个月的葡萄酵素中主要发酵菌株为季也蒙毕赤酵母 (P. guilliermondii)、德巴列汉逊酵母 (Debaryomyces hansenii) 和浅白隐球酵母 (Cryptococcus albidus)。杜丽平等[40]发现参与木瓜酵素发酵的优势微生物有植物乳杆菌 (Lactobacillus plantarum)、酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae)、季也蒙毕赤酵母等。魏东东等[41]在红树莓酵素中分离鉴定到5株主要发酵菌,包括酿酒酵母、库德毕赤酵母、盔形毕赤酵母 (P. manshurica) 及植物乳杆菌。本研究中,在自制环保酵素发酵后期 (12个月) 分离到一株优势发酵菌株,经ITS序列和系统发育树结果鉴定为库德毕赤酵母,证实了酵素发酵后期以酵母菌为优势菌。进一步评估该菌株的特性以及制备酵素的能力,可以为高稳定性和高活性酵素的制备提供理论依据。

    自制果蔬环保酵素表现出对水产革兰氏阴性病原微生物较强的体外抑制和致死作用,并能大幅降低由嗜水气单胞菌攻毒所造成的斑马鱼死亡。对自制环保酵素中抑菌活性物质的初步分析表明,其主要抑菌活性依赖于酸性物质或酸性环境,有较好的热稳定性,对蛋白酶不敏感。自制果蔬环保酵素发酵后期主要存活的活性发酵菌为库德毕赤酵母,该菌株有作为酵素发酵剂的潜力。

  • 图  1   β-琼胶酶基因系统进化树

    Figure  1.   Phylogenetic tree of β-agarase

    图  2   β-AGA酶二级结构预测

    Figure  2.   Secondary structure prediction of β-AGAase

    图  3   β-AGA酶三级结构预测

    Figure  3.   Tertiary structure prediction of β-AGAase

    图  4   β-AGA酶亲水性/疏水性预测

    Figure  4.   Hydropathicity/hydrophobicity prediction of β-AGAase

    图  5   β-AGA酶亚细胞定位预测

    Figure  5.   Subcellular localization prediction of β-AGAase

    图  6   β-AGA酶信号肽分析

    Figure  6.   Signal peptide prediction of β-AGAase

    图  7   β-AGA酶功能结构域预测

    Figure  7.   Conserved domain prediction of β-AGAase

    图  8   表达载体pET-20b(+)/β-aga的构建

    Figure  8.   Construction of expression plasmid pET-20b(+)/β-aga

    图  9   重组β-AGA酶的种子生长曲线 (a) 和接种时间对重组β-AGA酶发酵的影响 (b)

    Figure  9.   Seed growth curve of β-AGAase (a) and effect of inoculation time on fermentation (b) of recombinant β-AGAase

    图  10   发酵培养基类型对重组β-AGA酶发酵的影响

    Figure  10.   Effect of culture medium on fermentation of recombinant β-AGAase

    图  11   IPTG浓度和添加时间对重组β-AGA酶发酵的影响

    Figure  11.   Effects of IPTG concentration and additive time on fermentation of recombinant β-AGAase

    图  12   时间、温度和pH对重组β-AGA酶发酵的影响

    Figure  12.   Effects of time, temperature and initial pH on fermentation of recombinant β-AGAase

    图  13   碳源种类和添加量对重组β-AGA酶发酵的影响

    Figure  13.   Effect of carbon sources and their additive amount on fermentation of recombinant β-AGAase

    表  1   β-AGA酶的氨基酸组成

    Table  1   Amino acid composition of β-AGAase

    氨基酸
    Amino acid
    数量
    Amount
    占比
    Proportion/%
    丙氨酸 Alanine 82 8.6
    精氨酸 Arginine 27 2.8
    天冬酰胺 Aspartic acid 51 5.3
    天冬氨酸 Asparagine 81 8.5
    半胱氨酸 Cysteine 1 0.1
    谷氨酰胺 Glutamine 38 4.0
    谷氨酸 Glutamic acid 54 5.7
    甘氨酸 Glycine 73 7.6
    组氨酸 Histidine 15 1.6
    异亮氨酸 Isoleucine 40 4.2
    亮氨酸 Leucine 70 7.3
    赖氨酸 Lysine 57 6.0
    蛋氨酸 Methionine 20 2.1
    苯丙氨酸 Phenylalanine 48 5.0
    脯氨酸 Proline 40 4.2
    丝氨酸 Serine 74 7.7
    苏氨酸 Threonine 56 5.9
    色氨酸 Tryptophane 26 2.7
    酪氨酸 Tyrosine 39 4.1
    缬氨酸 Valine 63 6.6
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    表  2   有机氮源对重组β-AGA酶发酵的影响

    Table  2   Effect of organic nitrogen source on fermentation of recombinant β-AGAase U·mL−1

    氮源种类
    Nitrogen source
    添加量 Additive amount/(g·L−1)
    0612182430
    1.37±0.03a2.14±0.02b2.94±0.03c3.79±0.04d4.48±0.03e5.83±0.02f
    1.37±0.03a3.03±0.02b4.26±0.04c6.22±0.03d8.04±0.04e9.21±0.09f
    1.37±0.03a3.28±0.02b4.35±0.02c6.19±0.03d8.47±0.06e8.64±0.07e
    1.37±0.03a3.65±0.03b4.80±0.02c6.73±0.04d8.51±0.05e9.58±0.07f
    1.37±0.03a4.10±0.02b6.67±0.05c8.92±0.06d10.44±0.05e11.87±0.08f
    1.37±0.03a4.76±0.02b7.59±0.04c10.15±0.05d12.48±0.06e15.33±0.10f
    1.37±0.03a4.28±0.02b7.02±0.04c9.58±0.04d11.57±0.07e13.25±0.08f
    1.37±0.03a3.82±0.01b5.04±0.03c6.96±0.03d8.81±0.04e9.94±0.03f
    注:数值为 3 次平行实验的平均值,同一行中不同上标字母表示显著性差异(P<0.05)。
    ①. 分子级蛋白胨;②. 蛋白胨(鱼粉);③. 牛肉浸膏;④. 大豆蛋白胨;Ⅰ. 分子级酵母提取物;Ⅱ. 酵母提取物 H07014;Ⅲ. 酵母提取物 H07002;Ⅳ. 酵母浸膏。 Note: Each value represents the average value of three independent measurements, and those with different letters within the same row are significantly different (P<0.05).
    ①. Molecular level peptone; ②. Peptone (fish meal); ③. Beef extract; ④. Soya peptone; I. Molecular level yeast extract; II. Yeast extract H07014; III. Yeast extract H07002; IV. Yeast extract.
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    表  3   正交试验因素和水平表

    Table  3   Factors and levels in orthogonal array design

    水平
    Level
    A:碳源添加量
    Carbon source
    additive amount/
    (g·L−1)
    B:发酵温度
    Fermentation
    temperature/
    C:IPTG添加时间
    IPTG additive
    time/h
    15201.0
    26251.5
    37302.0
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    表  4   发酵条件优化正交试验结果

    Table  4   Orthogonal array design layout and experimental results

    试验号
    Test No.
    A:碳源
    添加量
    Carbon source
    additive amount/
    (g·L−1)
    B:发酵
    温度
    Fermentation
    temperature/
    C:IPTG
    添加时间
    IPTG additive
    time/h
    酶活
    Enzyme
    activity/
    (U·mL−1)
    11 (5)1 (20)1 (1.0)13.99±0.04e
    212 (25)2 (1.5)14.15±0.05f
    313 (30)3 (2.0)13.02±0.07b
    42 (6)1215.63±0.06g
    522316.72±0.06h
    623113.39±0.04c
    73 (7)1313.64±0.05d
    832114.18±0.03f
    933212.67±0.02a
    K113.7214.4213.85
    K215.2515.0214.15
    K313.5013.0314.46
    R1.751.990.61
    注:同一列中不同上标字母表示显著性差异 (P<0.05)。 Note: Different superscript letters within the same column indicate significant difference (P<0.05).
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-11-02
  • 修回日期:  2021-12-26
  • 录用日期:  2022-01-09
  • 网络出版日期:  2022-01-26
  • 刊出日期:  2022-04-04

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