罗非鱼无乳链球菌ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除菌株的构建及其特性分析

马艳平, 郝乐, 冯国清, 梁志凌, 马江耀, 柯浩, 刘振兴

马艳平, 郝乐, 冯国清, 梁志凌, 马江耀, 柯浩, 刘振兴. 罗非鱼无乳链球菌ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除菌株的构建及其特性分析[J]. 南方水产科学, 2022, 18(4): 76-86. DOI: 10.12131/20210246
引用本文: 马艳平, 郝乐, 冯国清, 梁志凌, 马江耀, 柯浩, 刘振兴. 罗非鱼无乳链球菌ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除菌株的构建及其特性分析[J]. 南方水产科学, 2022, 18(4): 76-86. DOI: 10.12131/20210246
MA Yanping, HAO Le, FENG Guoqing, LIANG Zhiling, MA Jiangyao, KE Hao, LIU Zhenxing. Construction and characterization research of essA, essB and essC-deleted mutants in Streptococcus agalactiae from tilapia[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(4): 76-86. DOI: 10.12131/20210246
Citation: MA Yanping, HAO Le, FENG Guoqing, LIANG Zhiling, MA Jiangyao, KE Hao, LIU Zhenxing. Construction and characterization research of essA, essB and essC-deleted mutants in Streptococcus agalactiae from tilapia[J]. South China Fisheries Science, 2022, 18(4): 76-86. DOI: 10.12131/20210246

罗非鱼无乳链球菌ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除菌株的构建及其特性分析

基金项目: 广东省自然科学基金项目 (2021A1515010498);广东省农业科学院水产研究中心课题 (XT202232);佛山市财政专项资金—2021年度共建广东农业科技示范市项目
详细信息
    作者简介:

    马艳平  (1984—),女,副研究员,博士,从事水产病害与防控研究。 E-mail: mayanping@gdaas.cn

    通讯作者:

    刘振兴 (1981—),男,副研究员,博士,从事水产病害与防控研究。 E-mail: liuzhenxing@gdaas.cn

  • 中图分类号: S 943.116.42

Construction and characterization research of essA, essB and essC-deleted mutants in Streptococcus agalactiae from tilapia

  • 摘要: VII型分泌系统存在于无乳链球菌 (Streptococcus agalactiae) 中,其组成膜蛋白对底物蛋白的分泌转运至关重要。为此利用热敏型自杀质粒,构建了含氯霉素筛选标签的膜蛋白重组敲除载体pSET4s-ΔessA、pSET4s-ΔessB、pSET4s-ΔessC,经同源重组后,利用PCR技术筛选到了其缺失突变株-无乳链球菌ΔessA、ΔessB、ΔessC。通过菌株生长曲线分析,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株均较野生株 (WT) 生长过程变慢,其中ΔessA、ΔessB敲除株在生长早期有显著性差异 (P<0.01)。对ESAT6蛋白分泌影响分析显示,与WT株相比,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株ESAT6的表达量均显著下调 (P<0.01)。结果显示,ΔessA、ΔessB、ΔessC敲除株均较WT株毒力显著降低 (P<0.01)。研究表明,essA、essB、essC为无乳链球菌VII型分泌系统重要的膜蛋白,其基因缺失造成了分泌蛋白ESAT6 mRNA表达水平下降,影响了菌株毒力。
    Abstract: The membrane proteins are critical to substrate protein secretion in VII secretion system existing in Streptococcus agalactiae. In this study, we constructed the membrane proteins knockout vectors with chloramphenicol tag including pSET4s-ΔessA, pSET4s-ΔessB and pSET4s-ΔessC, and after the homologous recombination, we screened the mutant S. agalactiae ΔessA, ΔessB and ΔessC via PCR assays. Based on the growth curve analysis, S. agalactiae ΔessA, ΔessB and ΔessC strains showed significantly slower growth process than the wild type strain (WT). ΔessA and ΔessB strains had significant difference in early stage of growth compared with WT strain (P<0.01). According to the secretion product analysis of ESAT6 protein, S. agalactiae ΔessA, ΔessB and ΔessC strains showed significantly lower ESAT6 product than WT (P<0.01). According to challenge test analysis, the deletion of essA, essB or essC gene significantly reduced virulence of S. agalactiae ΔessA, ΔessB and ΔessC compared with WT (P<0.01). The results suggest that essA, essB and essC proteins are important component membrane proteins of VII secretion system in S. agalactiae, and these genes deletions cause ESAT6 mRNA expression and virulence decline.
  • 鱼类的游泳运动是维持其捕食、逃避敌害、洄游和生殖等生存活动的根本[1]。其中,野生鱼类在捕食、逃逸、穿越急流、洄游等,以及在养殖或增殖放流的捕捞和运输等过程中,通常做爆发性运动,这会导致乳酸(LD)的大量累积和糖原的迅速消耗,属于无氧代谢运动,也称力竭运动或力竭性运动,即一种由白肌糖酵解代谢提供能量,以力竭状态作为运动终点的高强度的游泳运动方式[2-4]。相较于哺乳动物,鱼类力竭运动后的代谢紊乱更大,恢复需要的时间更长,因此以鱼类作为模型进行探讨有利于其恢复过程及其调节机制[5]的研究。李黎等[6]对鲶(Silurus asotus)幼鱼力竭运动后的肌肉、血液和肝脏3种组织中乳酸、糖原和葡萄糖的浓度水平进行研究发现,鲶幼鱼力竭运动后肌乳酸和血乳酸浓度均快速上升且即刻达到峰值,而肝乳酸的峰值却出现在运动后1 h。朱晏苹等[7]发现瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli) 力竭运动后肌组织的乳酸迅速上升同时血糖快速下降。彭姜岚等[8]将鲶放入环形水道内,用手不断追逐使其被迫做持续5 min的力竭运动,力竭运动后其耗氧率(VO2)峰值在第2分钟出现,随后逐渐恢复到稳定状态,表明鱼类体质量的增加可能会使有氧代谢适应性的变化程度降低,而无氧代谢能力却可能有较大提高。He等[9]发现鲤(Cyprinus carpio) 在力竭运动训练后,肌肉中乳酸清除率提高但肝中糖原极度降低。Karlsson-Drangsholt等[10]对野生黑线鳕(Melanogrammus aeglefinus)进行力竭性游泳训练发现,训练后其血液中血糖和乳酸水平均高于对照组,直至第6小时仍未能恢复。鱼类力竭运动后其恢复速度和恢复程度与其成活率密切相关,然而关于黑鲷(Sparus inacrocephalus)力竭运动后代谢能力的恢复情况尚未见报道。

    黑鲷隶属于鲈形目、鲷科、鲷属,因其具有广温性、广盐性、杂食性、抗病能力强、生长快且不作长距离洄游等诸多适合养殖的生物学特性,不但是沿海增殖放流的优良品种之一[11],也是继罗非鱼(Oreochromis spp.)之后联合国粮农组织(FAO)向全世界推广的优良品种之一[12]。本研究以黑鲷幼鱼为实验对象,研究其力竭运动后在机能恢复期间相关代谢能力的变化,以期为黑鲷养殖生产及增殖放流提供参考。

    实验黑鲷幼鱼购于广东大亚湾南澳养殖场,选取128尾健康活泼的幼鱼,全长为8.9~9.9 cm [平均为(9.5±0.3) cm],体质量为15.8~26.3 g [平均为(21.7±2.8) g]。暂养于可控温循环水池中7 d,暂养水体为过滤海水 [(26.7±0.5) ℃,盐度27,pH 8.04,溶氧(8.8±0.6) mg·L–1]。每天8:00投喂一次饵料(金鲳料1号),每天换水50%。力竭运动实验前禁食24 h,整个实验过程中禁食。力竭运动实验装置为自行设计的环形水道(外径为1 004 mm,内置隔离装置直径为604 mm,内置隔离装置高为395 mm,容量为500 L)。

    实验黑鲷幼鱼禁食24 h后,随机从暂养池选取16尾黑鲷鱼苗为对照组,分2个平行。随机从暂养池选取112尾为处理组,分7组,每组16尾。将处理组分7批放入环形水道,每批8尾,实验水体流速为0.47 m·s–1,用手不断逆流追赶惊吓实验鱼,使鱼做持续力竭运动,观察到其尾部摆动频率明显变慢,机体失去平衡,尾部肌肉僵硬,直至再追逐时不再有明显反应为止。然后立即取出16尾放在冰盘中,用5#无菌注射器在尾静脉取血,此为力竭运动后第0小时的样品。血样装入无菌的1.5 mL离心管,室温静置1.5 h,置于4 ℃冷藏8 h后,在4 ℃下用高速台式冷冻离心机(TGL-20bR) 3 500 r·min–1离心10 min,所得血清置于– 80 ℃超低温冰箱冻存待测。其他样品的取样方式为:将其他力竭运动后的处理组放入暂养池网箱中 [(26.7±0.5) ℃,盐度27,pH 8.04,溶氧(8.8±0.6) mg·L–1)],分别在第0.5、第1、第2、第4、第8和第16 小时取样。对照组为随机从暂养池中选取未经力竭运动实验的黑鲷鱼苗16尾,用5#无菌注射器在尾静脉取血。取血时,用冰水混合物浸后的毛巾轻轻辅助以减少样品鱼的应激反应。取血过程不超过1 min。

    血清中LD水平、血糖(GLU)水平、谷草转氨酶(AST)活性、谷丙转氨酶(ALT)活性、琥珀脱氢酶(SDH)活性、乳酸脱氢酶(LDH)活性、丙酮酸激酶(PK)活性和己糖激酶(HK)活性,均采用南京建成生物工程试剂盒测定。

    实验数据经Excel 2010处理后,以急性力竭运动后恢复时间,用SPSS 19.0软件进行单因素方差分析(One-Way ANOVA),如果分析结果出现组间极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)差异,则用邓肯(Duncan)分析进行组间差异显著性检验。数据以“平均值±标准差($ \overline X \pm {\rm SD}$)”表示。

    单因素方差分析显示,黑鲷幼鱼力竭运动后不同恢复时间对血清中LD和GLU浓度,以及AST、ALT、SDH、LDH、PK和HK活性均有极显著影响(P<0.01,表1)。

    表  1  黑鲷幼鱼力竭运动后不同恢复时间下血清中代谢指标单因素分析结果
    Table  1.  Analysis of metabolic indices in serum after exhaustive exercise by One-Way ANOVA
    因变量
    dependent variable
    自由度
    df
    均方
    mean square
    FP
    LD浓度 LD concentration74.12920.8020.000
    GLU浓度 GLU concentration73.84021.4650.000
    AST活性 AST activity737.96411.2800.000
    ALT活性 ALT activity72.39333.6100.000
    LDH活性 LDH activity7899 051.171143.6570.000
    SDH活性 SDH activity7177.81035.2680.000
    PK活性 PK activity786.6726.4040.001
    HK活性 HK activity711 567.01616.5750.000
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    黑鲷幼鱼力竭运动后第0小时,处理组血清中LD浓度显著高于对照组(P<0.05);力竭运动后的第0.5小时升至峰值 [(5.90±0.66) mmol·L–1] (P<0.05),而后缓缓下降;力竭运动后第4小时与对照组基本持平(P>0.05),且第8和第16小时的LD浓度水平无显著差异(P>0.05,图1-A)。

    图  1  黑鲷幼鱼力竭运动后血清中代谢相关指标的变化
    不同小写字母表示不同恢复时间指标有显著性差异(P<0.05)
    Figure  1.  Indices of metabolic enzymes activities in serum after exhaustive exercise
    Different lowercase letters indicate significant difference in different recovery time after exhaustive exercise (P<0.05).

    黑鲷幼鱼力竭运动后第0小时,血清中GLU浓度略高于对照组(P<0.05);力竭运动后的第0.5、第1和第2小时处理组血清中GLU呈规律性降低;力竭运动后的第8小时降至最低 [(2.41±0.42) mmol·L–1] (P<0.05),而在第16小时稍有恢复趋势(P>0.05,图1-B)。

    黑鲷幼鱼力竭运动后第0小时,处理组血清中LDH活性迅速升高(P<0.05);而在第0.5小时快速下降(P<0.05);在力竭运动后的第1、第2、第4、第8和第16 小时呈缓慢下降趋势,其中在第16小时降至最低 [(1 325.72±42.67) U·L–1] (P<0.05,图1-C)。

    黑鲷幼鱼力竭运动后,处理组的不同恢复时间血清中SDH活性先缓慢上升后恢复至对照组水平。首先,力竭运动后第0小时,处理组血清中SDH活性明显增强(P<0.05);在第0.5小时达最高 [(126.67±1.54)U·mL–1];随后的第1、第2、第4和第8小时逐渐下降;在力竭运动后的第16小时恢复至对照组水平(P>0.05,图1-D)。

    黑鲷幼鱼力竭运动后,处理组不同恢复时间血清中AST活性呈小幅度波动趋势。其中,力竭运动后第0小时,处理组血清中AST活性明显高于对照组(P<0.05);力竭运动后的第0.5、第1、第2、第4和第8小时逐渐降低;而在力竭运动后的第16小时出现回升趋势(图1-E)。

    黑鲷幼鱼力竭运动后,处理组不同恢复时间血清中ALT活性先升后降,整体维持较低水平。力竭运动后第0小时,处理组血清中ALT活性明显高于对照组(P<0.05);力竭运动后的第0.5小时迅速下降(P<0.05);而力竭运动后的第1、第2、第4、第8和第16小时未有显著变化且维持较低水平(P>0.05,图1-F)。

    整体上看,黑鲷幼鱼力竭运动后,处理组不同恢复时间血清中PK活性呈小幅度波动趋势。力竭运动后第0小时,处理组血清中PK活性明显高于对照组(P<0.05);而在力竭运动的第0.5小时迅速降低且显著低于对照组(P<0.05);在力竭运动后的第1、第2、第4和第8小时保持了较低水平(P>0.05);至第16小时出现恢复趋势,但略低于对照组(P<0.05,图1-G)。

    黑鲷幼鱼力竭运动后,处理组不同恢复时间血清中HK活性先迅速升高后缓缓下降,且在实验时间内恢复至对照组水平。力竭运动后第0小时,处理组血清中HK活性迅速升高(P<0.05);随后在第0.5、第1、第2和第4小时有微小波动;而在力竭运动后第8小时已恢复至对照组水平(P>0.05),且在第16 小时也与对照组水平相近(P>0.05,图1-H)。

    鱼类对组织缺氧有一种普遍的适应机制,即以无氧代谢的方式代替有氧代谢产能。在此过程中由于没有氧气作为最终电子受体,体内葡萄糖在代谢过程中产生的中间产物乳酸会被累积[13]。研究证明,鱼类乳酸的产生和清除主要在肌组织[14]。诸多研究将力竭运动训练作为揭示机体无氧代谢机制的重要实验方法,而乳酸的相关参数则是反映机体无氧代谢能力的一个重要指标[15]。另外,Moraes等[16]根据力竭运动后血乳酸是否上升将鱼类划分为“乳酸非释放(lactate non-releasers)”和“乳酸释放(lactate releasers)”2种类型。许多鱼类力竭运动后乳酸浓度立刻升至峰值,其峰值水平是衡量该鱼种无氧运动能力的重要指标[7]。本研究中,黑鲷幼鱼力竭运动后血乳酸浓度迅速上升,力竭运动后的第0.5小时升至峰值 [(5.90±0.66) mmol·L–1],推测是因为血乳酸相对肌乳酸有一定滞后性。乳酸透过肌纤维细胞膜进入血液,稀释了局部肌乳酸浓度,使黑鲷避免了高浓度乳酸可能造成的伤害,为肝脏等其他组织清除乳酸提供了可能,这表明黑鲷属于 “乳酸释放”型鱼类,该“乳酸泄漏”现象有利于提高黑鲷的无氧代谢能力和生存适合度[6,16]。此外,本研究中黑鲷血清中乳酸峰值水平高于鲶幼鱼,力竭运动后第4小时,黑鲷幼鱼血清中的乳酸浓度基本恢复至对照组水平,这与鲶相同[6],说明黑鲷在首次力竭的第4小时后,可再次做力竭运动。但鲣(Katsuwonus pelamis)的血乳酸清除所需时间更短,这是由于黑鲷和鲶都喜栖于沙泥底部和礁石,黑鲷是不做长距离洄游的沿岸性鱼类,而鲣是有季节洄游的大洋性鱼类,为捕食或逃避敌害需经常做无氧运动且无氧代谢速度快[17]

    Franklin等[13]认为,鱼类肌乳酸的清除需要通过3种途径:合成肌糖原、合成葡萄糖或被彻底氧化并提供能量。而血乳酸代谢则是通过氧化,如在心脏和肝等场所氧化供能[26-27]。已有研究显示,肌乳酸下降的同时糖原和葡萄糖浓度会有不同程度的上升,因此乳酸清除的主要途径是合成糖原[18],但血乳酸会被肌肉重新摄取,主要被用于糖原再合成过程中的氧化供能,但再次摄取的血乳酸和肌乳酸的代谢在肌肉中有分隔现象[1]。本研究中,黑鲷幼鱼血清中血糖浓度在力竭运动后第0小时略有上升,其后一直低于对照组水平,推测黑鲷幼鱼力竭运动后血清中的乳酸清除主要是被其他有氧代谢组织(如心脏、红肌)氧化[5]。同时,黑鲷幼鱼在力竭运动后第4小时血糖浓度降至最低,至第16小时血清中血糖维持较低水平,可能是因为黑鲷喜躲在水底礁石后方伏击捕食,这对能量的快速储存需要较少。血糖水平低下可导致中枢供能不足,并引发中枢疲劳,因此推测黑鲷幼鱼力竭运动后第4至第16小时,可能出现严重的代谢疲劳现象[19],且未能在本实验恢复期恢复,说明虽然黑鲷在力竭运动后第4小时可再次做力竭运动,但其无氧运动能力会降低,力竭状态出现更快。

    研究表明,力竭运动训练还会对鱼体有氧或无氧代谢酶活性产生显著影响,如无氧运动训练后虹鳟(Oncorhynchus mykiss)肌肉糖酵解酶系中PK活性增加[20],斑马鱼(Barchydanio rerio var) LDH活性显著增强,乌鳢(Channa argus)红肌中SDH水平显著增加[17]等。本研究中,黑鲷幼鱼力竭运动后第0小时,血清中LDH、HK、PK和SDH活性也显著升高。HK和PK均为无氧糖酵解过程中的限速酶和调控酶,而LDH是衡量无氧酵解能力的重要指标,是无氧代谢终产物乳酸的直接催化酶。LDH作为无氧代谢的标志酶,可使PK和LD之间相互转化,其活性高低在一定程度上反映了无氧代谢能力的高低[21]。SDH则是有氧代谢中唯一嵌在线粒体内膜上的酶,催化琥珀酸氧化生成延胡索酸释放 ATP[22]。本研究结果显示,黑鲷幼鱼力竭运动后第0小时,血清中HK、PK和LDH活性显著升高,说明其限速酶在糖酵解过程中有效地调控了糖酵解速度,使其产生了适应性变化。力竭运动训练促使糖酵解能力加强,同时使得细胞内氧分压降低,LDH合成加快,活力增强[23],而且有研究表明,爆发式游泳后鳙(Aristichthys nobilis)的有氧代谢能力短期内会降低,说明该阶段黑鲷的代谢方式为无氧代谢[24]。本研究结果表明,在第0小时往后的恢复时间中,LDH活性不断下降且低于对照组水平,而SDH活性变化幅度较小且略高于对照组水平,说明黑鲷幼鱼在力竭运动后的第0.5至第16小时的有氧代谢能力得到了提高。表明低氧条件下,有氧代谢受到抑制而无氧代谢增强;恢复期后期有氧代谢恢复,无氧代谢受到抑制[25],推测这也与黑鲷生活习性相关,力竭运动训练后有洄游习性的虹鳟,无氧代谢能力显著升高,而黑鲷和瓦氏黄颡鱼(Pseudobagrus vachellii)[25]、南方鲶(Peltebagrus vachelli)[26]等喜栖息于沙泥无需洄游鱼类的有氧代谢能力升高,无氧代谢无显著性变化。

    AST和ALT是氨基酸代谢中的2个关键酶,其活性强弱不仅反映了氨基酸代谢程度的强弱,也可显示肝功能是否正常[27-28]。转氨酶(AST和ALT)主要作用是催化氨基酸生成酮酸,进而保持机体稳态[29]。正常情况下,ALT和AST主要存在于细胞内,血清中极少;一般情况下,各组织器官中以心肌细胞和肝细胞内的活性最高,但当这些组织细胞受损时,便可能有大量的AST和ALT从细胞内进入血液,使血清中的2种转氨酶活性升高[30]。因此,血清中转氨酶活性的变化,是目前判断肝脏等组织器官功能状况的最具特异性和应用最广泛的指标[31]。张全江等[32]研究发现,小鼠(Mus musculus)在力竭运动后其血清中的AST和ALT活性明显升高;王转丁等[33]发现,小鼠进行不同强度游泳后血清中AST和ALT活性也明显上升。本研究结果与以上实验结果一致,黑鲷幼鱼很快恢复且至实验时间结束AST和ALT活性仍保持低于对照组水平,说明其力竭运动后心肌和肝脏细胞受到一定的损伤,但机体代谢能够及时有效地恢复。

    黑鲷幼鱼力竭运动后,不同恢复时间血清中相关代谢因子均存在极显著差异。黑鲷幼鱼力竭运动后处于应激反应中,其无氧和有氧代谢能力得以短时增强。在力竭运动后的第4小时,黑鲷鱼苗已出现代谢疲劳现象,至力竭运动后的第16小时仍未能完全恢复;从乳酸水平上看,力竭运动后第4小时后可再次进行力竭运动,但血糖检测结果显示,再次进行力竭运动的耐力下降;从氨基酸代谢水平上看,黑鲷幼鱼力竭运动后心肌和肝脏有一定损伤,但能够迅速恢复。综上,在实际的黑鲷养殖生产或增殖放流过程中,应尽量避免或减少短时间内的多次捕捞、追赶等活动,以保障黑鲷健康,获得更好的放养成活率。

  • 图  1   essAessBessC同源臂融合PCR结果

    Figure  1.   Overlap extension PCR results of essA, essB, essC homologous arms

    图  2   敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC DNA水平PCR鉴定结果

    Figure  2.   PCR identification results of ΔessA, ΔessB, ΔessC knockout strains at DNA level

    图  3   敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC RNA水平PCR鉴定结果

    Figure  3.   PCR identification of ΔessA, ΔessB and ΔessC knockout strains at RNA level

    图  4   敲除菌株ΔessA、ΔessB、ΔessC 生长曲线测定结果

    Figure  4.   Growth curve of ΔessA, ΔessB and ΔessC knockout strains

    图  5   ESAT6 qPCR检测方法的建立

    注:a. 扩增效率分析结果;b. 熔解曲线分析结果; c. 扩增产物琼脂糖凝胶检测结果。

    Figure  5.   qPCR detection method of ESAT6 gene

    Note: a. Amplification efficiency analysis result; b. Melt curve analysis result; c. Amplification product detection result based on agarose gel.

    图  6   敲除株ΔessA、ΔessB、ΔessC 与野生株对底物蛋白ESAT6表达量的影响结果

    注:**. 差异显著 (P<0.01)。

    Figure  6.   Effect of substrate protein ESAT6 expression by knockout strains ΔessA, ΔessB, ΔessC and WT strain

    Note: **. Significant difference (P<0.01).

    图  7   敲除菌株ΔessA、ΔessB、ΔessC 与野生株毒力试验结果

    Figure  7.   Virulence test of ΔessA, ΔessB, ΔessC knockout strains and WT strain

    图  8   攻毒死亡鱼解剖及其菌株鉴定结果

    注:a. 攻毒死亡鱼解剖症状;b. 攻毒分离菌株革兰氏染色结果;c. 攻毒分离菌株 PCR 鉴定结果。

    Figure  8.   Anatomical symptom result and identification of strains of infected dead tilapia

    Note: a. Anatomical symptom result of infected dead tilapia; b. Gram staining result of isolated strain after infection; c. PCR identification of isolated strain after infection.

    表  1   试验用引物

    Table  1   Primers in this study

    引物名称 Primer name引物序列 Primer sequence 5'−3'
    重组质粒构建用引物 Primers for recombinant plasmid construction
     essAup-FBamHI5'-GCGGATCCGCCGTAGGCACAGTAGCGACT-3' BamHI
     essAup-R5'-GAGTGAGACTTTAGATTGACGG-3'
     essAdown-F5'-ACGTTGAGCCTCGGAACCCATCGAATTAGAATACACATATTAACATTACT-3'
     essAdown-REcoRI5'-GCGAATTCGATAGAGCGTGCGCTTCTGTCTG-3' EcoRI
     essBup-FBamHI5'-GCGGATCCGGACCAGATTTTTGGCAGTTATC-3' BamHI
     essBup-R5'-CAGCCTGAATAGTTTCTGCATGAT-3'
     essBdown-F5'-GACGTTGAGCCTCGGAACCCATCGAATTATAAAGTTGATTATAATCAAGTGA-3'
     essBdown-REcoRI5'-GCGAATTCAGAAGATGTACTTGTTGTAGTAC-3' EcoRI
     essCup-FSalI5'-GCGTCGACAAACGGCAAGTCGCCAATACCAG-3' SalI
     essCup-R5'-TGCTGACTCCAATCATCACTAG-3'
     essCdown-F5'-GACGTTGAGCCTCGGAACCCATCGAATTACAGGAAATGGCTGATACTTATCAC-3'
     essCdown-REcoRI5'-GCGAATTCTTAACTTTTCATCAGTTACAAT-3' EcoRI
     Cat(essA)-F5'-ATGAAAACCGTCAATCTAAAGTCTCACTCCACCGAACTAGAGCTTGATG-3'
     Cat(essB)-F5'-TATCATGCAGAAACTATTCAGGCTGCACCGAACTAGAGCTTGATGAAAA-3'
     Cat(essC)-F5'-CCTCCTCTAGTGATGATTGGAGTCAGCACACCGAACTAGAGCTTGATGAA-3'
     Cat-R5'-TAATTCGATGGGTTCCGAGGCTC-3'
    基因缺失突变株筛选所用引物 Primers for gene deletion mutant strains screening
     essA验证-F5'-GCCGTAGGCACAGTAGCGACTG-3'
     essA验证-R5'-ACATTCAAGGCTAATCGTAA-3'
     essB验证-F5'-TGGAAACAGATTCGTTTGTA-3'
     essB验证-R5'-TACCTACTTTTAGTTTTAG-3'
     essC验证-F5'-CGTCCTCGTGGTATCTATATC-3'
     essC验证-R5'-CAATATCATCCTGACCACGTAAG-3'
     essA-F5'-ATGAAGTTGAAACGATTTTTAG-3'
     essA-R5'-TTAATATGTGTATTCATCCT-3'
     essB-F5'-TGGAAACAGATTCGTTTGTA-3'
     essB-R5'-TACCTACTTTTAGTTTTAGA-3'
     essC-F5'-TCGTGGTATCTATATCATTGCAAC-3'
     essC-R5'-GATAAACAATATCATCCTGACCAC-3'
    Real-time PCR所用引物 Primers for real-time PCR
     ESAT6-F5'-ATACTGCTGGTTCTCAACAA-3'
     ESAT6-R5'-GTCAATAACTGCTTGCTCTT-3'
     16S-rRNA-F5'-CGACGATACATAGCCGACC-3'
     16S-rRNA-R5'-CCGTCACTTGGTAGATTTTCC-3'
    注:下划线为限制性内切酶位点。 Note: The underlined are restriction endonuclease sites.
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-08-25
  • 修回日期:  2021-12-13
  • 录用日期:  2021-12-20
  • 网络出版日期:  2022-02-05
  • 刊出日期:  2022-08-04

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