大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析

孙成飞, 谢汶峰, 胡婕, 董浚键, 田园园, 吴灶和, 叶星

孙成飞, 谢汶峰, 胡婕, 董浚键, 田园园, 吴灶和, 叶星. 大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 南方水产科学, 2019, 15(2): 64-71. DOI: 10.12131/20180203
引用本文: 孙成飞, 谢汶峰, 胡婕, 董浚键, 田园园, 吴灶和, 叶星. 大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 南方水产科学, 2019, 15(2): 64-71. DOI: 10.12131/20180203
SUN Chengfei, XIE Wenfeng, HU Jie, DONG Junjian, TIAN Yuanyuan, WU Zhaohe, YE Xing. Genetic diversity analysis of three cultured populations of Micropterus salmoides[J]. South China Fisheries Science, 2019, 15(2): 64-71. DOI: 10.12131/20180203
Citation: SUN Chengfei, XIE Wenfeng, HU Jie, DONG Junjian, TIAN Yuanyuan, WU Zhaohe, YE Xing. Genetic diversity analysis of three cultured populations of Micropterus salmoides[J]. South China Fisheries Science, 2019, 15(2): 64-71. DOI: 10.12131/20180203

大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析

基金项目: 现代农业产业技术体系建设专项资金 (CARS-46);中国水产科学研究院基本科研业务费项目 (2017HY-XKQ0208);广东省自然科学基金-博士启动基金 (2015A030310154)
详细信息
    作者简介:

    孙成飞 (1985—),男,博士,助理研究员,从事水产遗传育种研究。E-mail: scfsec@163.com

    通讯作者:

    叶 星 (1962—),女,博士,研究员,从事水产遗传育种研究。E-mail: gzyexing@163.com

  • 中图分类号: S 917.4

Genetic diversity analysis of three cultured populations of Micropterus salmoides

  • 摘要:

    该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈 (Micropterus salmoides) 主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性。结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性。3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度 (He) 分别为0.312 5、0.360 6和0.328 4。群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83%是由群体内不同个体间的差异造成的。群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近。遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群。研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题。

    Abstract:

    We selected 12 microsatellite primers with specificity and polymorphism from 51 microsatellite primers from GenBank by using an automatic nucleic acid protein analysis system. Fluorescent-labeled primers were synthesized to amplify the three cultured populations of M. salmoides from the main culture area of Guangdong. The results show that among the 12 microsatellite loci, three of them were highly polymorphic, four were moderately polymorphic, and the remaining five showed low polymorphic. The genetic diversity of these three populations was low, and the expected heterozygosity (He) was 0.312 5, 0.360 6 and 0.328 4, respectively. Genetic differentiation index and AMOVA analysis among populations show that the genetic differentiation among populations was low, and 85.83% of genetic variation came from difference among individuals within populations. Genetic distance analysis shows that the genetic distance was small and genetic similarity was rather high among the three cultured populations. Genetic structure analysis shows that the three cultured populations originated from the same subgroup. The results suggest that the genetic diversity of the cultured population of M. salmoides in China has decreased significantly at present. Therefore, great attention should be paid to improving and maintaining genetic diversity of the population during the breeding process.

  • 鲤疱疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus 3,CyHV-3)也称为锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus,KHV)[1],引起的锦鲤疱疹病毒病(KHVD)可以造成锦鲤(Cyprinus carpio haematopterus)、鲤(C. carpio) 80%以上的死亡率[2-5]。自20世纪90年代末出现以来,这种具有高度传染性的病原已给世界范围内的鲤鱼养殖业和锦鲤养殖业造成了严重的经济损失[6]

    由于KHVD的严重危害,灭活疫苗[7]、弱毒疫苗[8-10]等研究相继被报道。DNA疫苗利用重组DNA技术将保护性抗原基因插入真核表达载体,接种于体内进行抗原表达[11]。DNA疫苗成本低、运输方便,不仅可以快速响应新病原以及变异病原[12],还可以诱导体液免疫与细胞免疫,被称为第三代疫苗[13]。目前已经有2种鱼用DNA疫苗获准上市:传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的DNA疫苗,该疫苗已经于2005年在加拿大获准上市[14-15];鲑胰腺病病毒(SPDV)的DNA疫苗也在欧盟和挪威获准上市[16]。CyHV-3 DNA疫苗的研究也取得了一些进展,肌内注射重组质粒pIRES-ORF25、pIRES-ORF81均可以诱导锦鲤、鲤产生高水平的抗体并具有良好的免疫保护效果[17-18];后续研究表明,CyHV-3 ORF25构建的DNA疫苗保护效果受到免疫途径和攻毒方式的影响[19]

    CyHV-3具有一个大小约295 kb的双链DNA基因组,这个基因组有156个不同的蛋白编码开放阅读框(ORF)[20-21]。囊膜蛋白是DNA疫苗设计的重要靶标,目前能够确定CyHV-3编码14个囊膜蛋白[21-23],除ORF25、ORF81以外,其他囊膜蛋白的保护效果也值得关注。CyHV-3 ORF65基因是CyHV-3的主要囊膜蛋白基因[21]。生物信息分析显示,该蛋白具有良好的免疫原性[24]。本研究以ORF65插入pEGFP-N1构建的重组质粒作为DNA疫苗,分析其体内外表达及诱导产生特异性抗体的情况,为开发新型CyHV-3 DNA疫苗提供实验依据。

    pEGFP-ORF65/Top10、pET32a-modORF65/BL21重组质粒克隆、表达菌株由本实验室前期构建、保存[24-25]。pEGFP-N1载体由本实验室前期保存。建鲤脑细胞系(CCB-J)由本实验室建立(待发表)。鼠抗鲤多克隆抗体由本实验室前期制备[25]。Lipofectamine 3000试剂盒购自Invitrogen公司。CyHV-3毒株由本实验室分离。质粒大量制备提取试剂盒购自百泰克公司。无内毒素质粒小提中量试剂盒、组织DNA提取试剂盒均购自天根公司。BCA蛋白定量测定试剂盒购自鼎国昌盛公司。His Bind纯化试剂为Novagen公司产品。其他试剂均为国产分析纯。10 g左右的健康建鲤(C. carpio var. Jian)购自成都通威水产苗种有限责任公司。

    根据无内毒素质粒小提试剂盒的说明书分别提取质粒pEGFP-ORF65、pEGFP-N1。将CCB-J细胞[(3~5)×105 mL−1]接种于24孔板,细胞长至80%~90%融合度时,按照lip3000说明书将提取的质粒转染至CCB-J细胞,同时设置未转染质粒的CCB-J对照组,转染24 h后荧光显微镜观察。

    质粒的制备同1.2.3。取15尾健康建鲤分为3组(n=5),在尾柄肌肉分别注射PBS、pEGFP-N1、pEGFP-ORF65,注射剂量为3 μg·尾−1 (100 μL)质粒或100 μL·尾−1 PBS,实验期间水温控制在20~25 ℃,免疫5 d,丁香酚(20 mg·L−1)麻醉后处死,去除尾柄皮肤及浅表层肌肉,进行活体成像实验,观察荧光蛋白表达。

    根据质粒大提试剂盒的说明书分别提取质粒pEGFP-ORF65、pEGFP-N1。测定浓度后,用PBS将质粒稀释至30 ng·μL−1,−20 ℃保存。取75尾健康建鲤分为3组(n=25),在尾柄肌肉分别注射pEGFP-ORF65 (DNA疫苗组)、pEGFP-N1 (空载体对照组)、PBS (空白对照组),注射剂量为3 μg·尾−1 (100 μL)质粒或100 μL·尾−1 PBS,免疫期间水温控制在20~25 ℃;免疫3次,每次间隔2周,每次免疫2周后每组随机抽取5尾鱼,丁香酚(20 mg·L−1)麻醉后尾静脉采集外周血(100 μL·尾−1),分离血清,−20 ℃保存;采血后建鲤放回原玻璃缸。

    pET32a-modORF65/BL21诱导表达后纯化重组的CyHV-3 pORF65作为包被抗原,以实验室前期制备的鼠抗鲤IgM多克隆抗体作为检测抗体,采用间接ELISA方法,检测免疫后的血清特异性抗体水平[25]

    第3次免疫2周后,在1.2.3免疫的pEGFP-ORF65组、pEGFP-N1组和PBS组中,每组分别随机选择20尾进行攻毒实验,具体方法参照文献[26]进行。攻毒实验期间,水温控制在23~25 ℃,每天记录各组死亡情况,攻毒后连续观察21 d。提取死亡建鲤的脑组织DNA作为模板,按照文献报道的方法进行CyHV-3检测[27]

    采用SPSS 13.0软件对数据进行统计分析,其中抗体水平采用t检验,攻毒保护采用χ2检验。P<0.05有显著性差异,P<0.01有极显著性差异。

    转染实验表明,重组质粒pEGFP-ORF65可以表达pORF65与增强型绿色荧光蛋白(EGFP)形成的融合蛋白,采用lip3000转染24 h后,荧光显微镜观察到CCB-J细胞生长良好(图1-a),融合蛋白在CCB-J细胞中可以表达(图1-b)。

    图  1  重组质粒pEGFP-ORF65在CCB-J细胞中的表达
    CCB-J转染细胞明场观察(a)和CCB-J转染细胞荧光观察(b);箭头表示部分表达融合蛋白的细胞
    Figure  1.  Expression of pEGFP-ORF65 fusion protein in CCB-J
    Bright field image (a) and fluorescent image (b) of pEGFP-ORF65 transfected CCB-J cells; arrows indicate parts of transfected cells.

    3组建鲤分别在尾柄肌肉注射PBS、pEGFP-N1、pEGFP-ORF65,5 d后对建鲤尾柄肌肉进行活体成像观察,由于鱼的体表鳞片及黏液会引起反光,造成假阳性,因此观察的尾柄部分去除了体表皮肤及浅表层肌肉。结果显示,PBS组的建鲤尾柄肌肉处没有绿色荧光,pEGFP-N1组和pEGFP-ORF65组的建鲤尾柄肌肉均有EGFP蛋白表达(图2)。

    图  2  重组质粒pEGFP-ORF65在建鲤尾柄中的表达
    建鲤尾柄的荧光观察(a)和建鲤尾柄的明场与荧光叠加图片(b);方框示不同实验组尾柄肌肉的绿色荧光蛋白表达情况(纵坐标示光密度值);箭头示未去除的皮肤及黏液反射激发光造成的非特异性反光
    Figure  2.  Expression of pEGFP-ORF65 fusion protein in caudal peduncle
    Fluorescent image (a) and merged image (b) of caudal peduncle after the intramuscular injections of PBS, pEGFP-N1 and pEGFP-ORF65; the box indicates the fluorescence from the caudal peduncle muscle tissue; the arrows indicate the non-specific reflected fluorescence caused by the skin and mucus.

    采用间接ELISA方法检测PBS、pEGFP-N1、pEGFP-ORF65注射免疫后的血清特异性抗体水平,结果显示,pEGFP-ORF65免疫组的血清抗CyHV-3 pORF65特异性抗体水平随着免疫次数增加逐渐升高,第2次免疫2周后特异性抗体水平显著高于PBS组与pEGFP-N1组(P<0.05);第3次免疫2周后,pEGFP-ORF65免疫组特异性抗体水平与PBS组和pEGFP-N1组存在极显著差异(P<0.01)。PBS组和pEGFP-N1组3次免疫后的抗CyHV-3 pORF65特异性抗体水平无显著性差异(图3)。

    图  3  建鲤血清抗CyHV-3 pORF65特异性抗体水平检测
    “*”或“**”表示显著性差异P<0.05或P<0.01;“ns”表示无显著性差异
    Figure  3.  Detection of anti-CyHV-3 pORF65 antibody in Jian carp serum after immunization of PBS, pEGFP-N1, pEGFP-ORF65
    The asterisks or double asterisks indicate significant difference at P<0.05 or P<0.01, respectively. "ns" indicates no significant difference.

    建鲤在第3次免疫2周后进行攻毒实验,攻毒6 d后建鲤开始死亡,攻毒15 d死亡率趋于稳定,结果显示PBS组、pEGFP-N1组和pEGFP-ORF65组分别死亡15尾、14尾和2尾,成活率分别为25%、30%和90% (图4)。χ2检验显示,与PBS或pEGFP-N1对照组相比,pEGFP-ORF65免疫后,显著提高了攻毒建鲤的成活率(P<0.01)。死亡建鲤出现肾脏病变、充血坏死等典型KHVD症状[28-29],对死亡的建鲤进行CyHV-3检测,结果均为阳性(图5)。

    图  4  CyHV-3攻毒后的免疫建鲤成活率曲线
    Figure  4.  Survival of Jian carps immunized with PBS, pEGFP-N1 and pEGFP-ORF65 post CyHV-3 infection
    图  5  CyHV-3检测结果
    M. DNA分子标准(DL2 000);1~12. 攻毒实验后部分死亡建鲤;13. CyHV-3阳性对照;14. 阴性对照
    Figure  5.  Detection of CyHV-3 DNA by PCR
    M. DNA marker (DL2 000); 1−12. parts of dead carps from the challenge test; 13. positive control; 14. negative control

    前期研究表明DNA疫苗可以在0.001 μg·尾−1或0.01 μg·尾−1的免疫剂量下为鱼苗及鱼种(体质量0.8~10 g)提供免疫保护;但是也有实验表明,低剂量DNA疫苗免疫可能无法提供有效的保护,因此实验中一般采用0.5~50 μg·尾−1的免疫剂量[19, 30];Zhou等[17-18]在CyHV-3 DNA疫苗的研究中发现1 μg·尾−1、10 μg·尾−1、50 μg·尾−1的免疫剂量并没有造成锦鲤或鲤(体质量200~300 g)特异性血清抗体水平的显著性差异。根据上述报道,本研究选择3 μg·尾−1的剂量免疫建鲤(体质量约10 g)。

    DNA疫苗的接种途径有肌肉注射、腹腔注射、口服、浸泡等方式,其中效果最好、最稳定的为肌肉注射,这成为DNA疫苗免疫的主要方式[16]。在鱼类病毒性疾病DNA疫苗研究中,单次、2次或3次免疫(多次免疫,每次间隔3周或15 d)的免疫方案均有报道,在一些研究中,加强免疫可以提高疫苗的相对保护率[16, 19]。本研究采用了3次免疫,每次间隔2周的免疫方案,结果表明,加强免疫(二免及三免后)可以显著提高建鲤血清的特异性抗体水平。

    CyHV-3 ORF25全基因序列为1 806 bp,将其中的约840 bp插入pIRES-neo真核表达载体,免疫锦鲤(3次免疫,每次间隔3周),3免2周后注射攻毒,结果表明在3个免疫剂量下(1 μg·尾−1、10 μg·尾−1、50 μg·尾−1)的锦鲤死亡率分别为20%、17.5%、12.5%,对照组死亡率在85%~92.5%[17]。CyHV-3 pORF81是第一个鉴定的CyHV-3囊膜蛋白[31],将CyHV-3 ORF81插入pIRES-neo真核表达载体,采用与上述报道类似的免疫方案,分3个剂量(1 μg·尾−1、10 μg·尾−1、50 μg·尾−1)免疫后攻毒,免疫组死亡率为17.5%、15%、15%,对照组死亡率则为87.5%~97.5%[14, 18]。本研究采用3 μg·尾−1的剂量免疫建鲤,3次免疫,每次间隔2周,3免2周后的攻毒实验表明,pEGFP-ORF65免疫组死亡率为10%,PBS组、pEGFP-N1组的死亡率分别为75%、70%。

    本研究结果表明,基于CyHV-3 ORF65构建的DNA疫苗可以诱导抗CyHV-3特异性抗体生成,为建鲤提供免疫保护,本研究为CyHV-3防控提供了一种技术手段。同时,该DNA疫苗的免疫持续期、抗体水平与免疫保护率的关系、免疫方案的优化等也值得进一步研究。

  • 图  1   毛细管电泳检测引物MiSaTPW011部分扩增产物

    绿色箭头指示20 bp align Marker和1 000 bp align Marker;M. size Marker;1~8. 大口黑鲈8个个体的毛细管电泳结果

    Figure  1.   Detection for partial PCR products of MiSaTPW011 with capillary electrophoresis

    Green arrows indicate 20 bp align Marker and 1 000 bp align Marker, respectively; M. size Marker; 1−8. output of eight M. salmoides capillary electrophoresis

    图  2   引物MiSaTPW011的3个个体的STR分型结果

    绿色阴影部分峰值对应的碱基数即为其基因型

    Figure  2.   STR typing results of three individuals of primer MiSaTPW011

    The base number corresponding to the peak value of the green shadow part represents its genotype.

    图  3   基于Nei's遗传距离构建的3个大口黑鲈群体的UPGMA聚类树

    Figure  3.   An UPGMA dendrograrn of three populations of M. salmoides based on Nei's genetic distance

    图  4   lnP(D)值随K的变化趋势图

    Figure  4.   Tendency chart of lnP(D) with change of Κ

    图  5   3个大口黑鲈群体的遗传结构图 (K=2)

    红色色块代表亚群Ⅰ;绿色色块代表亚群Ⅱ

    Figure  5.   Genetic structure map of three populations of M. salmoides (K=2)

    Red represents Cluster I; green represents Cluster II.

    表  1   大口黑鲈微卫星引物序列及退火温度

    Table  1   Primer sequences and annealing temperatures of microsatellite marker

    位点
    loci
    引物序列 (5'−3')
    primer sequence
    片段长度/bp
    size
    重复序列
    repeat sequence
    退火温度/℃
    annealingtemperature
    参考文献
    Reference
    mdo3AGGTGCTTTGCGCTACAAGT
    CTGCATGGCTGTTATGTTGG
    119~143(CA)2046.2[11]
    mdo4TCTGAACAACTGCATTTAGACTG
    CTAATCCCAGGGCAAGACTG
    151~155(CA)1148.6[11]
    mdo7TCAAACGCACCTTCACTGAC
    GTCACTCCCATCATGCTCCT
    179~205(CA)1253[11]
    lma120TGTCCACCCAAACTTAAGCC
    TAAGCCCATTCCCAATTCTCC
    204~224(GT)2860[10, 13]
    MiSaTPW011CAACATGGACGCTACTAT
    CAACCATCACATGCTTCT
    170~194(AGAT)1360[14]
    MiSaTPW038AGTCAACATTCAAACCACTTTCCCAC
    TTGTATGTTAGGATCGGCTGATTGTG
    227~312(AGAT)6+5+9+560[14]
    MiSaTPW025CCAAGGTCAGGTTTAAC
    ACCTTTGTGCTGTTCTGTC
    277~298(AGAT)1155[14]
    MiSaTPW060TATAGTTTGGTCCAGCAGGTGGCGT
    TGTGGAATGACATTTAGCCGAGGCC
    294~561(AGAT)14+10+3+2+4+9+1060[14]
    MiSaTPW116CCAAACAGCCTACAGAATGTGCCT
    AGTCCCTCGACTGAATGTGTGCAA
    191~219(AC)2155[14]
    MiSaTPW001AGTAAAGGACCACCCTTGTCCA
    GCCTGGTCATTAGGTTTCGGAG
    293~299(AC)1660[14]
    MiSaTPW058CATTCCTGAGAGACGTGGTTGCTG
    TGTGACTTGCTCTGTGAAAGGTGC
    143~169(AAGT)660[14]
    MiSaTPW154TGCGGGCTAATAGGCCTGTCTG
    GCACCACACAATCACACCTGGTAT
    182~228(AC)1855[14]
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    表  2   大口黑鲈12个微卫星位点的等位基因数、杂合度及多态信息含量

    Table  2   Number of alleles, heterozygosity and polymorphic information content of 12 microsatellite loci of M. salmoides

    位点
    locus
    等位基因数
    Na
    有效等位基因数
    Ne
    Shannon指数
    I
    观测杂合度
    Ho
    期望杂合度
    He
    多态信息含量
    PIC
    mdo3 1 1.00 0.000 0.000 0.000 0.040
    mdo4 4 1.89 0.797 0.086 0.473 0.439
    mdo7 2 1.13 0.225 0.118 0.112 0.158
    lma120 4 2.89 1.211 0.552 0.658 0.604
    MISATPW011 4 2.14 0.838 0.854 0.536 0.425
    MISATPW038 4 1.72 0.658 0.523 0.420 0.442
    MISATPW025 3 2.49 0.980 0.484 0.601 0.526
    MISATPW060 6 3.52 1.427 0.667 0.720 0.693
    MISATPW116 1 1.00 0.000 0.000 0.000 0.020
    MISATPW001 2 1.12 0.219 0.115 0.109 0.102
    MISATPW058 2 1.04 0.101 0.000 0.041 0.040
    MISATPW154 4 1.65 0.749 0.208 0.397 0.363
    平均 mean 3.08 1.80 0.600 0.301 0.339 0.321
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    表  3   3个大口黑鲈养殖群体遗传多样性

    Table  3   Genetic diversity of three populations of M. salmoides

    群体
    population
    等位基因数
    Na
    有效等位基因数
    Ne
    Shannon指数
    I
    观测杂合度
    Ho
    期望杂合度
    He
    多态信息含量
    PIC
    西樵 XJ 2.583 3 1.659 2 0.533 7 0.294 7 0.312 5 0.294 2
    沙头 ST 2.666 7 1.911 0 0.620 6 0.304 9 0.360 6 0.335 6
    烟南 YN 2.583 3 1.736 1 0.554 1 0.301 5 0.328 4 0.296 4
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    表  4   3个大口黑鲈养殖群体的遗传分化指数

    Table  4   Fixation index (FST) of three populations of M. salmoides

    西樵 XJ 沙头 ST 烟南 YN
    西樵 XJ
    沙头 ST 0.017 9
    烟南 YN 0.012 1 0.028 9
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    表  5   3个大口黑鲈养殖群体AMOVA分析

    Table  5   AMOVA analysis among three populations of M. salmoides

    变异来源
    source of variation
    自由度
    df
    平方和
    sum of squares
    方差组分
    variance component
    %
    群体间 among populations 95 192.859 0.296 76 14.17
    群体内 within populations 96 146.500 1.526 04 85.83**
    总变异 total variation 191 339.359 1.778 07
     注:**. 1 023次模拟检验后为极显著 (P<0.01)  Note: **. very significant difference after 1 023 permutation tests (P<0.01)
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    表  6   3个大口黑鲈养殖群体的遗传相似度S (对角线上) 和遗传距离Da (对角线下)

    Table  6   Genetic similarity (above diagonal) and genetic distance (below diagonal) of three populations of M. salmoides

    西樵 XJ 沙头 ST 烟南 YN
    西樵 XJ 0.982 5 0.986 4
    沙头 ST 0.017 7 0.975 4
    烟南 YN 0.013 7 0.024 9
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  • [1]

    BAI J J, LUTZ-CARRILLO D J, QUAN Y C, et al. Taxonomic status and genetic diversity of cultured largemouth bass Micropterus salmoides in China[J]. Aquaculture, 2008, 278(1/2/3/4): 27-30.

    [2] 农业部渔业局. 中国渔业统计年鉴[M]. 北京: 中国农业出版社, 2018: 25-33.
    [3]

    PRESTI F T, WASKO A P. A review of microsatellite markers and their application on genetic diversity studies in parrots[J]. Open J Genet, 2014, 4(2): 69-77. doi: 10.4236/ojgen.2014.42010

    [4] 董在杰, 刘念, 傅建军, 等. 6个野生与选育鲤群体的微卫星遗传分析[J]. 南方水产科学, 2018, 14(4): 46-55.
    [5] 张小谷, 童金苟, 熊邦喜. 微卫星标记在鱼类遗传及育种研究中的应用[J]. 农业生物技术学报, 2006, 14(1): 117-121. doi: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.01.023
    [6] 梁素娴, 孙效文, 白俊杰, 等. 微卫星标记对中国引进加州鲈养殖群体遗传多样性的分析[J]. 水生生物学报, 2008, 32(5): 694-700.
    [7] 李镕, 白俊杰, 李胜杰, 等. 大口黑鲈选育群体遗传结构的微卫星分析[J]. 广东海洋大学学报, 2010, 30(3): 11-15. doi: 10.3969/j.issn.1673-9159.2010.03.003
    [8] 樊佳佳, 白俊杰, 李胜杰, 等. 大口黑鲈微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析[J]. 水生生物学报, 2012, 36(4): 600-609.
    [9] 黄太寿, 白俊杰, 李胜杰, 等. 我国加州鲈养殖现状和绿色发展问题探讨[J]. 中国水产, 2017(12): 44-47.
    [10]

    NEFF B D, FU P, GROSS M R. Microsatellite evolution in sunfish (Centrarchidae)[J]. Can J Fish Aquat Sci, 1999, 56(7): 1198-1205. doi: 10.1139/f99-068

    [11]

    MALLOY T P, van den BUSSCHE R A, COUGHLIN W D, et al. Isolation and characterization of microsatellite loci in smallmouth bass, Micropterus dolomieu (Teleostei: Centrarchidae), and cross-species amplification in spotted bass, M. punctulatus[J]. Mol Ecol, 2000, 9(11): 1946-1948. doi: 10.1046/j.1365-294x.2000.01096-16.x

    [12]

    RICHARD M, THORPE R S. Highly polymorphic microsatellites in the lacertid Gallotia galloti from the western Canary Islands[J]. Mol Ecol, 2000, 9(11): 1919-1920. doi: 10.1046/j.1365-294x.2000.01052.x

    [13]

    LUTZ-CARRILLO D J, NICE C C, BONNER T H, et al. Admixture analysis of Florida largemouth bass and northern largemouth bass using microsatellite loci[J]. Trans Am Fish Soc, 2006, 135(3): 779-791. doi: 10.1577/T04-221.1

    [14]

    LUTZ-CARRILLO D J, HAGEN C, DUECK L A, et al. Isolation and characterization of microsatellite loci for Florida largemouth bass, Micropterus salmoides floridanus, and other micropterids[J]. Mol Ecol Resour, 2008, 8(1): 178-184. doi: 10.1111/j.1471-8286.2007.01917.x

    [15]

    TAMURA K, PETERSON D, PETERSON N, et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods[J]. Mol Biol Evol, 2011, 28(10): 2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121

    [16]

    KALINOWSKI S T, TAPER M L, MARSHALL T C. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment[J]. Mol Ecol, 2007, 16(5): 1099-1106. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03089.x

    [17]

    EXCOFFIER L, LISCHER H E. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows[J]. Mol Ecol Resour, 2010, 10(3): 564-567. doi: 10.1111/men.2010.10.issue-3

    [18]

    EVANNO G, REGNAUT S, GOUDET J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study[J]. Mol Ecol, 2005, 14(8): 2611-2620. doi: 10.1111/mec.2005.14.issue-8

    [19] 曾庆凯, 孙成飞, 董浚键, 等. 翘嘴鳜3个不同群体的遗传多样性分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2017, 36(8): 3241-3250.
    [20] 孙成飞, 叶星, 董浚键, 等. 罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析[J]. 南方水产科学, 2015, 11(2): 20-26. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2015.02.003
  • 期刊类型引用(3)

    1. 孙佳鑫,石连玉,姜晓娜,李池陶,葛彦龙,胡雪松,张晓峰,贾智英. 镜鲤抗疱疹病毒(CyHV-3)F_4抗病品系病毒表达量评估. 上海海洋大学学报. 2021(02): 258-265 . 百度学术
    2. 刘枝华,况文明,王伦,高富铭,陈松,董然然. 鲤鱼肠道中4种细菌的分离与生化鉴定. 贵州畜牧兽医. 2020(01): 45-49 . 百度学术
    3. 翁宏飚,沈卫锋,牛宝龙. 水产口服DNA疫苗研究进展. 浙江农业科学. 2020(10): 2125-2131+2135 . 百度学术

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出版历程
  • 收稿日期:  2018-09-10
  • 修回日期:  2018-10-31
  • 录用日期:  2018-12-16
  • 网络出版日期:  2018-12-19
  • 刊出日期:  2019-04-04

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