溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg17985缺失突变株的构建及该小RNA功能的初步分析

邓益琴, 陈偿, 苏友禄, 程长洪, 马红玲, 郭志勋, 冯娟

邓益琴, 陈偿, 苏友禄, 程长洪, 马红玲, 郭志勋, 冯娟. 溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg17985缺失突变株的构建及该小RNA功能的初步分析[J]. 南方水产科学, 2019, 15(1): 42-53. DOI: 10.12131/20180127
引用本文: 邓益琴, 陈偿, 苏友禄, 程长洪, 马红玲, 郭志勋, 冯娟. 溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg17985缺失突变株的构建及该小RNA功能的初步分析[J]. 南方水产科学, 2019, 15(1): 42-53. DOI: 10.12131/20180127
DENG Yiqin, CHEN Chang, SU Youlu, CEHNG Changhong, MA Hongling, GUO Zhixun, FENG Juan. Construction of knock-out mutant of sRNA srvg17985 in Vibrio alginolyticus ZJ-T and its preliminary function analysis[J]. South China Fisheries Science, 2019, 15(1): 42-53. DOI: 10.12131/20180127
Citation: DENG Yiqin, CHEN Chang, SU Youlu, CEHNG Changhong, MA Hongling, GUO Zhixun, FENG Juan. Construction of knock-out mutant of sRNA srvg17985 in Vibrio alginolyticus ZJ-T and its preliminary function analysis[J]. South China Fisheries Science, 2019, 15(1): 42-53. DOI: 10.12131/20180127

溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg17985缺失突变株的构建及该小RNA功能的初步分析

基金项目: 中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助 (2017YB27,2017YB01);联合资助开放课题基金 (2018011004);中国水产科学研究院基本科研业务费专项资金 (2017HY-ZD1007);广东省“扬帆计划”引进创新团队 (2016YT03H038);国家自然科学基金项目 (31502210)
详细信息
    作者简介:

    邓益琴(1990—),女,博士,助理研究员,从事鱼类细菌病及防治技术研究。E-mail: yiqindd@126.com

    通讯作者:

    冯 娟(1973 — ),女,博士,研究员,从事鱼类细菌病及防治技术研究。E-mail: jannyfeng@163.com

  • 中图分类号: Q 933

Construction of knock-out mutant of sRNA srvg17985 in Vibrio alginolyticus ZJ-T and its preliminary function analysis

  • 摘要:

    利用同源重组技术构建了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus) ZJ-T小RNA srvg17985的缺失突变株,并比较研究了野生株和srvg17985突变株在LBS中的生长特性、运动性、胞外蛋白酶分泌、对铁的吸收利用、对抗生素的抗性以及生长代谢等生物学特性。结果表明,小RNA srvg17985缺失后不影响溶藻弧菌在LBS中的生长、运动性、胞外蛋白酶分泌、对铁的吸收利用、对抗生素的抗性以及对测定的多数碳源、氮源的代谢;但srvg17985突变株对昆布多糖(laminarin)、果胶(pectin)以及二羟基丙酮(dihydroxyacetone)的利用增强,并转变为可利用丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)作为单一氮源。

    Abstract:

    We constructed the sRNA srvg17985 knock-out mutant in Vibrio alginolyticus ZJ-T by using homologous recombination, so as to compare the biological characteristics of growth in LBS medium, motility, extracellular protease secretion, iron utilization, antibiotic resistance and metabolism between the wild type and the mutant strains. The results show that the absence of sRNA srvg17985 did not affect the growth in LBS medium, motility, extracellular protease secretion, iron utilization, antibiotic resistance and most of the tested carbon and nitrogen sources metabolism in V. alginolyticus. However, the mutant showed better utilization of laminarin, pectin and dihydroxyaceton, and gained the ability to utilize alanine-aspartic acid (Ala-Asp) as the sole nitrogen source.

  • 蜈蚣藻属(Grateloupia)隶属于红藻门、隐丝藻目、海膜科,广泛分布于世界各地沿海地区[1]。蜈蚣藻属种类多(全世界报道91种,中国报道42种[2]),用途广泛,可食用、药用(具有清热解毒、驱虫、抗肿瘤、抗病毒、抗凝血、抗氧化等作用),并可作为提取卡拉胶的工业原料,是有待于养殖和加工开发的重要海藻[3-4]。综合了解蜈蚣藻属的研究现状,对促进该属藻类的研究、开发和利用具有重要意义。目前对其药用研究进展[5]、应用和人工养殖前景[6]已有报道,而有关其生物学和海区养殖方面的研究进展尚未见报道。

    蜈蚣藻属种类多,种类形态鉴定存在一定困难[7-8],借助分子生物学方法进行种类鉴定后,该属一些种名一直在改动。如若不关注其分类学方面的变动,可能会给养殖或加工等研究工作带来一定影响。本文综合概述了国内外关于蜈蚣藻属分类的变动、繁殖生物学、生理生态和养殖的研究现状及存在的问题,以期为蜈蚣藻属增养殖和加工开发利用提供参考。

    蜈蚣藻属传统的鉴别方法是依据藻体形态、大小、颜色、质地、分支、固着器、藻体内部结构以及生殖器官等进行种类鉴别[1, 9]。因该属种类外部形态多样,同一种类的形态会因生态环境、地域等不同而差异巨大,仅依靠传统的方法鉴定该属种类显得不足[7-8]。随着分子生物学技术的发展,藻类分类学家借助DNA条形码与传统鉴定相结合的方法进行蜈蚣藻属的种类鉴定[9-14],修正一些种名[7,15]并发布新种类[8,16-18],因此使蜈蚣藻属的分类系统处于变动、不统一状态。蜈蚣藻属分类变动中需要关注的主要是属模式种蜈蚣藻(Grateloupia filicina)和入侵物种鲂生蜈蚣藻(G. doryphora)名称的修订、蜈蚣藻属的重新划分以及中国蜈蚣藻属种类的变化。2001年,Kawaguchi等[19]对分布在亚洲东部和意大利的属模蜈蚣藻进行了形态学观察和rbcL基因序列的对比分析, 将亚洲产的蜈蚣藻定为新种亚洲蜈蚣藻(G. asiatica),此后有的学者采用亚洲蜈蚣藻来替代蜈蚣藻[20-21],有的学者仍沿用原有名称[22]。由亚洲东部被带入大西洋的入侵物种鲂生蜈蚣藻,在2002年被重新鉴定为带形蜈蚣藻(G. turuturu)[23],此后大部分文献对这一入侵物种均采用带形蜈蚣藻的名称[13-14]。1997年,Kawaguchi[24]根据形态鉴定结果建议将Pachymeniopsis并入到蜈蚣藻属,而2013年Gargiulo等[25]根据生殖器官结构以及rbcL分析,建议把蜈蚣藻属分为5个属(Grateloupia, Dermocorynus, Pachymeniopsis, PhyllymeniaPrionitis)。韩国学者Kim等[26]按照Gargiulo的建议将披针形蜈蚣藻 (G. lanceolata)改为Pachymeniopsis lanceolata,西班牙学者Montes等[13]也按照Gargiulo等的建议恢复了Pachymeniopsis属,而中国的分类学家仍沿用原来的分类系统,2015年丁兰平等[2]仍将披针形蜈蚣藻归到蜈蚣藻属[2]。《中国海藻志》记载蜈蚣藻属31种[1],随着黄海蜈蚣藻(G. huanghaiensis)等新增种类的不断发现及一些种名的修订,丁兰平等[2]报道了42种,Cao等[17-18]发现新增种类多枝蜈蚣藻(G. angusta)和异枝蜈蚣藻(G. variata),修订帚状蜈蚣藻(G. fastigiata)为亚洲蜈蚣藻[7]、修订对枝蜈蚣藻(G. didymecladia)为亚栉状蜈蚣藻(G. subpectinata) [15]

    蜈蚣藻属不同种类的生活史相同,均由双倍体的果孢子体、四分孢子体和单倍体的配子体世代交替出现,四分孢子体和配子体同型[20,27]

    蜈蚣藻属藻类的四分孢子和果孢子的萌发过程相同。不同种类孢子的萌发过程基本相同,孢子在放散附着后萌发成为基本细胞,由基本细胞分裂形成的盘状体生长萌发出直立体(幼苗)。不同种类孢子萌发过程略有不同的是从基本细胞萌发到盘状体阶段,大部分种类如大连蜈蚣藻(G. dalianensis) [27]和披针形蜈蚣藻[28]基本细胞都是原地分裂形成盘状体,但也有一些种类如亚洲蜈蚣藻[20]的基本细胞首先分裂形成丝状体再形成盘状体。细弱蜈蚣藻(G. tenuis)基本细胞的分裂则两种情况都存在[29]。带形蜈蚣藻(G. turuturu)正常萌发形成盘状体阶段没有出现丝状体,但在强光刺激下会产生丝状体 [30]

    蜈蚣藻属的种类繁多,分布广泛,因此其繁殖及生长季节也略有差异。迄今为止已报道亚栉状蜈蚣藻、椭圆蜈蚣藻(G. elliptica)、两叉蜈蚣藻(G. dichotoma)和亚洲蜈蚣藻的繁殖和生长季节[31-33]。生长在韩国东海岸的亚栉状蜈蚣藻四分孢子体生长旺季为10月和11月,而果孢子体则为9月到翌年3月,6—7月其藻体消失,8月开始形成新的直立体[31]。辽宁大连的椭圆蜈蚣藻和两叉蜈蚣藻生长盛期为6—7月,成熟期为5—8月[32];亚洲蜈蚣藻3月出现幼体,10月生物量达到最大,繁殖季节为每年的8—11月[33]。汕头南澳的舌状蜈蚣藻(G. livida)每年3—4月生物量达到最大,5—6月藻体成熟[34]

    温度和光照对蜈蚣藻属藻类生长、发育具有重要的作用,目前已报道了蜈蚣藻(按重新鉴定命名为亚洲蜈蚣藻)藻体[35]和丝状体[22]生长、带形蜈蚣藻丝状体发育成为盘状体和盘状体萌发出直立体[36]、舌状蜈蚣藻附着孢子萌发和幼苗生长[34,37]、披针形蜈蚣藻盘状体生长[28]以及大连蜈蚣藻[27]、细弱蜈蚣藻[29]和亚洲蜈蚣藻[20-21]附着孢子萌发的最适温度和光照条件(表1)。另外,也报道了带形蜈蚣藻成为外来入侵物种的优势:生长快且对温度的适应范围广,30 ℃仍可存活[38]

    表  1  蜈蚣藻属一些种类生长发育的适宜温度和光照条件
    Table  1.  Optimum temperature and light for growth and development of some species of Grateloupia
    种类
    species
    生长发育阶段
    developmental stage
    温度/℃
    temperature
    光照强度/μmol·(m2·s) −1
    light intensity
    参考文献
    Reference
    亚洲蜈蚣藻 G. asiatica 藻体 23 100 [35]
    亚洲蜈蚣藻 G. asiatica 丝状体 20 31.25 [22]
    带形蜈蚣 G. turuturu 丝状体到盘状体 25 60 [36]
    带形蜈蚣藻 G. turuturu 盘状体到直立体 20 60 [36]
    大连蜈蚣藻 G. dalianensis 附着孢子到直立体 16 93.75~125 [27]
    细弱蜈蚣藻 G. tenuis 附着孢子到直立体 24 120 [29]
    亚洲蜈蚣藻 G. asiatica 附着孢子到直立体 20~25 42~80 [20-21]
    舌状蜈蚣藻 G. livida 附着孢子到直立体 25 62.5 [34]
    舌状蜈蚣藻 G. livida 附着孢子到幼苗 18 35 [37]
    披针形蜈蚣藻 G. lanceolata 盘状体到直立体 15 80 [28]
     注:文献中光照强度单位为lx的, 根据公式1 000 lx=12.5 μmol· (m2·s) −1换算; 文献[22]和[35]中蜈蚣藻根据新的命名改为亚洲蜈蚣藻 Note: It was changed to μmol·(m2·s)−1 according to the formula 1 000 lx=12.5 μmol·(m2·s)−1 for the unit of light intensity of Reference [22], [27] and [34]. G. filicina of Reference [22] and [35] was changed to G. asiatica according to revision.
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    在研究光照对蜈蚣藻属藻类的影响时,大部分实验都将光照周期设置为12 L∶12 D,而实际上,不同种类不同生长阶段对光照周期的要求有差异,如舌状蜈蚣藻盘状体和幼苗生长最适光照周期为8~10 h[37],而蜈蚣藻(亚洲蜈蚣藻)丝状体生长最适光照周期为24 h[22]

    盐度对蜈蚣藻属的生长、发育和生理也有影响。已报道舌状蜈蚣藻果孢子放散附着的合适盐度范围为24~40[39];亚洲蜈蚣藻丝状体生长最适盐度为32[22];亚洲蜈蚣藻藻体生长和光合作用速率在盐度20时达到最大[35]

    Jiang等[40]研究了不同二氧化碳(CO2)浓度对舌状蜈蚣藻生长、光合作用和氮吸收的作用,结果表明舌状蜈蚣藻用${\rm HCO}^-_3$作为光合作用的无机碳源,过高或过低的CO2浓度均不利于生长和光合作用。

    Yokoya和Handro[41]的研究表明植物生长素2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D)或吲哚-3-乙酸和细胞分裂素6-苄氨基嘌呤混合(1∶5 mg·L–1)对两叉蜈蚣藻直立体生长具有促进作用。Garcia-Jimenez等[42]研究报道了茉莉酮酸甲酯诱导复瓦蜈蚣藻(G. imbricata)果孢子形成的分子机制。

    从20世纪80年代至今,对蜈蚣藻属一些种类的人工繁殖和养殖实验从未间断。采集孢子进行苗种培育[43]、切碎盘状体和直立体产生丝状体再由丝状体培育出苗种[44-45]、采用原生质体和愈伤组织进行苗种培育[46-47]和藻体切段作为苗种[48]的繁殖方法,在蜈蚣藻属一些种类的应用已证明可行。一些种类的养殖实验随着苗种培育的进行而开展。如右田清治[49]将蜈蚣藻(亚洲蜈蚣藻)孢子萌发成的盘状体切碎后泼洒于紫菜网和牡蛎壳上,在室内培养1个月后放于海区养殖,2个月后藻体可达15 cm;林江崑[50]把室内培养到1 cm (约2个月)的蜈蚣藻(亚洲蜈蚣藻)苗夹到绳子里吊养于海区,2个月后藻体达到上市规格(25 cm)。Iima等[44]采用同样方法进行顶状蜈蚣藻的养殖,2个月后在牡蛎壳上的藻体长度达12 cm;Huang等[47]把带形蜈蚣藻的愈伤组织切碎泼洒在紫菜网上进行苗种培养(42~56 d)后吊养于海区,5个月后藻体长度达110 cm;白凯强等[51]进行了披针形蜈蚣藻与紫贻贝的混养实验。

    从蜈蚣藻属存在的多种人工繁殖方式及一些养殖实验结果可以看出,该属藻类具有较强的繁殖生长能力,具备进行养殖的优势,但是到目前为止,中国尚未有进行规模化苗种生产与养殖的蜈蚣藻属种类。

    随着DNA条形码的应用,蜈蚣藻属的分类取得了较大进展,但由此带来了分类系统的变动,如未引起从事藻类培养、加工研究人员关注的话,则可能会影响相关文献的查询或研究成果的报道。如亚洲东部属模式种蜈蚣藻修订为亚洲蜈蚣藻,若查阅资料时仍按蜈蚣藻种名检索,则会忽略或遗漏以亚洲蜈蚣藻种名发表的相关文献,且在发表自己的研究成果时仍按蜈蚣藻这个学名而未能及时更新。另外,如不清楚在近几年发表的外国文献中已将披针形蜈蚣藻从蜈蚣藻属中移出,也可能会查漏相关的研究信息。总之,对蜈蚣藻属进行研究时应关注其多变的分类系统。

    蜈蚣藻属种类多,有些种类繁殖生长能力强且藻体大(可达1 m以上),容易形成优势种类,如带形蜈蚣藻、复瓦蜈蚣藻和披针形蜈蚣藻在南非、欧洲、北美等地被作为来自于亚洲东部的入侵物种进行研究报道[13-14,38,52]。每年2—4月,在广东汕头南澳、福建东山的养殖筏架或浮绠上附着生长大量蜈蚣藻属的种类(调查结果另文发表)。这些蜈蚣藻属种类目前未能被充分利用而造成资源浪费。蜈蚣藻属的一些种类作为食用海藻(海藻沙拉)在日本和韩国深受欢迎,但中国大部分沿海居民只把其当成药物,没有大量食用。这是其资源未被充分利用的因素之一,也是其未被规模化养殖的原因。另外,虽然对蜈蚣藻属的药用、营养成分以及提取方法已有较多的研究报道[3-4,53-54],对该属藻类加工业的发展已引起人们的关注,但因蜈蚣藻的养殖没能形成规模,仅仅依靠自然海区的资源量难以维持和促进其加工业的发展。这也是蜈蚣藻属养殖和加工开发中存在的问题。

    中国居民食用海藻以煮汤为主,但蜈蚣藻属做汤没有紫菜鲜甜,这是其未能作为食用海藻的原因之一。然而,蜈蚣藻属的舌状蜈蚣藻、披针形蜈蚣藻等制作成凉拌菜或炒菜有海带等藻类无法比拟的爽滑口感,使其在日本和韩国市场深受青睐。长茎葡萄蕨藻(海葡萄,Caulerpa lentillifera) 仅适于制作凉拌菜,20世纪70年代在日本开始养殖并广受欢迎 (中国于2006年从日本引进养殖[55])。在中国海南省有海葡萄的自然分布,却未被利用。近年在兴起海葡萄养殖热潮后,才有采集海南分布的海葡萄进行养殖实验的报道[56]。从海葡萄的事例可得到启发,蜈蚣藻属种类食用市场的拓展,应像海葡萄一样宣传推广,将蜈蚣藻属中食用口感好的种类加工成海洋蔬菜,让更多的人品尝并宣传其食用方法,拓展其消费市场,从而促进其养殖业的发展。在倡导绿色食品、发展海洋药物以及中国素食者逐年增加的新形势下,开发利用多种海藻是一种必然趋势。蜈蚣藻属种类多且用途广泛,随着该属藻类活性物质提取和食品加工研究的深入开展,对该属藻类的食用以及加工利用会逐渐增加,从而将带动该属藻类养殖和加工业的发展。

  • 图  1   srvg17985的序列信息

    下划线部分为srvg17985的序列,深灰色背景部分依次为上下游同源臂扩增的引物对

    Figure  1.   Sequence information of srvg17985

    The underlined is the sequence of srvg17985 and the dark gray background indicates the primer pairs for the amplification of two flanking fragments.

    图  2   重组自杀质粒构建和突变株筛选

    A1. 上游;A2. 下游

    Figure  2.   Construction of recombinant suicide vector and screening of mutant strain

    A1. up stream;A2. down stream

    图  3   pSW7848 PCR线性化片段 (A)、srvg17985上下游同源臂片段 (B)、重组自杀质粒的PCR鉴定扩增片段 (C) 以及srvg17985缺失株的PCR鉴定 (D)

    泳道M1. DNA Marker DL10 000;泳道1. pSW7848线性化片段;泳道M2. DNA Marker DL2 000;泳道2/3. srvg17985上/下游片段;泳道M3. DNA Marker DL10 000;泳道4. 重组子pSW7848-srvg17985检测片段;泳道M4. DNA Marker DL2 000;泳道5. 野生株ZJ-T;泳道6. srvg17985候选突变株

    Figure  3.   Linearized segment of pSW7848 (A), upstream and downstream homologous segments of srvg17985 (B), segment of identification of recombinant suicide vector by PCR (C) and identification of srvg17985 deletion mutant by PCR (D)

    Lane M1. DNA Marker DL10 000; Lane 1. linearized segment of pSW7848; Lane M2. DNA Marker DL2 000; Lane 2/3. UP/DOWN segments of srvg17985; Lane M3. DNA Marker DL10 000; Lane 4. segment of identification of the recombinant suicide vector by PCR; Lane M4. DNA Marker DL2 000; Lane 5. wild type ZJ-T; Lane 6. deletion candidate of srvg17985

    图  4   溶藻弧菌ZJ-T和ZJ-T-Δsrvg17985在LBS培养基中的生长曲线

    误差线对应于标准偏差

    Figure  4.   Growth curves of ZJ-T and ZJ-T-Δsrvg17985 in LBS medium

    Error bars correspond with standard deviations.

    图  5   溶藻弧菌ZJ-T和ZJ-T-Δsrvg17985在0.3%和1.5%琼脂LBS平板上的运动性 (A) 和统计分析 (B)

    Figure  5.   Motility of ZJ-T and ZJ-T-Δsrvg17985 on 0.3% and 1.5% LBS agar plates (A) and statistical analysis (B)

    图  6   溶藻弧菌ZJ-T和ZJ-T-Δsrvg17985在LBS+1%脱脂奶粉平板上胞外蛋白酶的分泌 (A) 和统计分析 (B)

    图A内箭头指向菌斑边缘,外箭头指向蛋白酶分泌圈边缘

    Figure  6.   Extracellular protease activities of ZJ-T and ZJ-T-Δsrvg17985 mutant on LBS agar plates containing 1% skimmed milk (A) and statistical analysis (B)

    The inner arrow points to the edge of the plaque, and the outer arrow points to the edge of the proteolytic ring in Fig. A.

    图  7   溶藻弧菌ZJ-T和ZJ-T-Δsrvg17985在LBS以及LBS添加120 μmol·L–1 DIP平板上的生长情况

    Figure  7.   Growth ability of ZJ-T and ZJ-T-Δsrvg17985 on LBS plate and LBS plate supplemented with 120 μmol·L–1 DIP

    图  8   srvg17985缺失对昆布多糖、果胶、二羟基丙酮以及丙氨酸-天冬氨酸代谢的影响

    误差线对应于标准偏差

    Figure  8.   Effect of srvg17985 deletion on metabolism of laminarin, pectin, dihydroxyacetoneor Ala-Asp

    Error bars correspond with standard deviations.

    表  1   本研究所用菌株和质粒

    Table  1   Strains and plasmids used in this study

    菌株、质粒
    strain, plasmid
    相关特征
    relevant characteristics
    来源
    source
    菌株 strains
    V. alginolyticus ZJ-T 氨苄青霉素抗性,野生菌株ZJ-51的半透明/平滑变体;
    从中国南部沿海的患病石斑鱼中分离
    参考文献[13]
    ZJ-T-Δsrvg17985 氨苄青霉素抗性;ZJ-T中缺失srvg17985 本研究
    Escherichia coli Π3813 laclQ,thi1,supE44,endA1,recA1,hsdR17,gyrA462,zei298::Tn10[Tc],ΔthyA::erm-pir116; 自杀质粒pSW7848的中间宿主 参考文献[14]
    E. coli GEB883 大肠杆菌野生株K12 ΔdapA::ermpir RP4-2 ΔrecAgyrA462,zei298::Tn10;接合作用供体菌 参考文献[15]
    质粒 plasmids
    pSW7848 氯霉素抗性;自杀质粒,R6K起点,复制需要Pir蛋白,
    具有ccdB毒性基因
    参考文献[16]
    pSW7848-Δsrvg17985 氯霉素抗性;pSW7848含有待缺失srvg17985的上下游同源臂 本研究
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    表  2   本研究所用引物

    Table  2   Primers used in this study

    引物
    primer
    序列 (5'–3')
    sequence
    pSW7848-F GTCTGATTCGTTACCAATTATGACAAC
    pSW7848-R GAATTCGATATCAAGCTTATCGATAC
    srvg17985-UP-F aagcttgatatcgaattcCGCCAAACACGCCAAACA
    srvg17985-UP-R acctcgttATTTAAAGCATGGTTCATTTTTCTCAAAAAAC
    srvg17985-DOWN-F tgctttaaatAACGAGGTAGAGGCGCAC
    srvg17985-DOWN-R ttggtaacgaatcagacGCAAATCAAATTGCAATGCGC
    Del-check-pSW7848-F TCACTGTCCCTTATTCGCACC
    Del-check-pSW7848-R CTGCTTTTGAGCACTACCCG
    Δsrvg17985-check-F CAATTCTCTCGCGTTTGGTC
    Δsrvg17985-check-R CATTGCTGACAACGTGTCTTG
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    表  3   PM02板测试组分

    Table  3   Test components of PM02 plate


    well (PM02)
    A B C D E F G H
    1 空白 N-乙酰基-D-半乳糖胺 龙胆 D-棉子糖 癸酸 D-乳酸甲酯 乙酰胺 L-鸟氨酸
    2 硫酸软骨素C N-乙酰-神经氨酸 L-葡萄糖 水杨甙 己酸 丙二酸 L-丙氨酰胺 L-苯丙氨酸
    3 α-环糊精 β-D-阿洛糖 D-乳糖醇 景天庚酮糖酐 柠康酸 6-O-(α-D-吡喃半乳糖基)-
    D-葡糖-己酸
    N-乙酰-L-谷氨酸 L-焦谷氨酸
    4 β-环糊精 苦杏仁甙 D-松三糖 L-山梨糖 D, L-柠康酸 草酸 L-精氨酸 L-缬氨酸
    5 γ-环糊精 D-阿拉伯糖 麦芽糖醇 水苏糖 D-氨基葡萄糖 草酰苹果酸 甘氨酸 D, L-肉碱
    6 糊精 D-阿拉伯糖醇 a-甲基-D-葡萄糖苷 D-塔格糖 2-羟基苯甲酸 奎尼酸 L-组氨酸 仲丁胺
    7 明胶 L-阿拉伯糖醇 β-甲基-D-半乳糖苷 松二糖 4-羟基苯甲酸 D-核糖酸-1, 4-内酯 L-高丝氨酸 D, L-章鱼胺
    8 糖原 熊果苷 3-甲基葡萄糖 木糖醇 β-羟基丁酸 癸二酸 羟基-L-脯氨酸 腐胺
    9 菊粉 2-脱氧-D-核糖 β-甲基-D-葡萄糖醛酸 N-乙酰基-D-葡糖胺醇 γ-羟基丁酸 山梨酸 L-异亮氨酸 二羟基丙酮
    10 昆布多糖 i-赤藓糖醇 α-甲基-D-甘露糖苷 γ-氨基-N-丁酸 α-酮基-戊酸 琥珀酸 L-亮氨酸 2, 3-丁二醇
    11 甘露聚糖 D-岩藻糖 β-甲基-D-木糖苷 δ-氨基戊酸 衣康酸 D-酒石酸 L-赖氨酸 2, 3-丁酮
    12 果胶 3-0-β-D-吡喃半乳糖基-
    D-阿拉伯糖
    帕拉金糖 丁酸 5-酮基-D-葡萄糖酸 L-酒石酸 L-蛋氨酸 3-羟基2-丁酮
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    表  4   PM08板测试组分

    Table  4   The test components of PM08 plate


    well (PM08)
    A B C D E F G H
    1 空白 甘氨酸-天冬氨酸 赖氨酸-甘氨酸 脯氨酸-谷氨酸 苏氨酸-苯丙氨酸 缬氨酸-丝氨酸 γ-谷氨酸-甘氨酸 甘氨酸-甘氨酸-丙氨酸
    2 L-谷氨酰胺 甘氨酸-异亮氨酸 赖氨酸-甲硫氨酸 脯氨酸-异亮氨酸 苏氨酸-丝氨酸 β-丙氨酸-丙氨酸 γ-D-谷氨酸-甘氨酸 甘氨酸-甘氨酸-D-亮氨酸
    3 丙氨酸-天冬氨酸 组氨酸-丙氨酸 甲硫氨酸-酸苏氨酸 脯氨酸-赖氨酸 色氨酸-缬氨酸 β-丙氨酸-甘氨酸 甘氨酸-D-丙氨酸 甘氨酸-甘氨酸-甘氨酸
    4 丙氨酸-谷氨酰胺 组氨酸-谷氨酸 甲硫氨酸-酪氨酸 脯氨酸-丝氨酸 酪氨酸-异亮氨酸 β-丙氨酸-组氨酸 甘氨酸-D-天冬氨酸 甘氨酸-甘氨酸-异亮氨酸
    5 丙氨酸-异亮氨酸 组氨酸-组氨酸 苯丙氨酸-天冬氨酸 脯氨酸-色氨酸 酪氨酸-缬氨酸 甲硫氨酸-β-丙氨酸 甘氨酸-D-丝氨酸 甘氨酸-甘氨酸-亮氨酸
    6 丙氨酸-甲硫氨酸 异亮氨酸-天冬酰胺 苯丙氨酸-谷氨酸 脯氨酸-缬氨酸 缬氨酸-丙氨酸 β-丙氨酸-苯丙氨酸 甘氨酸-D-苏氨酸 甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸
    7 丙氨酸-缬氨酸 异亮氨酸-亮氨酸 谷氨酰胺-谷氨酸 丝氨酸-天冬酰胺 缬氨酸-谷氨酰胺 D-丙氨酸-D-丙氨酸 甘氨酸-D-缬氨酸 缬氨酸-酪氨酸-缬氨酸
    8 天冬氨酸-丙氨酸 亮氨酸-天冬酰胺 苯丙氨酸-甲硫氨酸 丝氨酸-天冬氨酸 缬氨酸-谷氨酸 D-丙氨酸-甘氨酸 亮氨酸-β-丙氨酸 甘氨酸-苯丙氨酸-苯丙氨酸
    9 天冬氨酸-谷氨酰胺 亮氨酸-组氨酸 苯丙氨酸-酪氨酸 丝氨酸-谷氨酰胺 缬氨酸-赖氨酸 D-丙氨酸-亮氨酸 亮氨酸-D-亮氨酸 亮氨酸-甘氨酸-甘氨酸
    10 天冬氨酸-甘氨酸 亮氨酸-脯氨酸 苯丙氨酸-缬氨酸 丝氨酸-谷氨酸 缬氨酸-甲硫氨酸 D-亮氨酸-D-亮氨酸 苯丙氨酸-β-丙氨酸 亮氨酸-亮氨酸-亮氨酸
    11 谷氨酸-丙氨酸 亮氨酸-酪氨酸 脯氨酸-精氨酸 苏氨酸-天冬氨酸 缬氨酸-苯丙氨酸 D-亮氨酸-甘氨酸 丙氨酸-丙氨酸-丙氨酸 苯丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸
    12 甘氨酸-天冬酰胺 赖氨酸-天冬氨酸 脯氨酸-天冬酰胺 苏氨酸-谷氨酰胺 缬氨酸-脯氨酸 D-亮氨酸-酪氨酸 D-丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸 酪氨酸-甘氨酸-甘氨酸
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    表  5   溶藻弧菌ZJ-T和ZJ-T-Δsrvg17985对各抗生素抗性

    Table  5   Antibiotics resistance of ZJ-T and ZJ-T-Δsrvg17985

    抗生素
    antibiotic
    浓度/μg·片−1
    concentration
    抑菌圈直径/mm size of inhibition zone
    ZJ-T ZJ-T-Δsrvg17985
    林可霉素 lincomycin 2 0.00/R 0.00/R
    万古霉素 vancomycin 30 0.00/R 0.00/R
    克林霉素 clindamycin 2 0.00/R 0.00/R
    氯霉素 chloramphenicol 300 21.00±1.41/S 20.00±0.00/S
    氨苄青霉素 ampicillin 10 0.00/R 0.00/R
    苯唑西林 oxacillin 1 0.00/R 0.00/R
    哌拉西林 piperacillin 100 0.00/R 0.00/R
    卡那霉素 kanamycin 30 0.00/R 0.00/R
    青霉素-G penicillin-G 10 0.00/R 0.00/R
    头孢唑啉 cefazolin 30 11.00±1.41/R 11.00±1.41/R
    妥布霉素 tobramycin 10 12.50±0.71/I 12.67±2.31/I
    新霉素 neomycin 30 13.67±2.52/I 15.00±2.65/I
    新生霉素 novobiocin 30 21.00±5.66/S 20.50±4.95/S
    四环素 tetracycline 30 15.67±6.03/I 16.33±3.06/I
    红霉素 erythromycin 15 12.00±2.65/R 14.00±1.41/I
    麦迪霉素 medemycin 30 11.50±0.71/R 12.50±3.54/R
    多粘菌素B polymyxin B 300 12.33±2.31/S 14.00±2.83/S
    多西环素 doxycycline 30 19.50±3.54/S 20.00±2.83/S
    乙酰螺旋霉素 acetylspiramycin 30 0.00/R 0.00/R
    大观霉素 spectinomycin 100 10.33±1.53/R 11.00±1.41/R
    米诺霉素 minocycline 30 24.00±5.66/S 25.50±4.95/S
    头孢克肟 cefixime 5 10.67±1.53/R 12.00±4.24/R
    阿莫西林 amoxicillin 10 0.00/R 0.00/R
    阿奇霉素 azithromycin 15 0.00/R 0.00/R
    克拉霉素 clarithromycin 15 12.33±0.58/R 11.00±1.73/R
    罗红霉素 roxithromycin 15 11.00±1.41/R 10.67±0.58/R
    替考拉宁 teicoplanin 30 0.00/R 0.00/R
    磷霉素 fosfomycin 200 17.33±2.31/S 18.00±1.41/S
    链霉素 streptomycin 300 11.33±1.53/S 11.00±1.41/S
    庆大霉素 gentamicin 120 18.00±4.36/S 17.00±1.73/S
     注:S. 敏感;I. 中介;R. 耐药  Note: S. susceptible; I. intermediate; R. resistance to drug
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出版历程
  • 收稿日期:  2018-06-11
  • 修回日期:  2018-08-01
  • 录用日期:  2018-10-07
  • 网络出版日期:  2018-12-04
  • 刊出日期:  2019-02-04

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