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基于线粒体ND2基因序列的少鳞遗传多样性研究
郑德育, 郭易佳, 杨天燕, 高天翔, 郑瑶, 袁冬皓, 斯舒谨
2019, 15(5): 84-91. doi: 10.12131/20190042
以莱州、胶南、舟山、厦门、汕头和北海6个群体119尾少鳞 (Sillago japonica)为研究对象,采用PCR扩增测序获得长度为450 bp的线粒体DNA NADH脱氢酶亚基2 (ND2)基因片段,共检测到77个变异位点,其中简约信息位点30个,单变异位点28个,无碱基缺失。119条序列定义了61个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.945 3±0.015 5和0.009 718±0.005 445。6个群体间的平均遗传距离为0.008 3,遗传分化指数FST均小于0.05,各群体间无显著遗传分化。AMOVA分析得出少鳞的遗传变异主要来自于种群内个体间(99.96%)。中性检验的Tajima's D和Fu's Fs统计值均为负值且显著偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明少鳞历史上经历了群体扩张事件,估算扩张时间大约在 (0.12~0.29)百万年前的第四纪更新世晚期。
关键词: 少鳞鱚, ND2基因, 遗传多样性, 群体扩张