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黄鳝生长差异基因发掘及其调控机制初步研究
霍欢欢, 刘瑜, 周秋白, 郭枫, 隗黎丽, 彭墨, 张燕萍, 陈文静
2020, 16(1): 1-8. doi: 10.12131/20190176
为揭示黄鳝 (Monopterus albus) 生长相关基因的调控机制,对相同亲本具有显著性生长差异的黄鳝肝脏进行了转录组测序分析。结果显示,转录组测序共得到19 149个基因,其中差异基因598个,差异基因中有303个基因显著上调,295个显著下调。KEGG通路分析发现,598个差异基因分属262条通路中,其中有38条通路显著富集。GO功能注释发现,与生长相关的差异基因有7个,分别为col1α1、nkx6.1、nnosplexina4、igfbp1、pcgf1和h3.3,这些基因表达水平的变化可能对黄鳝神经、内分泌和消化系统的发育及生理活动产生了调节作用从而影响了黄鳝的生长。结合KEGG通路分析发现,col1α1所在的利什曼病通路和nnos所在的精氨酸和脯氨酸代谢通路富集显著,说明其对黄鳝生长具有重要调节作用。
关键词: 黄鳝, 转录组测序, 生长差异基因