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2016年  12卷  第5期

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2016, 12(5): 0-0.
摘要:
研究论文
基于支持向量机的西北太平洋柔鱼渔场预报模型构建
崔雪森, 唐峰华, 周为峰, 吴祖立, 杨胜龙, 化成君
2016, 12(5): 1-7. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.001
摘要:
柔鱼(Ommastrephes bartramii)是中国在西北太平洋主要的鱿钓捕捞对象。准确预报柔鱼渔场, 对减少寻鱼时间、节省油料和提高渔获产量均有积极的意义。该研究将2002年~2012年中国在西北太平洋鱿钓产量数据、渔场时空数据以及海表温度、叶绿素a浓度、表温梯度强度和叶绿素梯度强度等海洋环境因子作为训练数据, 基于支持向量机(support vector machine, SVM)的方法, 建立了以月为时间分辨率、0.50.5为空间分辨率的西北太平洋柔鱼渔场的预报模型。该模型以径向基函数(RBF)为核函数, 利用10 折交叉验证和网格选优法, 确定了最优惩罚项因子和核函数参数值的组合(C, ) , 分别为1.41 和2.83, 样本分类精度达73.6%。利用2013年7月~11月环境数据, 对模型进行了精度检验, 预报准确率为53.4%~60.0% , 平均准确率为57.4% 。研究认为, 在训练数据不够充分的条件下, SVM模型可成为西北太平洋柔鱼渔场预报的一个有效手段。
基于SELECT模型的南海金线鱼刺网选择性研究
杨炳忠, 张鹏, 谭永光, 晏磊, 陈森, 李杰, 杨吝
2016, 12(5): 8-15. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.002
摘要:
为研究流刺网网目尺寸对金线鱼(Nemipterus virgatus)的选择性, 2008年5月于南海北部渔场用网目尺寸分别为40 mm、45 mm、50 mm、55 mm和60 mm的刺网进行了共同捕捞试验。在SELECT(Share Each LEngthclasss Catch Total)模型的架构下, 用Normal、Gama 和Bi-normal概率模型拟合刺网对金线鱼的选择性, 根据赤池信息指数(Akaike's Information Criterion, AIC)值评价并选出最佳拟合模型。结果表明, 试验共捕获金线鱼185尾, 金线鱼众数体长随网目尺寸的增加而增大; Gama的估计分隔模型AIC值在所有模型中最小(466.55), 将其作为最佳拟合模型; 刺网对金线鱼的相对作业强度(Pi)大小顺序依次为40 mm60 mm55 mm45 mm50mm; 40 mm、45 mm、50 mm、55 mm和60 mm刺网对体长150 mm金线鱼的选择率分别为98.39% 、80.94% 、39.30% 、13.70% 和3.87%。该研究认为将50 mm作为金线鱼刺网的最小网目尺寸不足以达到保护渔业资源的目的, 建议将南海区金线鱼刺网最小网目尺寸增加到55 mm。
基于不同配重的罩网沉降性能研究
李杰, 晏磊, 陈森, 杨炳忠, 张鹏
2016, 12(5): 16-22. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.003
摘要:
2015年3月于南海南沙海域进行了1 515 kg、1 615 kg、1 715 kg和1 815 kg等4组不同沉力配重下罩网沉降性能的对比试验。结果发现:1)多元回归分析表明网口最大沉降深度D与配重W、放网时间Ts、绞收时间Th及风速Sw成正相关,与漂移速度Sd呈负相关;2)偏相关系数分析显示,配重的相对重要性大于放网时间,且放网时间过长不利于网口迅速闭合,故认为增加配重是比延长放网时间更加实用有效的增大网口沉降深度的方法;3)随配重的增加,网口最大沉降深度的平均值依次为77.5 m、81.5 m、83.7 m和 97.9 m,网口沉降速度的平均值依次为0.303 ms-1、0.318 ms-1、0.342 ms-1和0.349 ms-1, 两者均随配重的增大而增加,且单因素方差分析发现两者在不同配重组间均存在显著性差异;4)认为1 715 kg为试验罩网的最优配重。
南澳岛北部海域浮游动物生态学特征及水团影响
王亮根, 杜飞雁, 陈丕茂, 李亚芳, 宁加佳
2016, 12(5): 23-33. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.004
摘要:
根据2011年~2012年南澳岛北部海域4 个季节的调查资料, 对该海域浮游动物的种类组成、生态类群、栖息密度、生物量和多样性指数等生态学特征进行了分析, 并探讨了水团变化对浮游动物分布的影响。研究海域内共鉴定出浮游动物150 种。浮游动物生态类群以暖水沿岸种、暖水外海种和暖水广盐种3个类群为主, 群落组成具有明显的季节变化。浮游动物密度年均值为144.67个m-3, 季节变化呈双峰型, 生物量年均值为98.67 mgm-3, 季节变化呈单峰型。海区内浮游动物优势种以近岸种为主, 其中, 瘦尾胸刺水蚤( Centropages tenuiremis)是唯一全年优势种。生物多样性指数以夏季最高, 冬季最低。浮游动物生态特征呈现典型的亚热带海湾生态学特性, 其变化规律与该海区外海暖水、闽浙沿岸流以及径流冲淡水等水团的季节性消长相关, 尤其是近岸径流。
溶藻菌A2对4种微藻的溶藻效果分析
郗建云, 曹煜成, 李卓佳, 文国樑, 徐武杰, 郑奇宏, 李振成, 许云娜
2016, 12(5): 34-42. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.005
摘要:
将溶藻菌菌株A2以初始浓度107CFUmL-1接入到锥状斯氏藻(Scrippsiella trochoidea) 、条纹小环藻(Cyclotella striata)、蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)和四尾栅藻( Scenedesmus quadricauda) 的纯培养与混合培养藻液中, 研究A2对不同微藻的溶藻专一性, 并通过16S rDNA 序列分析对A2 菌株进行菌株鉴定。结果表明, 经16S rDNA鉴定, 菌株A2 属于海杆菌属( Marinobacter sp.); 在微藻纯培养与混合培养环境下, A2皆可有效溶解甲藻类的锥状斯氏藻, 对硅藻类的条纹小环藻具有一定的溶解效果, 对绿藻类的四尾栅藻生长无影响, 可以促进绿藻类蛋白核小球藻的生长。在多种微藻共存环境下, A2菌组锥状斯氏藻死亡率可高达98.29%和95.37%, 蛋白核小球藻的浓度较对照组提高237.6% 。结果表明, 菌株A2具有良好的溶藻专一性, 可作为研发养殖池塘甲藻调控剂的备选菌株。
海水环境中Hg2+、Cd2+、Pb2+ 对张氏马尾藻幼孢子体的生物毒性研究
欧泽奎, 刘东超, 谢恩义, 冯暖怡, 和秀
2016, 12(5): 43-52. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.006
摘要:
研究了含不同浓度汞离子(Hg2+)、镉离子(Cd2+)、铅离子(Pb2+)的自然海水对张氏马尾藻( Sargassum zhangii Tseng et Lu)幼孢子体的生物毒性。单因子实验结果表明, 当海水中Hg2+、Cd2+、Pb2+的浓度范围分别为0.04~1 molL-1 、0.04~25 molL-1和0.04~25 molL-1时, Hg2+ 、Cd2+ 、Pb2+ 对幼孢子体的生物毒性均随离子浓度的升高而显著增强, 且随胁迫时间延长而累积; 3种重金属离子对幼孢子体的生物毒性大小顺序为Hg2+Cd2+Pb2+。正交实验结果表明, 当Hg2+、Cd2+、Pb2+分别以浓度0.08 molL-1、2.8 molL-1、3 molL-1共存时, 对幼孢子体的毒性最强; 当Hg2+、Cd2+、Pb2+同时处于低浓度水平时, Pb2+对幼孢子体的生长产生主导抑制效应, Cd2+其次; 相反, 当各重金属离子同时处于高浓度水平时,Hg2+对幼孢子体的生长产生主导抑制效应, Cd2+其次; 当Hg2+、Cd2+、Pb2+联合作用时,Hg2+、Cd2+呈现协同效应, Hg2+、Cd2+对Pb2+产生拮抗效应。建议在张氏马尾藻育苗过程中将海水中的Hg2+、Cd2+、Pb2+浓度严格控制在0.04 molL-1以下, 尤其要避免3种重金属离子的联合毒害。
中国南海康氏马鲛线粒体COI序列遗传变异分析
曹艳, 章群, 宫亚运, 吕金磊, 杨喜书
2016, 12(5): 53-60. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.007
摘要:
在测定的采自广东饶平、阳江和广西东兴海域的62尾康氏马鲛( Scomberomorus commerson) 线粒体COI基因711 bp序列中,共检测到26个变异位点,18个单倍型,总体呈现出高单倍型多样性( Hd=0.8080.040)和低核苷酸多样性(=0.004 00.000 6)的特点。邻接树上出现了3个分支, 分支间Fst为0.811~0.833且P0.001,Nm为0.1~0.117;AMOVA分析显示分支间遗传变异占82.61%。表明3个分支间分化程度高,推测分歧时间为(89~22.67)万年前中更新世时期,可能原因是受到更新世冰期和间冰期交替的影响。但分支内与分支间都有不同地理来源的个体,没有出现明显的地理聚群;不同地理群体间Fst为-0.027~0.066,Nm均大于4或小于0;群体内个体间变异为96.34%。均表明群体间基因交流频繁,遗传分化程度并不高。3个分支中Clade A分支经历过种群快速扩张事件,可能是末次冰期期间康氏马鲛进入外海并受洋流及生存空间改变的影响。
斑节对虾GRP94基因的克隆及其在不同应激条件下的表达与分析
史进选, 傅明骏, 赵超, 周发林, 杨其彬, 邱丽华
2016, 12(5): 61-70. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.008
摘要:
以斑节对虾(Penaeus monodon)为研究对象, 利用RACE 技术克隆得到了斑节对虾PmGRP94基因cDNA全长, 并对其结构进行生物信息学分析。PmGRP94全长2 990 bp, 包括75 bp的5UTR、527 bp的3UTR和2 388 bp的ORF。利用实时定量PCR技术, 对PmGRP94组织特异性及其在不同pH、盐度和3种重金属应激下转录水平变化情况及特点进行了研究。结果显示, PmGRP94基因存在组织特异性, 并在肝胰腺中的表达量最高; 不同的应激条件下其表达具有明显差异, 其中在pH、铜(Cu)和锌(Zn)的应激下PmGRP94的表达显著升高。因此预测该基因可以作为斑节对虾受pH、Cu和Zn胁迫的指示基因。
企鹅珍珠贝早期养殖生长性状的增长规律及生长曲线拟合研究
郭华阳, 李有宁, 张楠, 朱克诚, 王雨, 张殿昌
2016, 12(5): 71-80. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.009
摘要:
该研究对海南新村港养殖17个月的企鹅珍珠贝(Pteria penguin)苗种生长性状进行测量,利用von Bertalanffy、Gompertz 和Logistic 3种生长模型对其生长性状的增长规律进行拟合, 通过Levenberg-Marquardt 迭代法求出各模型中3个生长参数,综合各参数的最优值,得出不同生长性状拟合效果最佳的生长模型。结果表明,Gompertz模型为企鹅珍珠贝各生长性状的最优生长模型。根据生长参数得出壳长、壳高、壳宽和体质量的生长极限值分别为93.519 mm、90.641 mm、39.075 mm和157.755 g, 生长拐点分别为2.86个月、4.04个月、5.63个月和9.61个月;各生长性状间的绝对生长速度在不同生长期内差异较大,但随着月龄的增大均呈现先增加后降低的趋势;性状间相对生长速度存在差异并随月龄的增长逐渐趋于0。研究结果可为企鹅珍珠贝的养殖生态研究、遗传育种及插核育珠提供理论依据和参考资料。
企鹅珍珠贝GLUT1 基因全长cDNA 克隆及其对葡萄糖的表达响应
邱萤, 黄桂菊, 刘宝锁, 范嗣刚, 李有宁, 陈明强, 喻达辉
2016, 12(5): 81-89. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.010
摘要:
葡萄糖转运蛋白(GLUTs)是能量代谢的关键因子,为了探索GLUT1(glucose transporter type1)在企鹅珍珠贝(Pteria penguin)中的功能,开展了企鹅珍珠贝GLUT1基因的克隆与功能研究。利用RACE技术克隆出企鹅珍珠贝GLUT1基因,并命名为PpGLUT1。该基因cDNA全长为2 068 bp,编码522 个氨基酸,有2个跨膜螺旋区,N端和C端都在胞质侧,分子量为57.226 4 kD,理论等电点为5.17。不同组织荧光定量结果表明,在肠和外套膜中表达量最高,闭壳肌中的表达量显著低于其他组织。0.5 gmL- 1的高质量浓度葡萄糖注射实验表明,在注射后30 min内,肠PpGLUT1表达量升高,在30 min之后表达量逐渐降低,注射后第2小时表达量最低。不同浓度葡萄糖注射实验表明,当葡萄糖质量浓度为0.1~0.4 gmL-1时,PpGLUT1表达量逐渐上升;质量浓度为0.4 gmL-1 时,PpGLUT1表达量最高;大于0.4 gmL-1之后,表达量逐渐降低。上述结果表明,企鹅珍珠贝PpGLUT1主要在肠和外套膜表达, 并对葡萄糖注射有表达响应,可能在上述组织的葡萄糖转运过程中发挥作用。
合浦珠母贝选育家系的遗传多样性分析
范嗣刚, 王婧璇, 黄桂菊, 刘宝锁, 郭奕惠, 喻达辉1
2016, 12(5): 90-96. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.011
摘要:
该研究选取具有多态性的6对微卫星引物对构建的2批合浦珠母贝(Pinctada fucata)完全双列杂交家系的遗传多样性进行了分析。6个微卫星标记在9个家系360个个体中共检测到32个等位基因, 有效等位基因(Ne)为1.758 7~3.586 5, 观测杂合度(Ho)为0.144 4~0.488 9, 期望杂合度(He)为0.432 0~0.722 2, Shannon 指数(I)为0.691 9~1.507 4。9个家系都有单态位点, 平均Ho为0.129 2~0.466 7, 平均He为0.155 0~0.439 6,平均I为0.248 5~0.712 2。有19个位点(占35.19% )极显著地偏离Hardy-Weinberg平衡。各家系之间的遗传距离为0.109 0~1.137 2, 遗传相似性系数为0.320 7~0.896 8。家系L4B46与L4B48的遗传距离最大, 与D3D313的遗传距离最小。UPGMA法聚类分析显示, 9个家系分为3 支, L4B48 单独成一支, B4D426、B4D427 与D4B445聚成一支, 其余家系聚成一支。该研究结果为合浦珠母贝家系选择育种的亲本选择与交配设计提供了科学依据。
草鱼Stefin 克隆表达、纯化及活性特征鉴定
陈治光, 李冉, 李树蕾, 杨立彬, 蒋然然, 钟海霞, 陈恩1, 蒋光阳1, 李树红
2016, 12(5): 97-104. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.012
摘要:
文章克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus) Stefin cDNA 全长序列, 全长294 bp, 编码97个氨基酸, 无二硫键, N端存在高度保守的Gly(3、4)残基及QXVXG(45~49)序列, 比对结果显示其氨基酸序列与Burtons mouthbrooder (Haplochromis burtoni) Stefin A1一致性最高, 为47.5% 。进化树分析表明草鱼Stefin A与Burtons mouthbrooder (Haplochromis burtoni) 、southern platyfish (Xiphophorus maculatus) 、Colisa chuna (Trichogaster chuna) 、lamprologini (Neolamprologus brichard) 、elephant shark (Callorhinchus milii) 及bicolor damselfish (Stegastes partitus) Stefin A 聚为一类。将构建的原核表达载体Stefin-Pet30a转入E.coli BL21, 以1 molL-1 IPTG 诱导表达重组Stefin 蛋白, 而后经梯度尿素洗涤和镍亲和层析纯化, 并分别利用SDS-PAGE 和TSK-GEL G2000SWxl 高效液相色谱检测诱导及纯化效果, SDS-PAGE 结果显示重组Stefin 蛋白得到高度纯化, 最终呈现相对分子量11.4 kD的单一条带; 其在高效液相上保留时间25.98 min处亦呈单一活性峰, 纯度为96.28% 。以荧光合成肽底物(Z-Phe-Arg-MCA)测活法鉴定重组草鱼Stefin对鲤鱼组织蛋白酶B、L的抑制活性, 发现该重组蛋白对二者均体现了明显的抑制活性。
鸢乌贼酶解产物的抗氧化稳定性与功能特性
吴静, 胡晓, 杨贤庆, 李来好, 姚建玲, 吴燕燕, 林婉玲, 仇超颖, 黄卉, 马海霞
2016, 12(5): 105-111. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.013
摘要:
以鸢乌贼(Symplectoteuthis oualaniensis)胴体为原料, 采用木瓜蛋白酶进行酶解, 比较了酶解液中不同分子量组分的抗氧化特性, 探讨了温度、pH和光照对其抗氧化活性的影响, 以及其功能特性(包括乳化性和乳化稳定性、起泡性和泡沫稳定性、吸水性、持水性和吸油性等)。结果表明, 鸢乌贼酶解产物具有一定的耐热性, 在酸性偏中性的环境中能较好地保持其抗氧化活性, 日光照射会降低其抗氧化能力。此外, 酶解产物还具有较强的乳化性、起泡性、吸水吸油能力等功能特性。
条石鲷早期鳞被的形成和初生鳞的发育
区又君, 李加儿, 艾丽, 王雯, 李刘冬
2016, 12(5): 112-117. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.014
摘要:
采用茜素红染色法对条石鲷(Oplegnathus fasciatus)早期发育阶段鳞片的形成和发育过程进行了观察和测量。结果显示条石鲷鳞片的起始中心有3个,分别是鳃盖后缘、侧线上方和尾柄处。在水温为24~27 ℃的人工培育条件下,20日龄在这3个起始中心最早出现鳞片,鳃盖后缘至胸鳍基部的鳞被向上下前后扩展,胸鳍后缘的侧线上方鳞被向下和向前后扩展,尾柄处的鳞被前后扩展,头顶部的鳞被向四周扩展,到40日龄时鱼体全身被鳞进入幼鱼期。通过观察还发现,鳞片向下方发育的速度快于上 方,上下方向的发育速度快于前后方向。向前扩展到鳃盖后暂停,向后发育到达尾柄末端,最后出现鳞片的部位是鳃盖。条石鲷鳞片为栉鳞,较细小。在鱼体的同一时期同一部位,鳞片的大小存在较大的差异。初生鳞鳞嵴(环片)数目与发育阶段的关系可用二次方程表示。
研究简报
合浦珠母贝4 种壳色选育系主要性状的比较分析
陈明强, 刘宝锁, 严俊贤, 郭华阳, 吴开畅, 李有宁
2016, 12(5): 118-122. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.015
摘要:
为评估合浦珠母贝(Pinctada fucata)白壳、黑壳、红壳和金壳色选育系F6代的育种性能,对养殖达18个月龄4种壳色合浦珠母贝的形态、质量、闭壳肌拉力和抗才女虫寄生病等12个性状指标进行了方差分析和多重比较。结果显示,4种壳色选育系间壳高、绞合线长、壳宽、体质量、壳质量、软体部质量、闭壳肌质量、闭壳肌拉力、右壳感染率和贝壳感染率均存在显著差异(P0.05)。综合相关分析表明,白壳色选育系可作为壳高和低才女虫感染率同时选育的最优育种群体,金壳色选育系可作为壳宽、体质量和闭壳肌拉力复合选育的最优育种群体。该研究结果为开展合浦珠母贝多性状复合选择育种工作提供了科学根据。
南太平洋长鳍金枪鱼垂直活动水层空间分析
郭刚刚, 张胜茂, 樊伟, 陈新军, 杨胜龙
2016, 12(5): 123-130. doi: 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.016
摘要:
为了解南太平洋长鳍金枪鱼(Thunnus alalunga)的垂直活动水层分布特征及其适宜的垂直活动水层深度,采用Argo 数据重构了研究海域次表层20 ℃和25 ℃等温线深度场, 并结合2010年~2012年中水集团南太平洋长鳍金枪鱼延绳钓渔船实际生产统计数据, 绘制了20 ℃和25 ℃等温线深度与长鳍金枪鱼单位捕捞努力量渔获量(CPUE) 叠加图, 分析南太平洋长鳍金枪鱼的垂直活动水层分布特征。结果表明, 研究海域20 ℃和25 ℃等温线深度存在明显的季节性变化, 且长鳍金枪鱼渔场时空分布随着20℃等温线深度的220 m等深线和25℃等温线深度的140 m等深线时空变动而季节性南北移动。长鳍金枪鱼中心渔场主要分布于10S 以南、160E~175E之间, 中心渔场所处海域, 其20 ℃等温线深度多在220 m以深, 超过250 m的海域CPUE 均偏低; 25 ℃等温线深度多在140 m以浅, 浅于80 m的海域则难以形成中心渔场。采用频次分析与经验累积分布函数( ECDF) 相结合的方法, 计算出南太平洋长鳍金枪鱼适宜的垂直活动水层深度为88~238 m。文章初步得出了南太平洋长鳍金枪鱼的垂直分布特征及其适宜的垂直活动水层深度, 可用于指导延绳钓投钩深度, 为中国南太平洋长鳍金枪鱼延绳钓生产作业提供理论参考。